一种模拟昆虫种群动态的改进的变维矩阵模型

提出了一种模拟昆虫种群动态的改进的变维矩阵模型,该模型以发有历期为维数,采用分解与合成的方法变维,并考虑了个体间的发育差异。经模拟检验,模型模拟结果略优于徐汝梅等（1981）变维矩阵模型的结果。     

非同源蛋白质空间折叠的动力学参数研究

从蛋白质折叠成自由能最小的稳定结构类型为研究的出发点,为揭示蛋白质空间折叠的动力学本质,对非同源蛋白质数据库,以蛋白质序列的氮基酸频率和自协方差函数为特征矢量,求出表征特征矢量中各分量耦合作用与协同作用的协方差矩阵所对应的特征值．与Chou的方法相比,更全面地反映了蛋白质折叠密码的简并性、全局性和多意性,为定量表征折叠成不同结构类的蛋白质,提供了一种动力学参数分析方法．     

甲状旁腺激素PTH 1-34对成骨细胞的机械应答的影响

目的：探讨PTH对成骨细胞在机械载荷状态下的功能影响。方法：人成骨样细胞株MG63复苏培养,采用163mOsm低渗液作为刺激源,实验分为三组,A组为单纯用DMEM培养基培养;B组为低渗液对成骨细胞分别作用0．5h、2h、4h和6h;C组为低渗处理同期加入hPTH1-34（20ng／L）。检测细胞内钙离子浓度[Ca2＋]、细胞凋亡指数以及增殖活力的变化。所得结果采用单因素方差分析法。结果：随着培养时间延长,[Ca2＋]i升高,以B组升高最为明显,（与A组比较p〈0．05）,A组和C组比较p〉0．05;细胞凋亡指数在B组4h和6h为最高（29．38±0．336;54．87±0.781）,明显高于A组和C组,且与两组相比均p〈0．05,C组4h凋亡率低于A组（p〈0．05）,其它时间组统计学比较p〉0．05。细胞增殖活力随着培养时间增加逐渐增加,与A组和C组同期相比,B组较低,且p〈0.05。结论：过强的低渗牵张作用对细胞有损害作用,[Ca2＋]i降低,凋亡率增加且降低增殖活性;PTH通过维持[Ca2＋]i浓度,对细胞的功能具有保护作用。     

香菇数量性状的因子分析

因子分析结果表明,22个香菇菌株16个数量性状可分为弱相关的5个主因子,其方差积累贡献率为85.71%。按照主因子所包含的性状及其所反映的生物学含义,可把5个主因子命名并按方差贡献大小顺序排列为:F5,菇形因子;F1,菌柄因子;F3,营养生长因子;F2,生殖生长因子;F4,转色因子。从主因子出发进行香菇育种,可以加大目标性状的针对性和提高选择效率。     

大杯香菇辐射选育新株系数量性状的因子分析

对20个大杯香菇品种和辐射选育新株系的数量性状进行因子分析.结果表明,20个大杯香菇品种和辐射选育新株系的18个数量性状,可提取为7个公因子,其累积方差贡献率达91.85 %,代表了所有性状绝大部分相关信息.按照主因子所包含的性状及其所反映的生物学、营养学和酶学含义,可把7个主因子命名并按方差贡献大小顺序排列为：促长因子1、CAT活性因子2、营养质量因子3、MDA因子7、化学评分因子4、氨基酸比值系数分因子5、粗壮因子6.从主因子出发进行大杯香菇辐射育种,可以加大目标性状的针对性的选择效率,比较容易获得综合数量性状优良的新品种.     

具有奇异M矩阵的Lotka-Volterra 系统解的渐近性态

本主讨论了当Lotka-Volterra系统的系数矩阵为奇异M矩阵时解的渐近性态．     

山西历山国家级自然保护区千金榆群落种间分离研究

对山西历山国家级自然保护区普通沟和西峡的千金榆(Carpinus cordata)群落进行野外调查,共记录了40个样方,44个物种,组成946个种对.利用最近邻体法构造N×N最近邻体列联表,以x2检验和种间分离指数S作为区分指标,研究了千金榆群落的种间分离情况.结果表明:(1)946个种对中呈现随机毗邻的最多,有507个种对,占总数的53.59％;呈现正分离的有349个种对,占总数的36.89％;而呈现负分离种对最少,只有90对,占总数的9.52％.(2)群落的建群种或优势种因为有较强的生存能力和竞争能力,往往表现出正分离,例如千金榆、小叶鹅耳枥(Carpinus turczaninowii)、五角枫(Acer mono)、葛罗槭(Acer grosseri)等有较强生存能力的物种与大多数的物种发生正分离;而六道木(Abelia biflora)、东北茶镳子(Ribes mandshuricum)、小花溲疏(Deutziaparviflora),美蔷薇(Rosa bella)和紫花卫矛(Euonymus porphyries)等群落中的伴生种或小灌木,与部分物种形成负分离.其余物种之间发生随机毗邻的较多.(3)对千金榆群落44×44列联表进行全面分离,结果表明群落内的44个物种相互交错分布,不是全面分离.此外,种间分离的结果也揭示该群落处于演替初期,受岩石风化崩塌的影响较严重,人为干扰因素较轻.     

基于扩展起始节点和加权融合策略预测肺癌风险致病基因

肺癌风险致病基因预测有助于了解疾病发病机制、提高临床治疗效果.目前,以重启游走为框架的风险致病基因预测算法,普遍存在起始节点少、节点转移概率相同、信息源单一的问题.为此,本文提出一种基于扩展起始节点和加权融合策略的风险致病基因预测算法(命名为AFMFSC),并在肺癌中验证算法有效性.首先,基于增广模糊测量思想,计算疾病表型近似基因间的增广功能相似得分,从中选出重要基因与致病基因作为扩展起始节点;其次,采用节点拓扑相似度转移矩阵及基因表达差异相关性转移矩阵,分别在蛋白质网络中重启随机游走,并将两种结果加权融合排序;最后,通过富集分析排名靠前基因,得到有显著意义的风险致病基因.AFMFSC算法预测的73个肺癌风险致病基因,均与肺癌发生、发展有密切联系,生物学意义显著.与其他排序算法相比,AFMFSC算法的Top 1%、Top 5%和AUC值比较大,平均排名和受拓扑特性偏差影响程度小;融合策略排名性能优于单一转移矩阵或普通邻接矩阵游走排名.AFMFSC算法不仅能准确有效地预测肺癌风险致病基因,而且可推广预测其他疾病风险致病基因,为探索癌症致病机理提供新视角及依据.     

高寒草甸生态系统牲畜种群结构和动态

本文用Leslie矩阵模型研究了高寒草甸生态系统牲畜种群结构及动态。模型考虑了更加精确的年龄组转移关系,出栏率是种群波动的主要因子。目前,牲畜种群结构不合理,种群数量不能保持平衡。     

基于k-mer组分信息的系统发生树构建方法

随着越来越多基因组的测序完成,基于全基因组的非比对的系统发生分析已成为研究热点。不同的生物物种或个体基因组之间的核酸组分不完全相同。遗传语言-DNA序列的信息很大程度上反映在其k—mer频数中。基于基因组序列k-mer频数的系统发生树则从新的角度为我们提供物种之间的亲缘关系。本文定义基于k-mer,频数的信息参数,并用它表征基因组序列,计算不同基因组之间信息参数的距离,用邻接法对84个病毒构建了系统发生树,发现构建的系统发生树很大程度上与已有的系统发生树相吻合。