土壤微生物削弱了水生-陆地系统补贴对植物生长的正向影响

土壤微生物削弱了水生-陆地系统补贴对植物生长的正向影响 水生-陆地系统补贴形成的联结作用在构建群落和调节生态系统功能方面发挥重要作用。在营养贫瘠的生态系统中(例如密歇根湖周围的淡水沙丘),水生-陆生系统补贴显得尤为重要。春季成年蠓在密歇根湖涌出,成群交配,然后死亡。蠓尸体在植物的基部形成土丘状,通过输入营养提高植物的生产力。然而,水生-陆地系统补贴对植物生产力的影响可能取决于其他生物的交互作用,特别是土壤微生物可能通过促进养分转化为植物可利用的形式或与植物竞争养分而发挥关键作用。在温室实验中,我们检验了湖生蠓(Chironomidae)的尸体和土壤微生物如何独立和相互影响一种常见沙丘草(沙拂子茅,Calamovilfa longifolia)的生长表现。为确定蠓是否影响土壤非生物特性,我们检验了添加蠓如何影响土壤养分和土壤湿度。研究结果显示,蠓极大地增加了植物生物量,但其效应的大小受土壤微生物的影响。在没有土壤微生物的情况下,添加蠓的植物生物量比没有添加的高7倍,而在有土壤微生物的情况下,植物生物量提高了3倍。蠓对植物生长的促进作用可能由于它们向土壤中输入养分所导致,因为与沙丘土壤相比,蠓的氮、磷、钾含量分别高100倍、10倍和150倍。我们的研究结果表明,土壤微生物可能与植物竞争这些养分。总之,我们发现蠓是重要的水生-陆地系统补贴,对密歇根湖沿岸植物生产力产生强烈和正向的影响,但水生-陆地系统补贴作用必须在生态群落内发生的复杂相互作用的背景下考虑。     

云南干巴菌子实体内可培养微生物

【背景】微生物在菌根真菌的孢子萌发、菌丝体生长、菌根形成以及子实体发育等过程中起到一定作用。【目的】对采自云南省昆明市嵩明县和楚雄彝族自治州禄丰县的8个干巴菌子实体内的微生物进行分离培养鉴定,为后期研究微生物与干巴菌之间的相互作用奠定基础。【方法】采用传统平板分离法从干巴菌子实体内分离获得微生物群落,t检验分析不同地区采集的干巴菌子实体内微生物菌落总数的差异,16S r RNA基因和ITS序列进行系统发育树构建和微生物多样性分析。【结果】采自嵩明县和禄丰县的8个干巴菌子实体内共分离获得282株可培养的细菌,两个地区的细菌菌落总数无显著差异(P=0.22)。所有细菌分属2门12属15种。其中80%的细菌属于变形菌门,且以γ-变形菌为优势菌群,假单胞菌属(Pseudomonas)为优势菌属。其余20%的细菌属于拟杆菌门。从干巴菌子实体中分离获得114株真菌,两个地区的真菌菌落总数无显著差异(P=0.65)。所有真菌分属2门10属10种。其中62%的真菌属于子囊菌门(Ascomycota),并以分离自禄丰县干巴菌子实体内的Lophiostoma为优势属。38%的真菌属于担子菌门(Basidiomycota),并以Asterotremella为优势属。【结论】两个不同地区采集的干巴菌子实体内细菌和真菌在菌落总数上无显著差异。所有细菌都以γ-变形菌为优势菌群,假单胞菌属为优势菌属。嵩明干巴菌子实体内真菌以担子菌门为优势菌群,Asterotremella为优势属。而禄丰干巴菌子实体内真菌则以子囊菌门为优势菌群,Lophiostoma为优势属。     

动物及其肠道菌群的协同进化研究

动物自身合成一些关键营养物质的能力缺失,转而依赖体内的共生物来完成相应功能,如动物体内共生细菌能帮助宿主从食物中提取营养物质,并能合成一些关键代谢反应的化合物。结合国内外在动物及其肠道菌群的协同进化的研究进展,从三个方面进行了归纳:(1)动物及其肠道微生物组成与功能的协同进化研究;(2)动物行为与肠道微生物的关系;(3)共生肠道微生物在人类或动物自身消化食物、营养获取、健康和疾病方面发挥的重要作用。     

微生物耐砷机理及其在砷地球化学循环中的作用北大核心CSCD

砷是一种无处不在的有毒类金属,其强致癌性引起了人类的广泛关注。在自然环境中,砷的转化存在物理化学过程和生物过程,其中微生物介导的砷转化是环境砷行为的主要影响因素。微生物的耐砷特性与砷吸收、氧化还原、甲基化、区隔化和外排等过程密切相关。砷在微生物体内的转运转化主要与砷解毒有关,但某些微生物可利用氧化还原过程产生的能量以维持其生长需求。本文综述了微生物介导的砷吸收、转化、区隔化和外排机制,这对阐明砷的地球化学循环过程及指导砷污染土壤和水体修复、阻控农作物砷吸收等方面具有重要意义。     

