嗜热泉生古细菌及其他泉古菌同义密码子使用偏向性分析

比较分析了嗜热泉生古细菌(Aeropyrum pernix K1)和其他两种系统发育相关的泉古菌[嗜气菌(Pyrobaculum aerophi-lumstr.IM2)和嗜硫菌(Sulfolobus acidocaldarius DSM 639)]的同义密码子使用偏向性。结果表明嗜热泉生古细菌(Aeropyrum pernix K1)的密码子偏向性很小,并且与GC3S成高度的相关性。这3种泉古菌的密码子使用模式在进化上很保守。与基因的功能对密码子使用的影响相比,这些泉古菌密码子的使用偏向性更是由其物种所决定的。嗜热泉生古细菌(A.pernix K1),嗜气菌(P.aerophilum str.IM2)和嗜硫菌(S.acidocaldarius DSM 639)生存在不同的极限环境中。推测正是这些极限环境决定了这些泉古菌的密码子使用偏向性模式。此外在这些泉古菌的基因组中并没有发现其正义链和反义链的密码子使用偏向性差别。嗜热泉生古细菌(A.pernix K1)和嗜硫菌(S.acidocaldarius DSM 639)的密码子偏向性程度与基因表达水平有高度的相关性,而嗜气菌(P.aerophilum str.IM2)的基因组并没有发现这种规律。     

科技论文正体和斜体的书写规范

统计学符号常用统计学符号一般用斜体。样本的算术平均数用英文小写x,不用大写X,也不用Mean;标准差用英文小写s,不用SD;标准误用英文小写sx,不用SE;t检验用英文小写t;F检验用英文大写F;卡方检验用希文小写χ2;相关系数用英文小写r;样本数用英文小写n;概率用英文大写P;自由度用英文小写v。     

中国研制出新型人用H5N1禽流感活疫苗

中国国家禽流感参考实验室日前宣布研制出一种新型人用禽流感冷适应致弱活疫苗,有望对人类感染H5N1亚型禽流感病毒实现完全保护。与此前已有的人用禽流感灭活疫苗比较,新型活疫苗在免疫效果、生产工艺、使用方法等多     

实验动物信息资源网站（4）

（一）国内实验动物信息资源网站 4．国家实验动物许可证管理信息系统 名称：实验动物许可证管理信息系统 网址：http：／／xkz．lascn．com 维护机构：北京市实验动物管理办公室简介：由国家科技部立项资助建立,专门管理全国实验动物许可证信息的网络系统,在全国各省（直辖市）均设有分支网站,由各省市动管办负责使用维护。目前已有超过半数的省份开始上传数据,发布新闻。     

Wolbachia pipientis wMel基因组水平上的密码子使用分析

本实验检测了黑腹果蝇的专性寄生菌Wolbachia pipientis wMel基因组的密码子使用模式,并推测影响其密码子组成的因素．选择了478条蛋白编码基因作为研究对象,它们的GC含量比较低,约0．282～0．432．本研究结果显示,关联突变（context-dependent mutation）是影响W.pipientis wMel基因组密码子组成的主要因素．同时,Nc—Plot曲线显示,基因组的密码子组成还受到了核苷酸组成偏好性（nucleotide composition bias）的影响．对应分析的结果显示,基因长度（R=0．123,P〈0．01）和基因表达水平（R=-0．312,P〈0．01）也对基因组的密码子使用偏好性起到了一定的作用．因此,关联突变、核苷酸组成、基因长度和基因表达水平都会影响到基因组的密码子使用偏好性．Wolbachia基因组的几个特征和动物线粒体基因组具有较高的相似性,而且现在已有报道说明它们有共同的起源,但仍需进一步验证．     

通过发掘潜在需求止吐药市场不断扩大

以前止吐药的市场基本是以5-羟色胺（Serotonin）受体拮抗药为中心的。以消除抗癌药物使用后的呕吐为目标的新药开发进程加速,出现了如Aprepitant等具有新作用机理的药物。通过发掘潜在的需求止吐药市场将有望进一步扩大。[编者按]     

科研快讯

《柳叶刀》:两药物联合治疗躁郁症效果更好英国牛津大学研究人员在新一期英国医学期刊《柳叶刀》(The Lancet)上报告说,联合使用丙戊酸钠和锂元素药物治疗躁郁症比单独使用这两种药物效果更好,复发率更低。     

环境保护上的应用

<正>论述了在化学、药物制品以及食物配料的生产过程中、当与其它某一过程(例如、蒸发、吸附或沉淀)联合使用时的膜过程的作用。由于膜过程较简单,可降低投资费用。还详细叙述了超过滤的原理以及工业生产规模工厂的设计过程。而且指出,如果能就影响系统设计的操作条件给出     

滇黄精叶绿体全基因组序列及其密码子使用偏性分析

为探究滇黄精(Polygonatum kingianum)叶绿体全基因组特征和密码子使用偏性,利用第二代测序技术对滇黄精嫩叶进行测序,再经组装与注释后得到其叶绿体基因组全序列,通过MISA、EMBOSS和CodonW等软件对滇黄精叶绿体全基因组的SSR位点、系统发育及密码子偏好性进行分析。结果表明,滇黄精完整叶绿体基因组长度为155 852 bp,基因组平均GC含量为37.7%,其大、小单拷贝区(LSC)长度分别为84 633和185 25 bp,反向重复区长度为26 347 bp,注释了132个基因,包括86个蛋白编码基因、38个tRNA基因和8个核糖rRNA基因。叶绿体基因组中共有69个SSR位点,绝大多数属于单碱基重复的A/T类型。系统发育分析表明滇黄精与格脉黄精(P. tessellatum)亲缘关系近,可能与分布地域有关。密码子偏好性分析表明,滇黄精叶绿体基因组密码子使用模式受到自然选择影响大于突变因素,最终确定9个最优密码子。因此, 滇黄精叶绿体基因组遗传结构和系统发育位置及其密码子偏倚的分析,为叶绿体基因工程研究提供理论依据。     

《中国微生态学杂志》稿约

说明本文的目的、方法、结果和结论,一般限200～400字。