基于环境DNA-宏条形码技术的水生生态系统入侵生物的早期监测与预警

外来生物入侵是继生境破坏后造成生物多样性丧失的第二大威胁因素, 已对入侵地的生态安全、经济和社会发展及人类健康等造成严重负面影响, 成为21世纪五大全球性环境问题之一。作为水产养殖、航运和水生宠物交易大国, 我国水生生态系统的生物入侵问题尤为严重。研究表明, 系统地构建并应用早期监测预警技术是防控水生生态系统生物入侵最有效的途径。和陆生生物相比, 水生生物群落的物种繁多、群落结构复杂、生物形体微小且在入侵初期群体规模极小、隐匿于水下、可用于物种鉴定的外部形态缺乏, 使得在水生生态系统中构建并应用早期监测和预警体系在技术层面更具挑战。随着高通量测序技术的快速发展, 环境DNA-宏条形码技术成为构建水生生态系统入侵生物早期监测与预警技术的首选。本文主要综述了基于环境DNA-宏条形码技术的水生生态系统入侵生物的早期监测与预警技术方法; 解析了环境DNA-宏条形码监测系统的应用现状、技术优势; 着重探讨了影响监测结果准确性的I型和II型错误及其产生原因, 并为避免两类错误提供了可行的优化/改进方案; 最后对该方法在水生入侵生物监测中的应用前景进行了展望。     

蛋白质构象病

蛋白质的空间结构又称为三维结构或构象（conformation）,特定的空间构象是蛋白质发挥其各种功能的结构基础。由于蛋白质担负着复杂的生化反应,因此在生物合成以后,蛋白质本身也经历着复杂的生理过程;蛋白质自翻译以后,需进行一系列的翻译后过程,包括跨膜转运、修饰加工、折叠复性、生化反应、生物降解等,这些过程都伴随着蛋白质的结构转换。随着对疯牛病的研究,人们发现：蛋白质分子的氨基酸序列虽不改变,但其空间结构或构象的改变也能引起疾病。同时,越来越多的研究表明,一些遗传性疾病是由于基因突变导致了蛋白质的错误折叠,这些突变并不直接影响蛋白质的功能结构域,但由于蛋白质的错误折叠,干扰了其正确运输,形成对细胞有毒性作用的聚积物。     

湖北植物研究（I）

报道了湖北植物1新记录种祛风藤（Biondia microcentra（Tsiang）P．T．Li）,并对《湖北植物志》记载的3个错误鉴定种予以订正,它们分别是Phoebe nanmu（Oliv．）Gamble（滇楠）、Deutzia scabra Thunb．（溲疏）和Aspidistra lurida Ker—Gawl．（九龙盘）,其相应的正确名称分别为P．zhennan S．K．Lee＆F．N．Wei（楠木）、D．crenata Siebold＆Zucc．（齿叶溲疏）和A．oblanceifolia F．T．Wang＆K．Y．Lang（棕叶草）。     

中国橐吾属(菊科-千里光族)的分类学研究(五):君范橐吾、长毛槖吾和南川橐吾原白中一些排印错误的改正

对我国菊科橐吾属(Ligularia Cass.) 3种植物原白中模式标本引证的排印错误进行了改正。君范橐吾(L. lingiana S.W. Liu)原白中错误地将主模式标本引证为赵清盛82946,实际应为赵清盛、牟克平和杨亚斌8294。长毛槖吾(L. changiana S.W. Liu ex Y. L. Chen & Z. Yu Li)(=L. heterophylla C. C. Chang,为L. heterophylla Rupr.的晚出同名)主模式为蔡希陶59771,但L. heterophylla C. C. Chang 的原白中错误地将主模式标本引证为蔡希陶59711;该号标本属于唇形科的灯笼草[Clinopodium polycephalum (Vaniot) C. Y. Wu & Hsuan]。南川橐吾(L. nanchuanica S. W. Liu)原白中引证的副模式标本熊济华和周子林93871实际应为李国凤63871,前者属于桤叶树科的城口桤叶树(Clethra fargesii Franch.)。     

真核生物糖蛋白合成的质量控制--肽-N-聚糖酶的作用

肽-N-聚糖酶广泛存在于真核生物体中,它能够识别非正确折叠的糖蛋白并水解其天冬酰胺与肛乙酰葡萄糖胺的连接键,释放出完整的寡糖链,并生成天冬氨酸残基,因此在糖蛋白的质量控制与流通过程中起着重要作用。     

