miR-124基因家族的分子进化与靶基因预测

MicroRNA (miRNA)是一类内源基因编码的长度约22个核苷酸的非编码单链RNA分子.依据其在进化中高度保守的特点,利用生物信息学方法在目前已测序的物种中搜寻在哺乳动物中枢神经系统特异表达的miR-124基因的同源序列.在80个不同的动物物种中找到了150条miR-124基因的同源序列,其中27条为新发现的序列.目前发现的miR-124基因中,除线虫cel-mir-124和小鼠mmu-mir-124-2位于内含子之外,其他均位于基因间隔区.不同物种中,miR-124基因成熟序列的相似性为89.54％,前体序列为41.98％.miR-124基因在大多数无脊椎动物中为单拷贝,而在脊椎动物中大多为多拷贝,表明从无脊推动物到脊椎动物进化过程中miR-124基因发生了重复.靶基因预测结果显示,在人、小鼠和大鼠等哺乳动物中mir-124大多靶位点也是保守的.     

转基因（Bn-csRRM2）高产棉花的荒地生存竞争能力

【背景】转基因作物在商业化种植之前,必须评价其环境安全性。其中,荒地生存竞争能力是转基因作物环境安全性评价的重要内容之一。【方法】以转基因（Bn-csRRM2）高产棉为观察品种,受体材料中棉所12及转基因（Bt+CpTI）抗虫棉中棉所79为对照品种,分别于2013年4月底和5月底在荒地用地表撒播和3 cm深播2种方式播种,并于5～9月份对棉花存活率、株高、茎直径、果枝数、蕾铃数等生长参数进行比较,检测、评价其荒地竞争能力及杂草化风险。【结果】无论是撒播还是深播,荒地中棉花长势均较弱,表现为生长缓慢、植株矮小、生育期延迟。4月底播种的棉花至9月底未见棉铃;5月底播种的棉花有个别植株能够结铃,但铃数少且小,无吐絮铃。【结论与意义】转基因高产棉在荒地中无竞争优势,不能繁殖传代,无杂草化风险。本研究为转基因棉花环境安全评价技术的完善提供了理论依据。     

三种跳虫肠道菌群的多样性分析及功能预测

【目的】跳虫在土壤生态系统中发挥着重要的作用。本研究旨在调查Sinella(Coecobrya)oligoseta,Proisotoma minuta和Tomocerus missus 3种跳虫肠道菌群的结构和多样性以及潜在功能。【方法】采用16S rDNA扩增子测序法对以上3种跳虫成虫肠道内容物中的菌群进行分析和比较;应用Tax4Fun法对其肠道菌群基因进行功能预测。【结果】3种跳虫中成虫肠道菌群多样性最高的是T.missus,最低的是S.(C.)oligoseta。在门水平上3种跳虫成虫肠道中最主要的菌群均为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),放线菌门(Actinobacteria)也具有较高的丰度;在属水平上S.(C.)oligoseta肠道中假单胞菌属Pseudomonas的丰度(16.21%)明显高于P.minuta和T.missus肠道中的丰度(分别为0.87%和1.37%);P.minuta肠道中弧菌属Vibrio的丰度(25.81%)明显高于S.(C.)oligoseta和T.missus肠道中的丰度(分别为3.35%和0.004%)。另外,KEGG pathway注释预测出3种跳虫成虫肠道菌群基因功能涉及碳水化合物和氨基酸代谢、传染性疾病和耐药性。【结论】S.(C.)oligoseta,P.minuta和T.missus这3种跳虫肠道菌群在门水平上的核心菌群相同,而在属水平上的优势菌属丰度存在较大差异,其影响因素应该包括物种自身遗传特点及栖息地环境中微生物种类和数量的不同。在这3种跳虫肠道内发现放线菌,有利于新型放线菌的开发及其代谢产物的利用,并且它们的肠道内很可能存在耐药性和致病性菌株,这为跳虫肠道菌群的功能研究指引了新方向。     