根分泌物及其生态效应

根分泌物是个古老而年轻的研究领域。早在18,19世纪,人们(Plenk,1795;Decandolle,1830)就观察到根分泌物对邻近植株的促生和抑制作用,1904年Hilter提出“根际”的概念,标志着人们对根分泌物及其生态效应的进一步认识。此后人们对根分泌物研究逐步展开。Lyon和Willson(1920)发现,生长于无菌水培液中的植物能释放有机物,为深入研究奠定了基础。但很长一段时间这个研究领域一     

瘤胃微生物在有机废物处理中的应用研究

综述了瘤胃微生物在处理农业残余废物、城市有机垃圾和一些有毒物质方面的研究情况,并对影响其降解的环境条件、工艺条件和反应促进因素做了介绍,认为结合现代厌氧消化技术和瘤胃发酵技术,瘤胃微生物可以在有机废物处理中发挥较大作用.     

解磷微生物的研究进展

磷是植物生长必需的矿质元素之一,而土壤中可溶性磷的含量比较低。土壤中有大量的微生物存在,其中有一些微生物能够将土壤中的不溶性磷转化成可溶性磷,主要对解磷微生物的种类、数量、分布、解磷机制及应用方面的有关情况进行综述。     

猪源乳酸菌产乳酸及其抑菌特性研究

研究了5株(L1、12、L3、L5和L7)分离自仔猪肠道的乳酸菌的产乳酸能力及抑菌特性。结果表明：L5菌株产乳酸的速度最快,培养液中乳酸含量最高,L5菌株培养液pH值的下降速度最快,终末pH值最低,而L1菌株产乳酸的速度最慢,培养液乳酸含量最低。5株乳酸菌对大肠杆菌K88、K99、987P、O141和大肠杆菌E1及金黄色葡萄球菌均有不同程度的抑制作用;排除酸的影响后仍有22％～53％抑菌效果;经热处理后保持有92％以上的抑菌效果;蛋白酶处理后保持85％以上的抑菌效果。     

Dietary Mannan-oligosaccharides potentiate the beneficial effects of Bifidobacterium bifidum in broiler chicken

This study investigated the effects of dietary Bifidobacterium bifidum (BFD) and mannan-oligosaccharide (MOS), as a synbiotic, on the production performance, gut microbiology, serum biochemistry, antioxidant profile and health indices of broiler chicken. Six dietary treatments were T1 (negative control), T2 (positive control-20 mg antibiotic BMD kg⁻¹ diet; BMD: bacitracin methylene disalicylate), T3 (0·1% MOS + 10⁶ CFU BFD per g feed), T4 (0·1% MOS + 10⁷ CFU BFD per g feed), T5 (0·2% MOS + 10⁶ CFU BFD per g feed) and T6 (0·2% MOS + 10⁷ CFU BFD per g feed). Significantly (P < 0·01) better growth performance and efficiency was observed in birds supplemented with 0·2% MOS along with 10⁶ CFU BFD per g of feed compared to BMD and control birds. Supplementation with 0·2% MOS along with either 10⁶ or 10⁷ CFU BFD per g feed reduced (P < 0·01) the gut coliform, Escherichia coli, total plate count, and Clostridium perfringens count and increased the Lactobacillus and Bifidobacterium count. Significantly (P < 0·01) higher serum and liver antioxidant enzyme pool, serum HDL cholesterol and lower serum glucose, triglyceride, total cholesterol, cardiac risk ratio, atherogenic coefficient and atherogenic index of plasma were observed in birds supplemented with 0·2% MOS along with 10⁶ CFU BFD per g of feed compared to control or BMD supplemented birds. Better production performance, gut microbial composition, serum biochemistry, antioxidant profile and health indices were depicted by broiler chicken supplemented with 0·2% MOS and 10⁶ CFU BFD per g of feed.     

MicroPhenoDB Associates Metagenomic Datawith Pathogenic Microbes,Microbial Core Genes,and Human Disease Phenotypes

Microbes play important roles in human health and disease. The interaction between microbes and hosts is a reciprocal relationship, which remains largely under-explored. Current computational resources lack manually and consistently curated data to connect metagenomic data to pathogenic microbes, microbial core genes, and disease phenotypes. We developed the MicroPhenoDB database by manually curating and consistently integrating microbe-disease association data. MicroPhenoDB provides 5677 non-redundant associations between 1781 microbes and 542 human disease phenotypes across more than 22 human body sites. MicroPhenoDB also provides 696,934 relationships between 27,277 unique clade-specific core genes and 685 microbes. Disease phenotypes are classified and described using the Experimental Factor Ontology (EFO). A refined score model was developed to prioritize the associations based on evidential metrics. The sequence search option in MicroPhenoDB enables rapid identification of existing pathogenic microbes in samples without running the usual metagenomic data processing and assembly. MicroPhenoDB offers data browsing, searching, and visualization through user-friendly web interfaces and web service application programming interfaces. MicroPhenoDB is the first database platform to detail the relationships between pathogenic microbes, core genes, and disease phenotypes. It will accelerate metagenomic data analysis and assist studies in decoding microbes related to human diseases. MicroPhenoDB is available through http://www.liwzlab.cn/microphenodb and http://lilab2.sysu.edu.cn/microphenodb.