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Cynomorium is a herbaceous holoparasite that has been placed in Santalales, Saxifragales, Myrtales, or Sapindales. The inverted repeat (IR) region of the chloroplast genome region is slow evolving and, unlike mitochondrial genes, the chloroplast genome experiences few horizontal gene transfers between the host and parasite. Thus, in the present study, we used sequences of the IR region to test the phylogenetic placements of Cynomorium. Phylogenetic analyses of the chloroplast IR sequences generated largely congruent ordinal relationships with those from previous studies of angiosperm phylogeny based on single or multiple genes. Santalales was closely related to Caryophyllales and asterids. Saxifragales formed a clade where Peridiscus was sister to the remainder of the order, whereas Paeonia was sister to the woody clade of Saxifragales. Cynomorium is not closely related to Santalales, Saxifragales, Myrtales, or Sapindales; instead, it is included in Rosales and sister to Rosaceae. The various placements of the holoparasite on the basis of different regions of the mitochondrial genome may indicate the heterogeneous nature of the genome in the parasite. However, it is unlikely that the placement of Cynomorium in Rosales is the result of chloroplast gene transfer because Cynomorium does not parasitize on rosaceous plants and there is no chloroplast gene transfer between Cynomorium and Nitraria, a confirmed host of Cynomorium and a member of Sapindales. 相似文献
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被子植物线粒体cox1基因的Group玉内含子常含有水平基因转移(horizontal gene transfer,HGT)现象。本研究对药用寄生植物锁阳(Cynomorium songaricum)线粒体基因cox1、cox2、nad1序列进行扩增分析,利用最大似然法对cox1和cox2基因内含子和外显子分别进行聚类分析,结果显示cox1内含子聚类结果与其他3个聚类结果不相符,说明该内含子可能存在水平基因转移现象。对比了锁阳6个不同居群间线粒体基因cox1、cox2、nad1外显子与内含子序列平均距离,发现6个不同居群间cox1基因内含子同源性高达100%,说明该基因内含子可能具有功能。结合生物信息学分析表明该内含子很有可能编码核酸内切酶,而DNA核酸内切酶被认为能促进内含子的转移。3'Co-conversion tracts(3'CCT)是被子植物内含子发生转移的痕迹,对锁阳cox1基因序列进行检测发现其含有3'CCT序列且长度为35 bp,RT-PCR实验验证得到cox1基因内含子可以独立转录m RNA。因此,锁阳cox1基因内含子很可能编码一个核酸内切酶,且促进了其内含子的转移。 相似文献
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目的:建立锁阳的HPLC指纹图谱,结合化学计量学和网络药理学技术探讨锁阳的最佳质量标志物(Q-marker),为锁阳的质量控制与评价提供参考.方法:采用高效液相色谱法(HPLC)建立锁阳的指纹图谱,建立正交偏最小二乘(OPLS)模型探讨HPLC指纹图谱上的质量差异性成分;从TCMSP、TTD、BATMAN-TCM等数据... 相似文献
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锁阳历史悠久,疗效甚佳,被广泛应用于医疗和保健领域。锁阳中含有丰富的活性物质,使其具有广泛的药理作用。目前以锁阳为主开发的制剂包括丸剂、散剂、片剂、胶囊剂、冲剂等多种剂型,以锁阳为主开发的保健品品种较多,如锁阳酒、锁阳饮料、锁阳茶、锁阳黄酮咀嚼片、锁阳膳食纤维等。虽然已开发的锁阳相关制剂及保健品品种较多,但对锁阳的治疗价值及保健功能体现仍不够齐全,临床应用范围较窄,推广应用不足,未来仍有较大的开发及应用潜力。 相似文献
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通过实地取样、标本查阅和文献研究获得131个锁阳(Cynomorium songaricum)采样点数据,并运用ArcGIS技术平台,从气候、土壤、地形数据库中提取了各采样点的生态因子,得出锁阳适宜生态因子范围。以此为据,利用中药材产地适宜性分析系统(TCMGIS)对锁阳在中国的产地适宜性进行多因子的空间分析。结果表明,锁阳适生区域主要位于西北干旱地区,包括内蒙古、新疆、宁夏、甘肃、青海等省(区)。研究结果对我国西北地区防沙固沙、荒漠生态保护和恢复具有重要的社会效应和生态价值。 相似文献
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目的:建立锁阳中19种无机元素含量的近红外光谱(NIR)快速测定模型,筛选适宜采用NIR技术进行测定的元素。方法:采集5个省(区)的82批锁阳样品,采用积分球漫反射方式采集样品的NIR原始光谱,采用电感耦合等离子体-质谱(ICP-MS)法测定Na、K、Ca、Mg、Fe、Zn、Mn、Co、Sr、Ni、Ag、Ba、Ti、Pb、Cr、Cd、As、Hg、Cu等19种无机元素含量的化学参考值,筛选预处理原始光谱的化学计量学方法,筛选最佳波段及因子数,以偏最小二乘法(PLS)建立NIR定量分析模型。结果:K、Ca、Mg、Mn、Co、Sr、Ti、Cr元素的决定系数R2及交叉验证R2均大于0.9,校正均方差(RMSEC)、预测均方差(RMSEP)及留一法交叉验证均方差(RMSECV)在0.52~2.20之间,模型预测值与真实值之间具有较好的相关性,预测性能较好;Ni、Zn元素的决定系数R2及交叉验证R2在0.8~0.9之间,RMSEC、RMSEP及RMSECV在0.49~1.41之间,预测值与真实值之间的相关性一般;Cu元素的决定系数R2及交叉验证R2在0.7~0.8之间,Na、Fe、Ag、Ba、Pb... 相似文献
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通过单因素试验、正交试验的方法,对影响锁阳ISSR-PCR反应体系的7种主要因素在3个水平上进行优化筛选,得到锁阳ISSR-PCR反应的最佳体系:25μL反应体系中含有0.2 mmol/L dNTP、1.5 mmol/L Mg2+、10μmol/L引物、50 ng模板DNA、2.0 UTaq酶、1%去离子甲酰胺和2.5μg/μL牛血清白蛋白。相应引物的最佳退火温度为48.9℃。这一体系的建立为今后利用ISSR-PCR标记技术研究锁阳的遗传多样性奠定了基础。同时对ISSR-PCR体系中添加剂的作用进行了探讨,为添加剂在其他植物ISSR-PCR反应中的应用提供借鉴。 相似文献