结合代谢组学和转录组学分析恶臭假单胞菌Y-9主动稳定胞内外pH的机制

【目的】揭示恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) Y-9在氨氧化过程中主动调节胞外和胞内pH稳态机制。【方法】在初始pH为7.19和9.40的硝化培养基中培养Y-9生长48 h，利用代谢组学对比分析Y-9氨氧化过程中的显著差异代谢产物并预测解离常数(pKa)；结合转录组学对比分析Y-9氨氧化过程中的显著差异调控基因。【结果】Y-9在初始pH为7.19的相对酸性条件下，产生麦芽糖醇提高胞外pH；通过上调脱氨酶、脱亚胺酶和阳离子转运相关基因在相对酸性环境中的表达来维持细胞内pH稳定性。在初始pH为9.40的碱性条件下，产5-氨基戊酸3和草氨酸等有机酸及酸性物质降低胞外pH；通过调控NADH脱氢酶、细胞色素、ATP合酶和氨基酸转运相关基因的表达来维持细胞内酸度，应对碱性环境。【结论】本研究结果首先发现了Y-9具有稳定胞外pH的能力，探讨了其胞内pH稳态机制，拓展了对微生物与环境相互作用的认知，为进一步认识微生物脱氮过程中系统pH稳定机理提供了理论依据。     

外源

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内蒙古根河市茶用中药植物资源（摘要）

根河市茶用中药植物资源丰富 ,当地百姓有着丰富的采集中草药做茶的经验和文化传统。我们对此进行了野外调查。结合民间、集市采访 ,基本查清了当地百姓常用的、资源量较大、有较好开发前景的茶用植物种类 ,现从其茶用部位、保健功效等方面作以简要报告 ,以为保健茶的开发、生产提供原材料参考。1　自然概况该地处于大兴安岭北段西坡 ,北纬 5 0 。 2 2 ’ ～5 2 。 30 ’东经 12 0 。 12 ’ ～ 12 2 。 15 ’ ,属寒温带湿润型森林气候 ,全境处在大兴安岭植物区 ,面积1992 9ｋｍ2 ,植被类型多样 ,是我国天然林重要的保存地 ,覆盖率达 75 %以…     

传导式干燥机引入红外技术的探讨

传导式干燥机广泛应用于农副土特产品的干燥过程，干燥时辐射能量仅占总传递能量的５％。经计算，引入红外加热技术后，辐射能量所占比例由５％提高至１８％，从而降低了干燥介质（饱和水蒸汽）的消耗量。     

遮阴对南山茶与红皮糙果茶幼苗生长及生理特性的影响

以2年生南山茶Camellia semiserrata、红皮糙果茶C. crapnelliana实生苗为试材，研究全光照(CK)、30%遮阴、50%遮阴和70%遮阴等处理对其生长、生物量分配及叶片部分生理生化指标的影响。结果表明，30%遮阴可显著增加南山茶幼苗株高净生长量、总生物量，其叶绿素a、叶绿素b显著增加，SOD、CAT酶活性及Pro含量均与CK组无显著差异，MDA含量则显著降低；红皮糙果茶幼苗则在30%遮阴下显著增加株高和地径，叶绿素a、叶绿素b含量及SOD酶活性、Pro含量与CK组无差异，MDA含量显著下降。说明两种山茶属植物幼苗较适宜的光照条件为遮阴30%。此外，红皮糙果茶幼苗在50%遮阴条件下与CK组比较，虽然地径生长受抑制，但株高生长无显著差异，且叶绿素a、叶绿素b含量与CAT酶活性显著增加，Pro、MDA含量显著下降，表明红皮糙果茶幼苗能通过调节叶绿素含量、CAT酶活性和Pro含量积极应对50%遮阴的弱光环境，进行适应性生长。因此生产上及绿化应用中，南山茶幼苗对光照的需求更为严格，遮阴控制在30%；红皮糙果茶幼苗则可适应更加荫蔽的环境(50%遮阴)。     

