火棘不同组织内生细菌群落多样性

为了解火棘不同组织内生细菌群落多样性,该研究采用高通量测序技术对火棘内生细菌16S rRNA V5～V7可变区进行测序,分析火棘不同组织部位内生细菌群落多样性。结果表明:(1)从火棘根、茎、叶组织中共获得内生细菌OTU 1 818个,其中根部754个,茎部 308 个,叶部756个,三者共有 OTU 152 个。(2)物种分类显示,不同火棘组织内生细菌具有丰富的群落多样性,火棘根部内生细菌种类隶属于23门53纲137目216科373属557种,其中异样根瘤菌属(Allorhizobium-Neorhizobium-Pararhizobium-Rhizobium)和链霉菌属(Streptomyces)为优势属,其相对丰度分别为 10.57%和 8.00%; 茎部内生细菌种类隶属于21门32纲76目126科204属270种,其中马赛菌属(Massilia)和未知分类的丛毛单胞菌科属(unclassified_f_Comamonadaceae)为优势属,其相对丰度分别为31.10%和12.82%; 叶部内生细菌种类隶属于21门52纲130目210科380属581种,其中土芽孢杆菌属(Geobacillus)和假单胞菌属(Pseudomonas)为优势属,其相对丰度分别为12.31%和9.84%。(3)PICRUSt功能预测表明,根部内生细菌物种最丰富,参与各种代谢调控的细菌丰度最高。该研究结果为进一步探讨植物内生细菌功能,挖掘新的有益微生物资源提供了参考。     

晶体结构分析 技术稳步向前发展 新一代技术有望不要结晶

2009年春天,Astellas制药公司的高通量BL将在筑波的PF启动。2010年,微小晶体分析能力实现飞跃性提高的BL将在播磨SPring-8登场,使晶体结构分析中不可或缺的相位测定变得简单易行的BL也将在筑波PF登场。预计不再需要结晶的X射线自由电子激光（XFEL）将于2010年在播磨启动。     

食品生物技术相关专利分析

随着生物技术在食品工业应用日益深入,以基因工程为先导,以发酵工程、酶工程技术为核心．包括蛋白质工程和生物分离工程在内的食品生物技术已成为提升我国食品工业技术含量、参与市场竞争的重要核心技术。本文以Derwent Innovation Index（DⅡ）数据库和Aureka数据库为基础,对上游（基因工程）、中游（发酵工程、酶工程与蛋白质工程）、下游（生物分离工程、食品安全检测）食品生物技术相关专利进行研究分析。     

Subspecies-specific intron length polymorphism markers reveal clear genetic differentiation in common wild rice （Oryza rufipogon L.） in relation to the domestication of cultivated rice （O. sativa L.）

It is generally accepted that Oryza rufipogon is the progenitor of Asian cultivated rice （O. sativa）. However, how the two subspecies of O. sativa （indica and japonica） were domesticated has long been debated. To investigate the genetic differentiation in O. rufipogon in relation to the domestication of O. sativa, we developed 57 subspecies-specific intron length polymorphism （SSILP） markers by comparison between 10 indica cultivars and 10 japonica cultivars and defined a standard indica rice and a standard japonica rice based on these SSILP markers. Using these SSILP markers to genotype 73 O. rufipogon accessions, we found that the indica alleles and japonica alleles of the SSILP markers were predominant in the O. rufipogon accessions, suggesting that SSILPs were highly conserved during the evolution of O. sativa. Cluster analysis based on these markers yielded a dendrogram consisting of two distinct groups： one group （Group I） comprises all the O. rufipogon accesions from tropical （South and Southeast） Asia as well as the standard indica rice; the other group （Group II） comprises all the O. rufipogon accessions from Southern China as well as the standard japonica rice. Further analysis showed that the two groups have significantly higher frequencies of indica alleles and japonica alleles, respectively. These results support the hypothesis that indica rice and japonica rice were domesticated from the O. rufipogon of tropical Asia and from that of Southern China, respectively, and suggest that the indica-japonica differentiation should have formed in O. rufipogon long before the beginning of domestication. Furthermore, with an O. glaberrima accession as an outgroup, it is suggested that the indica-japonica differentiation in O. ruffpogon might occur after its speciation from other AA-genome species.     

赛默飞世尔启动RNA干扰研究/药物筛选资助项目

全球科学服务领域的领导者赛默飞世尔科技近日宣布在全球启动一项RNA干扰研究／药物筛选资助项目——-“Thermo Scientific RNAi Discovery Grant Program”。在当前经济困难的情况下,公司为鼓励和促进RNA干扰技术在科学研究与药物开发领域的发展设立此项目,     

上海市工业微生物研究所检测中心

上海市工业微生物研究所检测中心位于漕河泾高新技术开发区,是专门从事食品、发酵制品、食品添加剂等样品的物理、化学和微生物分析检测技术服务,以及轻纺、日化、建材、橡胶等产品微生物防霉抗菌性能测试技术服务的检测机构。     

新一代测序技术的研究进展

大规模DNA测序技术是揭秘人类和其它生物遗传密码的重要技术,在分子生物学和基础医学领域有广泛应用。第二代测序技术的出现使DNA测序的通量大幅提高,测序的成本大幅下降,原来只有在大型测序中心才能完成的测序任务现在已经可以在更多的实验室展开。但是,早期的第二代测序技术仍然存在诸如文库构建过程复杂、测序成本依然较高等缺点。为了克服上述缺点,近三年发展了几种新的第二代和第三代测序技术,这些技术不仅继承了早期第二代测序技术通量高的优点,而且在文库构建等方面取得了重要突破,进一步简化了测序操作,降低了测序成本,缩短了测序时间。本文就几种最新的大规模测序技术的原理、特点与发展趋势进行简要介绍。     

大花栀子植物挥发物成分测定及其日变化分析

为探究大花栀子植物挥发物成分组成及其一天内早、中、晚的差异,采用热脱附气质联用技术对其进行香气成分的分析。结果表明:全天从其花朵中共鉴定出62种成分,主要为萜烯类、酯类、醇类物质,且不同时间其成分差异显著,如早、中、晚3个时间段,β-蒎烯相对含量分别为1.93%、1.69%、8.81%,顺式-β-罗勒烯分别为28.22%、4.35%、16.47%。3-蒈烯(3.45%)、异丁子香酚(0.21%)等只在早上检出;月桂烯(0.38%)、伞花烃(2.46%)等只在晚上检出;芳樟醇、金合欢烯等在早上和午间两个时间段相对含量较高,而在晚上却未检测出。从植物VOCs角度结合其日变化动态,为大花栀子园林配置及其综合开发利用提供理论依据。     

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《微生物学通报》创刊于1974年,是中国科学院微生物研究所和中国微生物学会主办,国内外公开发行,以微生物学应用基础研究及技术创新与应用为主的综合性学术期刊。刊登内容包括:基础微生物学研究,农业微生物学研究,工业微生物学研究,医学微生物学研究,食品微生物学研究,环境微生物学研究,微生物功能基因组研究,微生物蛋白组学研究,微生物