利用变量分析探讨西双版纳州勐海等地鸟类生境变化

郑作新,郑宝赉(1961,1962),依万诺夫(1961)等在西双版纳的勐海、勐养、勐腊进行了鸟类资源调查。经二十多年的开发利用后,1983年作者在上述地区观察、采集、记录这些地区的留鸟种数,利用变量分析来对两次的留鸟种数进行比较分析,通过种数的差异性变化分布来反映三地开发后的鸟类生境变化。     

定量古生物学中的常用Q型多变量线性回归方法例析

提要Q型多变量线性回归方法是定量古生物学研究中经常使用的一组方法。不同于把研究重心放在变量或变量组之间关系的R型回归方法,Q型回归方法对样本进行整体分析,通过构建样本之间的相似性系数矩阵或者距离矩阵,并进行分解与变换,进而用可视化的方法展示样本的整体相似性关系。本文将介绍常用的Q型多变量线性回归方法,包括主坐标分析(Principal coordinate analysis)、Q型聚类分析(Q-Cluster analysis)、Q型因子分析(Q-Factor analysis),以及综合了R型和Q型的对应分析(Correspondence analysis),和它们在计算中的注意事项与适用场景。本文选取瓜迪亚纳河入海口大陆架地区底栖有孔虫分布特征研究作为实例,分别用上述方法进行分析,以解释它们在定量古生物学中的具体应用。     

实验性颅内压增高对Q—Tc间期的影响

颅内压(ICP)增高对心电图(ECG)的影响已有文献报道,但尚缺乏动态观察ICP增高对Q-T_c间期影响的专门报道。本实验观察猫阶梯性增高ICP时的Q-T_c变化特征。     

酿酒酵母转化木糖生产化学品的研究进展

木糖的有效利用是木质纤维素生产生物燃料或化学品经济性转化的基础.30年来,通过理性代谢改造和适应性进化等工程策略,显著提高了传统乙醇发酵微生物——酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae的木糖代谢能力.因此,近年来在酿酒酵母中利用木糖生产化学品的研究逐步展开.研究发现,酿酒酵母分别以木糖和葡萄糖为碳源时...     

SDG714 Regulates Specific Gene Expression and Consequently Affects Plant Growth via H3K9 Dimethylation

Histone lysine methylation is known to be involved in the epigenetic regulation of gene expression in all eukaryotes including plants. Here we show that the rice SDG714 is primarily responsible for dimethylation but not trimethylation on histone H3K9 in vivo. Overexpression of YFP-SDG714 in Arabidopsis significantly inhibits plant growth and this inhibition is associated with an enhanced level of H3K9 dimethylation. Our microarray results show that many genes essential for the plant growth and development were downregulated in transgenic Arabidopsis plants overexpressing YFP-SDG714. By chromatin immunoprecipitation analysis, we show that YFP-SDG714 is targeted to specific chromatin regions and dimethylate the H3K9, which is linked with heterochromatinization and the downregulation of genes. Most interestingly, when YFP-SDG714 production is stopped, the inhibited plants can partially restore their growth, suggesting that the perturbation of gene expression caused by YFP-SDG714 is revertible. Taken together, our results point to an important role of SDG714 in H3K9 dimethylation, suppression of gene expression and plant growth, and provide a potential method to regulate gene expression and plant development by an on-off switch of SDG714 expression.     

应用聚合酶链式反应快速特异鉴定假单胞菌和伯克霍尔德氏菌(R)-3-羟基酯酰载酯蛋白-辅酶A转酰基酶基因

聚羟基脂肪酸酯(PHA)是一类具有广泛应用前景的可降解生物塑料。因其可以以葡萄糖等廉价底物直接发酵生产PHA而日益受到重视。目前的研究表明在积累中长链PHA的假单胞菌中,由phaG基因编码的(R)-3-羟基酯酰载酯蛋白-辅酶A转酰基酶(PhaG)起关键作用,但目前为止对该蛋白还知之甚少。通过聚合酶链式反应(PCR)建立了一种快速、特异鉴定phaG基因的方法,应用该方法成功地从两株积累不同PHA的假单胞菌Pseudomonas stutzeri 1317和Pseudamanas nitroreducens 0802中分别克隆得到phaG基因,并在phaG基因突变株Pseudomonas putida PHAGx-21中表达成功。同时,还首次报道了从非假单胞菌菌株Burkholderia caryophylli AS 1．2741中鉴定得到phaG基因,提示PhaG介导的中长链PHA合成途径作为一种通用的代谢模式在细菌中广泛存在,为进一步实现从廉价的非相关底物合成中长链PHA提供了必要的分子生物学基础。     

应用聚合酶链式反应快速特异鉴定假单胞菌和伯克霍尔德氏菌（R）-3-羟基酯酰载酯蛋白-辅酶A转酰基酶基因

聚羟基脂肪酸酯 (PHA)是一类具有广泛应用前景的可降解生物塑料。因其可以以葡萄糖等廉价底物直接发酵生产PHA而日益受到重视。目前的研究表明在积累中长链PHA的假单胞菌中 ,由phaG基因编码的（R）3 羟基酯酰载酯蛋白 辅酶A转酰基酶 (PhaG)起关键作用 ,但目前为止对该蛋白还知之甚少。通过聚合酶链式反应 (PCR)建立了一种快速、特异鉴定phaG基因的方法 ,应用该方法成功地从两株积累不同PHA的假单胞菌Pseudomonasstutzeri 1317和Pseudomonasnitroreducens 080 2中分别克隆得到phaG基因 ,并在phaG基因突变株PseudomonasputidaPHAG_N-21中表达成功。同时 ,还首次报道了从非假单胞菌菌株Burkholderiacaryophylli AS 1.274 1中鉴定得到phaG基因 ,提示PhaG介导的中长链PHA合成途径作为一种通用的代谢模式在细菌中广泛存在 ,为进一步实现从廉价的非相关底物合成中长链PHA提供了必要的分子生物学基础。