烟曲霉孢子侵染小鼠骨髓源巨噬细胞的转录组研究CSCD

目的揭示小鼠骨髓源巨噬细胞(bone marrow-derived macrophages,BMMs)被烟曲霉(Aspergillus fumigatus)A1160c孢子侵染之后与未处理对照组BMMs相比表达出现差异的免疫信号通路及孢子吞噬和清除等相关基因。方法提取小鼠原代骨髓细胞并将其诱导分化成巨噬细胞。烟曲霉孢子感染并分别提取感染组和对照组BMMs的总RNA,进行RNA测序和分析比较。结果提取小鼠原代骨髓细胞并成功将其诱导分化成BMMs。BMMs在感染烟曲霉孢子后,表面受体Tlr2和C型凝集素受体Clec4e和Clec5a的转录被激活。NF-κB信号传导通路也被激活,如Il1b、Tnf、Nfkb1等炎症因子基因和Jun、Gsk3b、Tec、Cd83等相关基因转录上调。同时,Cxcl1、Cxcl2、Ccl4等多种趋化因子基因转录水平也上调。另外,活性氧产生相关基因Bax、Nos2、Glul、Nlrp3的转录水平明显升高。结论在感染烟曲霉A1160^(c)孢子过程中,BMMs通过上调Toll样受体和C型凝集素受体基因转录水平激活NF-κB等免疫信号传导通路,促进趋化因子及活性氧产生相关基因的表达,引发对烟曲霉孢子的免疫响应和清除。     

青藏高原地区3种蒿属植物转录组比较分析

米蒿（Artemisia dalai-lamae）、冷蒿（Artemisia frigida）和臭蒿（Artemisia hedinii）作为西北干旱半干旱地区常见植物,具有防风固沙、阻止草原退化、杀菌消炎和治疗多种疾病的功效。通过Illumina测序技术分别对3种蒿属植物进行转录组测序和分析,分别获得54 268 322,46 434 864和43 971 646条Clean reads,并对测序结果进行了SNP和可变剪接分析。在米蒿和冷蒿对比组（ADL vs AF）中筛选到6 107个差异基因,在米蒿和臭蒿对比组（ADL vs AH）中筛选到4 822个差异基因,在冷蒿和臭蒿对比组（AF vs AH）中筛选到3 755个差异基因。GO富集将差异基因注释到生物过程、细胞组成和分子功能这3个类别共47个条目。KEGG代谢通路分析将3个对比组的差异基因分别富集到198、198和197条通路。对每个对比组的前10个高表达差异基因进行了分析,并筛选出25个生物碱、萜类和类黄酮的活性成分可能相关的差异基因。本研究为蒿属植物的物种鉴定、抗逆性研究和资源利用提供一定的科学依据。     

东北林下早春植物开花的生理特征研究

为了探索早春开花植物在低温下的开花机制,本研究采集了5种典型早春开花植物和5种非早春开花植物。基于高效液相色谱-质谱代谢组学技术对比分析了早春时期两者之间在内源激素和次生代谢产物上的差异。结果显示：早春开花植物中的生长素（IAA）和玉米素（ZT）含量明显低于非早春开花植物,而赤霉素（GA₃）和脱落酸（ABA）的含量则显著高于非早春开花植物,表明GA₃和ABA可能在促进早春开花植物的开花过程具有调控作用;在次生代谢物方面,酚类代谢物的前体物质L-苯丙氨酸,C6C1结构的酚类化合物：香草酸、丁香酸和原儿茶酸,C6C3结构的化合物：阿魏酸、绿原酸和咖啡酸,以及黄酮类化合物芹菜素、染料木苷、橙皮素、白杨素和高良姜素在非早春开花植物中的含量普遍高于早春开花植物。这可能是由于早春开花植物的开花过程伴随着更多的能量消耗,从而降低了其次生代谢水平。研究结果表明了内源植物激素和次生代谢产物对早春开花植物开花的生理过程的调控,并为进一步理解低温条件下植物开花过程奠定了基础。     

麦冬提取物治疗2型糖尿病小鼠的血清代谢组学研究*

目的:采用代谢组学方法研究麦冬对2型糖尿病(T2DM)小鼠内源性代谢物的影响。方法: 腹腔注射链脲佐菌素建立T2DM小鼠模型。连续4周灌胃给予麦冬水提物后,检测血清中糖尿病相关指标,且以超高效液相色谱-飞行时间质谱联用(UPLC-Q/TOF-MS)技术,研究麦冬对T2DM小鼠血清中代谢物质的影响,分析相关代谢通路。结果: 与正常对照组相比,模型组血清的空腹葡萄糖、总胆固醇、甘油三酯、低密度脂蛋白胆固醇含量显著升高,高密度脂蛋白胆固醇含量显著降低;灌胃给予麦冬水提物后,T2DM小鼠血清中以上指标均明显改善。代谢组学结果显示,正常组与模型组共有43个差异代谢物,富集于18条通路;麦冬提取物明显降低T2DM小鼠的甘油酸、丙二酸半醛和4-羟基苯基丙酮酸含量,差异代谢物富集于泛醌和其他萜类醌生物合成代谢等7条通路。结论: 麦冬水提物具有降低T2DM小鼠血糖和血脂的药效作用,且可能与泛醌和其他萜类醌生物合成等通路有关。