超声多参数在预测妊娠期糖尿病巨大儿分娩方式中的临床价值

摘要 目的：探究超声多参数在预测妊娠期糖尿病巨大儿分娩方式中的应用价值。方法：选择2016年2月至2020年9月于中国人民解放军联勤保障部队第九○一医院（我院）分娩的156例妊娠期糖尿病产妇为研究对象,回顾性分析其一般临床指标及多普勒超声检测参数,按照新生儿是否为巨大儿区分为巨大儿组（52例）和非巨大儿组（104例）,对比两组胎儿超声参数差异,评估胎儿双顶径（biparietal diameter,BPD）、头围（head circumference,HC）、腹围（abdominal circumference,AC）及股骨长度（femur length,FL）与新生儿体重的相关性,纳入年龄、宫高、孕妇腹围、孕妇体重、BPD、HC、AC、FL等指标评估巨大儿单因素影响因素,最后多因素Logistic回归分析探究巨大儿独立危险因素。结果：（1）比较显示巨大儿组胎儿BPD、HC、AC和HL均大于非巨大儿组（P<0.05）;（2）Spearman相关性分析显示BPD、HC、AC和HL均与新生儿体重呈正相关（P<0.05）;（3）分析显示产妇宫高、产妇腹围、孕期增重、BPD、HC、AC和HL均为巨大儿单因素影响因素（P<0.05）;（4）Logistic多因素回归分析显示孕妇宫高、BPD、HC、AC为巨大儿独立危险因素。结论：孕期使用超声多参数对妊娠期糖尿病产妇巨大儿发生情况具有较好的预测价值,可协助医师了解胎儿相关指标,并据此选择合适的分娩方式,值得临床推广应用。     

非体外循环下冠脉搭桥术后急性肾损伤的危险因素及术前尿酸、白蛋白的预测价值分析

摘要 目的：探讨非体外循环下冠脉搭桥术（OPCAB）后急性肾损伤（AKI）的危险因素,并分析术前尿酸（UA）、白蛋白（ALB）对OPCAB术后AKI的预测价值。方法：纳入我院2018年5月～2020年5月收治的134例行OPCAB术的冠心病患者,收集其临床资料。术后观察48h,根据患者是否发生AKI分成AKI组和非AKI组,分析患者OPCAB术后AKI发生的影响因素,绘制受试者工作特征（ROC）曲线分析术前血清UA、ALB对OPCAB术后AKI的预测价值。结果：在134例患者中,有37例患者行OPCAB术后发生AKI,发生率为27.61%（37/134）。单因素分析结果显示,AKI组年龄≥65岁、高血压史、糖尿病史、术前心功能Ⅳ级人数占比和术前血清UA较非AKI组升高,而术前血清ALB较非AKI组降低（P＜0.05）。多因素Logistic回归分析结果显示,年龄≥65岁、高血压史、糖尿病史、术前心功能Ⅳ级、术前血清UA≥350.71 μmol/L是术后发生AKI的危险因素,而术前血清ALB≥39.22 g/L是AKI的保护因素（P＜0.05）。术前血清UA、ALB及二者联合预测OPCAB术后AKI发生的曲线下面积（AUC）分别为0.771、0.722、0.881。结论：OPCAB术后AKI发生率较高,AKI主要与患者年龄、高血压史、糖尿病史、术前心功能分级以及术前血清UA、ALB水平有关,其中术前血清UA、ALB对AKI发生有一定预测价值,临床可通过测定术前UA、ALB水平,辅助评估OPCAB术后AKI的发生风险。     

