基于编码序列、基因间序列和氨基酸序列构建的系统发生关系比较

以7种古菌、46种细菌和10种真核生物的基因组为样本,考虑碱基间的短程关联和长程关联作用,得到编码序列的密码对和基因间序列的三联体对中不同位点的二核苷酸频率,据此构建了基于编码序列和基因间序列的系统发生关系。无论是基于编码序列还是基因间序列对信息进行聚类,古菌或真核均被聚在一支上,表明聚类参数的选择是合适的;与基于氨基酸序列构建的系统发生关系进行两两比较,发现大部分硬壁菌的编码序列与基因间序列之间,以及编码序列与氨基酸序列之间的进化都存在较大差异。通过分析认为,只有综合考虑这三类序列的进化信息,才可能得到更自然的系统发生关系。     

红脖游蛇咬伤后局部伤口止血治疗新方法的探讨

目的探讨红脖游蛇咬伤后局部伤口止血治疗的新方法。外科高频电子电刀予红脖游蛇咬伤后出血不止的局部伤口电凝止血。伤伤13止血效果明显,且维持时间长,无需特殊护理和治疗。结论不止的新方法,值得进一步研究和探讨。方法在采用传统的“点压包扎止血法”及结合全身治疗的基础上,采用结果经综合性治疗,同时采用高频电刀予伤口电凝止血后,局部蛇据此推测,高频电刀电凝止血可能是治疗红脖游蛇咬伤后局部伤口出血     

shRNA随机文库结合TK自杀基因筛选靶向HIV-1LTR相关宿主因子

构建shRNA随机文库与HIV-1 LTR启动胸苷激酶基因(TK基因)稳定表达的稳定细胞系HEK293/TK,将两者结合起来,筛选靶向HIV-1 LTR相关宿主因子.方法:通过化学合成含有19个随机脱氧核苷酸的发夹结构,将其退火补平后与合成的接头Linker连接进行PCR反应,将PCR产物酶切后置于慢病毒载体pLenti-U6启动子下游由此构建shRNA随机文库;利用重叠PCR将HIV-1 LTR片段和TK基因连接起来,连接产物经酶切后与pcDNA3.1载体连接;将连接正确的质粒转染HEK293细胞同时用G418加压筛选获得稳定细胞系HEK293/TK;将所获得的文库质粒包装成慢病毒后侵染所构建的HEK293/TK细胞系,通过加入药物GCV进行加压筛选获得存活细胞.结果:成功筛选到加药后存活下来的细胞,抽提细胞基因组,采用巢式PCR扩增目的干扰序列并用Western blot对干扰序列进行验证,鉴定获得一个克隆所表达的shRNA能对TK基因的表达起到抑制作用,通过测序分析获得其干扰序列,该序列很有可能针对HIV-1 LTR某宿主相关因子.结论:成功构建了一种筛选HIV-1 LTR相关宿主因子的方法,筛选所得序列可以定位到具体相关宿主因子,为靶向筛选抗HIV-1药物提供了重要手段.     

基于地高辛标记对小麦进行Southern杂交分析主要影响因素的优化和验证

以转基因小麦和野生型小麦DNA为材料,对利用地高辛标记对小麦基因组DNA进行Southern杂交分析的影响因素进行了优化研究,包括探针制备与纯化、样品DNA量、酶切体系、真空转印条件、杂交条件、免疫检测方法等。结果表明,对随机引物标记的模板和标记后的探针进行纯化可明显提高探针的标记效率,10μg高质量的DNA样品在80μl的体系中,酶切8～12h可获得良好的效果;真空转膜时使用碱性液比中性液获得的转膜效果更干净;试剂纯度、杂交温度及杂交炉转速等均对杂交效果产生重要影响;配合改进的CSPD涂布方法,使用化学发光检测系统比单纯使用X光片显像更易操作,背景更干净;本研究所优化的地高辛标记的小麦Southern杂交分析显示出较高的灵敏度和信噪比,结果稳定,可克服同位素标记对实验条件、设备及实验人员身体状况等限制,在普通实验室推广应用。     

一类食饵具时滞与扩散的非线性脉冲捕食系统正周期解存在性

主要讨论了一类食饵具有时滞与扩散的非线性脉冲捕食系统正周期解的存在性问题,应用迭合度理论,得到系统存在正周期解的充分条件,推广了没有脉冲时的情形.数值模拟进一步验证了结论的正确性.     

害虫治理的病毒感染模型

研究了一类食饵受病毒感染的生态流行病模型,考虑脉冲释放病毒颗粒和自然天敌来进行害虫治理.利用Floquet乘子理论、小振幅扰动技巧和比较定理证明了害虫灭绝周期解的全局渐近稳定性以及系统持续生存的充分条件.结果为现实的害虫管理提供了科学依据.     

一类BAM随机神经网络的稳定性

对于一类双向联想记忆（BAM）随机神经网络。研究其全局稳定性和指数稳定性,利用Schwarz积分不等式和Ito积分性质,给出其稳定性判定的充分性条件．     

一类具有两个可变参数的Willis环脑动脉瘤系统的自适应同步控制

基于李雅普诺夫稳定性理论,设计自适应控制器,讨论了两个可变参数的Willis环上脑动脉瘤混沌系统的同步问题.对可变参数采用自适应调节,在该控制器的作用下实现了两个参数不相同的Willis环上脑动脉瘤混沌系统的同步.数值仿真结果验证了此设计的有效性.     

随机文法模型在RNA二级结构预测中的应用

RNA二级结构的研究是当今计算分子生物学的一个重要课题,基于比较序列分析方法的随机文法模型预测RNA二级结构具有准确率高,能对假结建模,但不易实施等特点,本文通过分析随机文法对RNA二级结构建模的过程,提出了一种综合利用比较序列方法,随机文法方法,词条方法预测RNA二级结构的方案.     

具有时滞的广义BAM脉冲神经网络的全局指数稳定性

本文讨论一类具有时滞的广义双向联想记忆（BAM）脉冲神经网络的指数稳定性．利用Banach空间的不动点定理和Lyapunoy泛函,在不假定激励函数有界、单调和可徽的条件下,得到了平衡点的存在唯一性定理及其为全局指数稳定的充分条件．文末通过实例阐释了所获结论的有效性．