一种基于高密度遗传标记的亲子鉴定方法及其应用

系谱是人类遗传及动植物育种研究与实践的重要信息来源之一。系谱记录错误是育种生产中普遍存在的一种记录错误,影响基因定位、遗传值及表型值预测等相关研究结果的可靠性。现有的方法软件可以利用遗传标记信息对疑似亲子进行亲子鉴定,但这些软件方法操作复杂,限制标记数量,如Cervus。针对当前高密度SNP标记在人类及动植物研究中广泛应用的现状,文章提出了一种基于全基因组高密度SNP数据的亲子鉴定新方法,命名为EasyPC。对EasyPC及Cervus的运行效率进行了对比,并用中国荷斯坦牛(n=2180)和杜洛克猪(n=191)的全基因组SNP芯片数据对EasyPC进行了验证。结果表明：EasyPC运行效率高于Cervus,牛和猪群体系谱错误率分别为20%和6%,与相关研究报道相符。通过使用全基因组SNP标记对群体孟德尔错误率的经验分布进行分析,该方法不仅可以简单、快速、准确地判别系谱的正确性,而且还可以对错误系谱进行校正。EasyPC为解决全基因组研究中基因型及系谱数据前处理过程中的系谱校正问题提供了一种新的途径。     

错误记忆的相关研究进展

在实验室和日常生活中总会发生错误记忆,因此错误记忆已经成为了记忆研究的热点.错误记忆是区别于正确记忆的,本文从神经机制的角度论述了这种差异的证据.此外对影响错误记忆的主客观因素的神经科学研究进行了讨论.最后对错误记忆的不足和未来的发展方向做出了述评.     

利用PMCA技术实验不同剂量MCT联合DTT对PrP~(sc)转化的抑制效应

蛋白质错误折叠循环扩增(protein misfolding cyclic amplification,PMCA)技术,是一种具有感染性的朊蛋白(PrPsc)体外扩增的技术,可用于抑制细胞型朊蛋白(PrPc)向PrPsc转化药物的筛选.本研究在Saborio等提供的方法基础上,成功优化了最佳扩增时间,利用优化的PMCA技术实验了不同剂量氮芥(mechlorethamine,MCT)联合二硫苏糖醇(dithiothreitol,DTT)对PrPsc转化的抑制效应.结果发现,MCT联合DTT能体外抑制PrPc向PrPsc的转化,抑制作用具有明显的量效关系.利用针对人PrPc不同结构域的抗体发现,MCT联用DTT可使抗体6H4的抗原表位隐蔽,该表位位于PrPc第1个α螺旋区内,是构象转化的主要部位.对其机制的深入探讨,将有助于新一类可传播性海绵状脑病(transmissible spongiform encephalopathy,TSE)治疗药物的研发.     

错误信念推理的时间过程与源定位

理解他人心理并进行人际互动是人类交往的认知基础,人所持有的信念直接决定着个体的心理活动．为了研究推测他人信念的认知神经机制,记录并分析了14名健康成人执行“欺骗外表”任务时的32导脑电数据．错误信念与正确信念问题呈现后,均在头皮中前部诱发了N100,P200和晚期负成分（LNC）．LNC从400ms左右开始,一直持续到1200ms结束．在400～800ms,错误信念LNC显著低于正确信念．对错误信念减正确信念所得差异波进行源分析,发现偶极子定位于扣带回中部皮层．这些发现表明,错误信念推理中可能包含了抑制加工．     

EDEM 促蛋白质折叠与分泌作用

EDEM(ER degradation—enhancing α—mannosidase—like protein)是通过转录调节蛋白Xbp1作用产生的一种α-甘露糖苷酶样应激蛋白,能促进内质网应激时产生的不完全折叠或错误折叠糖蛋白的降解,在内质网相关性降解途径(ERAD)中起重要作用。糖蛋白在内质网中通过Cnx／Crt循环进行折叠,然后分泌人高尔基体继续加工,不能正确折叠或错误折叠糖蛋白经EDEM作用运送到胞质后被蛋白酶体降解。EDEM缺失易引起不完全折叠或错误折叠糖蛋白在内质网堆积,但是否进一步影响糖蛋白的折叠与分泌至今不清。最近Eriksson等发现EDEM缺失时导致糖蛋白折叠效率下降和分泌能力减弱。