超声辐射力成像评估食管静脉曲张程度及出血风险的价值

摘要 目的：探究超声辐射力成像（acoustic radiation force impulse,ARFI）在评估食管静脉曲张（esophageal varices,EV）程度以及出血风险中的应用价值。方法：选择2018年1月至2020年1月于我院接受治疗的82例肝硬化患者,均对其开展ARFI、胃镜与血清学实验室检测,记录患者的肝、脾剪切波速度值（SWV _L 、SWV _S ）,参考胃镜检测结果将患者区分为EV组（61例）和无EV组（21例）,再根据胃镜结果将EV组区分为轻度（EV-G1,20例）、中度（EV-G2,21例）和重度（EV-G3,20例）,比较分析EV组与无EV组、不同EV病变程度组间的SWV _L 、SWV _S 差异;将患者根据食管静脉曲张出血（esophageal variceal bleeding,EVB）风险区分为低风险组（27例）和高风险组（34例）,对比低风险和高风险患者SWV _L 、SWV _S 差异;最后探究ARFI在评估EVB中的临床价值。结果：（1）比较显示EV组的SWV _L 、SWV _S 、血清总胆红素、白蛋白、凝血酶原时间等与无EV组差异明显（P<0.05）;（2）组间比较不同EV病变程度患者SWV _S 、血清总胆红素、白蛋白、凝血酶原时间差异明显（P<0.05）;（3）低风险组与高风险组患者间SWV _S 、血清总胆红素、白蛋白、凝血酶原时间差异明显（P<0.05）;（4）相关性分析SWV _S 与EV分级呈正相关（P<0.05）,SWV _S 对EVB诊断AUC为0.9622,95 % CI为0.9141-1.000（P<0.001）;结论：超声辐射弹力成像在评估食管静脉曲张程度以及出血风险中应用价值较高,其中SWV _S 诊断出血风险较为敏感,可将其应用于指导患者临床治疗和预后评估中。     

内脏脂肪面积及体质量指数对结直肠癌根治术患者疗效的影响及其预测价值分析

摘要 目的：探讨内脏脂肪面积及体质量指数（BMI）对结直肠癌根治术患者疗效的影响,并分析其对术后并发症、预后的预测价值。方法：前瞻性选取我院2017年5月～2019年12月收治的结直肠癌根治术患者126例,所有患者术前均进行体格检查,记录内脏脂肪面积（VFA）与BMI。根据VFA将其分成高脂肪组（VFA≥100cm²,n=43）、低脂肪组（VFA＜100cm²,n=83）,根据BMI分成未超重组（BMI＜24kg/m²,n=78）、超重组（BMI≥24kg/m²,n=48）,比较不同VFA、BMI患者的围手术期疗效指标及并发症发生率。术后随访1年,比较不同VFA、BMI患者的预后情况,绘制受试者工作特征（ROC）曲线分析VFA、BMI预测并发症、预后的曲线下面积（AUC）。结果：高脂肪组手术时间、术后排气时间较低脂肪组延长,术中出血量高于低脂肪组,淋巴结清扫数目低于低脂肪组（P＜0.05）。超重组手术时间、术后排气时间较未超重组延长,术中出血量高于未超重组（P＜0.05）。高脂肪组总并发症发生率和预后不良率高于低脂肪组（P＜0.05）。 超重组的总并发症发生率为18.75%,高于未超重组的6.41%（P＜0.05）,但是两组预后比较无差异（P>0.05）。ROC曲线提示,VFA、BMI预测术后并发症的AUC分别为0.784（P=0.001,95%CI：0.683-0.885）、0.740（P=0.004,95%CI：0.608-0.872）。VFA、BMI预测预后的AUC分别为0.776（P=0.002,95%CI：0.667-0.885）、0.667（P=0.058,95%CI：0.517-0.817）。结论：VFA、BMI过高均会影响结直肠癌根治术患者的疗效,并增加并发症发生率,其中VFA过高还会增加预后不良风险,VFA预测术后并发症及预后的效果优于BMI。     

贲门癌患者营养风险的危险因素及其与生活质量的关系研究

摘要 目的：探讨贲门癌患者营养风险的危险因素,分析其与生活质量的关系。方法：纳入我院2017年8月～2020年8月收治的贲门癌患者102例,采用营养风险筛查2002（NRS2002）将患者分成营养风险组（n=45）、无营养风险组（n=57）,分析患者发生营养风险的危险因素。采用简明生活质量量表（SF-36）评估患者的生活质量,分析NRS2002评分与SF-36评分的相关性。结果：在102例患者中,营养风险发生率为44.12%。Logistic多元回归模型分析显示：年龄≥60岁（OR=3.914,95%CI：1.718-8.917）、术前血红蛋白异常（OR=2.522,95%CI：1.124-5.659）、文化程度小学及以下（OR=3.447,95%CI：1.519-7.822）、家庭月收入≤1000元（OR=2.974,95%CI：1.415-6.251）均是贲门癌患者发生营养风险的危险因素（P＜0.05）,文化程度大专及以上（OR=0.941,95%CI：0.897-0.987）、家庭月收入>5000元（OR=0.947,95%CI：0.901-0.995）均是其营养风险发生的保护性因素（P＜0.05）。营养风险组情绪角色功能、心理健康、躯体功能、躯体疼痛、躯体角色功能、总体健康评分均低于无营养风险组（P＜0.05）。NRS2002评分与情绪角色功能（r=-0.811）、心理健康（r=-0.627）、躯体功能（r=-0.524）、躯体疼痛（r=-0.619）、躯体角色功能（r=-0.587）、总体健康（r=-0.718）评分均呈负相关（P＜0.05）。结论：贲门癌患者营养风险发生率较高,其发生与多种因素存在关联,可降低患者生活质量,临床需尽早对患者营养风险进行评估,并采取相应措施,以期改善患者生活质量。     

胃癌患者营养风险与生活质量及近期预后的关系研究

摘要 目的：探讨胃癌患者的营养风险的危险因素,并分析其与患者生活质量及近期预后的关系。方法：纳入我院2017年4月～2019年10月收治的胃癌患者81例,利用营养风险筛查2002（NRS2002）评分分析患者有无营养风险,经Logistic多元回归分析胃癌患者营养风险的危险因素。经简明生活质量量表（SF-36）评估患者生活质量并进行比较,前瞻性随访3、12个月,统计患者近期预后,分析胃癌患者NRS2002评分与SF-36评分的相关性。结果：在81例胃癌患者中,营养风险发生率为53.09%。Logistic多元回归分析显示：年龄≥60岁（OR=1.657,95%CI：1.042-2.635）、疼痛分度Ⅲ～Ⅳ度（OR=4.515,95%CI：1.656-12.310）、消化道反应Ⅲ～Ⅳ度（OR=3.947,95%CI：1.599-9.743）是胃癌患者营养风险发生的危险因素（P＜0.05）,而营养补充（OR=0.899,95%CI：0.846-0.955）是胃癌患者营养风险发生的保护因素（P＜0.05）。营养风险组情绪角色功能、躯体角色功能、躯体功能、总体健康、心理健康、躯体疼痛评分低于无营养风险组,NRS2002评分高于无营养风险组（P＜0.05）。胃癌患者NRS2002评分与情绪角色功能、躯体角色功能、躯体功能、总体健康、心理健康、躯体疼痛评分呈负相关（P＜0.05）。营养风险组随访3个月的生存率为95.35%,与无营养风险组的100%比较无差异（P＞0.05）。营养风险组随访12个月的生存率为79.07%,低于无营养风险组的94.74%（P＜0.05）。结论：胃癌患者营养风险发生率较高,其发生与多种因素有关,营养风险会影响生活质量和近期预后,临床需及时对胃癌患者进行营养风险评估,并尽早干预。     

基于茶蛋白质组学数据分析植物亚细胞定位预测软件的应用

以500个茶（Camellia sinensis（L.）O.Ktze.）叶片的蛋白质作为数据集,比较TargetP、WoLF PSORT、LocTree和Plant-mPLoc 4种软件预测亚细胞定位的可信度和灵敏度。结果显示,4种软件预测可信度均高于80%,依次排序为TargetP > LocTree > WoLF PSORT > Plant-mPLoc。其中,LocTree对细胞质蛋白和分泌蛋白检测灵敏度最高,但对叶绿体蛋白灵敏度最低;Plant-mPLoc检测核蛋白最灵敏,但对细胞质蛋白最不敏感;TargetP检测叶绿体蛋白最灵敏,但仅能区分3个亚细胞器官;WoLF PSORT对分泌蛋白检测灵敏度最低,但对其他蛋白均较灵敏。基于上述结果,该研究针对4种软件提出了合理的使用建议。