乳突拟耧斗菜中的一新二萜成分

从乳突拟耧斗菜(Paraquilegia)乙醇提取物的非碱部分中分得两个二萜类化合物：ent-考兰烷-16β，17-二醇和拟耧斗菜素(paraquilegin)。其中拟耧斗菜素是一新化合物，其结构经光谱解析和化学方法证明为ent-17-咖啡酰氧基-考兰烷-16B-醇。     

鲤春血症病毒中国分离株糖蛋白基因和氨基酸序列的初步解析

2002～2004年间从国内养殖鲤科鱼类和观赏鱼类中分离出8株鲤春血症病毒(SVCV).根据SVCV参考株全序列,设计引物,用逆转录聚合酶链式反应扩增出8株SVCV糖蛋白编码基因片段,并对扩增产物进行了克隆和序列测定.用生物信息学方法对测得的序列进行分析,结果8个国内分离株的糖蛋白基因序列与参考株的基因序列相似性均在92%以上,8个国内分离株之间基因序列相似性均在97.7%以上;8个国内分离株之间糖蛋白推导出的氨基酸序列相似性均在94.5%以上,与参考株氨基酸序列相似性在92.9%-94.9%之间.系统发育树分析结果表明,SVCV国内分离株与USA株、980451株、980528株和970469株的进化方向一致,与其它SVCV毒株在进化方向上不同.8个毒株有19个共同的酶切位点,推导出的氨基酸序列中有10个亲水区、10个可能的抗原位点和10个跨膜蛋白区域,其峰值基本一致.对SVCV国内分离株的糖蛋白6个功能位点(天冬酰胺糖基化位点、精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸序列、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪氨酸磷酸化位点和肉豆蔻酰基化位点)进行了初步分析.     

蛋白质组学技术在病毒学研究中的应用

蛋白质组学是门研究细胞和组织中蛋白质的存在及其结构、翻译后修饰、表达水平,最终阐述蛋白质群体功能的学科[1],它不仅是对机体产生的所有蛋白进行系统分离解析,更重要的是对这些蛋白质如何行使功能作出解释.利用先进的蛋白质组学技术研究病毒及相闰关宿主蛋白的表达、翻译后修饰、定位、相互作用和功能进行系统研究,有助于深入了解病素毒复复制、与宿主相互作用以及引发疾病的机制。     

Perl语言环境下XML文档解析方法

数据准备是生物信息学研究中的重要步骤,数据准备过程中常常需要进行复杂的数据解析。本文详尽地描述了在Perl语言环境下如何利用XML::Smart模块对NCBI发布的同源基因数据集HomoloGene进行解析提取其中目标数据的方法及其技巧。对单个XML项目用对象实例-{‘项目名’}解析;对同层有多个项目的情况用对象数组解析。     

科学家首次解析丙肝感染蛋白结构

近日。美国哈佛大学医学院、中科院上海生化与细胞所研究员周界文团队的一项研究,首次解析出丙型肝炎病毒（HCV）感染宿主过程中的一个重要蛋白——p7的精细空间结构,以及与其相互作用的一类抑制剂的分子机理,为丙肝药物的研制带来曙光,相关论文在《自然》杂志在线发表。     

水泥粉尘沉降对杉木等树种生长的影响

在受到水泥粉尘污染的约３０年生马尾松（ＰｉｎｕｓｍａｓｏｎｉａｎａＬａｍｂ．）、黑松（Ｐ．ｔｈｕｎｂｅｒｇｉＰａｒｌ．）和杉木〔Ｃｕｎｎｉｎｇｈａｍｉａｌａｎｃｅｏｌａｔａ（Ｌａｍｂ．）Ｈｏｏｋ．〕林地,各建立５０ｍ２样地,测定滞尘量,凿取水泥厂投产（１９８３年）前后各６年的木材样品,进行树干解析和有关元素含量的测定。结果表明,水泥粉尘对林木的高、胸径和材积的生长有抑制影响,并使木材中硅、钙、钾、磷含量增加,镁、铁、铝含量减少。这种影响随树种而异。     

玉米花粉多糖PMAⅠ的结构解析

从玉米花粉中分离得到一种多糖PMA I,经鉴定为单一纯多糖,通过IR、NMR、高碘酸氧化、Smith降解等手段对其结构进行了研究,确定PMA I主要以Rha,Xyl和GlcOMe组成,分子摩尔比Rha:Xyl:GlcOMe=12.7:2.1:1,以α(1→3)键为主链,以α(1→6)键构成分支结构。     

基于移动监测的城市环境大气黑碳浓度空间特征及来源解析

黑碳(BC)是大气细颗粒物的重要组分,对全球气候变化和人体健康有重要影响。本研究以上海市闵行区为研究区域,在电动出租车上安装MA200便携式黑碳仪和GPS定位系统组成移动观测平台,识别城市环境大气BC空间分布和热点区域,解析大气BC来源及影响因素。结果表明:上海市闵行区近地面大气BC空间分布格局总体呈现北高南低的特征,大气BC浓度平均值为(4.11±4.87) μg·m^-3,工作日与非工作日BC平均浓度分别为(4.22±1.49)和(3.52±2.26) μg·m^-3。大气BC浓度高值区变异性较大,移动观测中BC浓度升高与路段中交通偶发事件有关。除人类活动外,大范围的密集植被会对BC扩散产生抑制作用。波长吸收指数值为(0.82±0.54),更接近化石燃料燃烧波长吸收指数,化石燃料排放、生物质燃烧和混合源对于本研究中BC来源的贡献占比分别为67.5%、4.9%和27.6%。     

《自然》:研究解析嘌呤能受体与抗血栓药物复合物结构

<正>中科院上海药物研究所赵强和吴蓓丽研究团队日前首次解析了P2Y12受体与抗血栓药物复合物的高分辨率晶体结构。3月23日,相关研究成果在线发表于《自然》。血栓性疾病包括中风、冠心病、肺栓塞等各种疾病,是严重威胁人类生命健康的重要疾病之一。在血栓性疾病的发病过程中,嘌呤能受体P2Y12是刺激血栓形成的重要因子,因此其阻断剂也是当代医学研究的重点和热点之一。目前市场上靶向该受体的药物都存在一定的副作用或者不足,例如第四代P2Y12受体阻断剂可能导致病人呼吸困难。赵强表示,"P2Y12受     

三台花中的一新奇化合物--Serratumin A

从云南西双版纳产的三台花（Ｃｌｅｒｏｄｅｎｄｒｕｍ ｓｅｒｒａｔｕｍ ｖａｒ．ａｍｐｌｅｘｉｆｏｌｉｕｍ Ｍｏｌｄｅｎｋｅ）的地上部分分离到６个化合物,它们的结构通过波谱解析（包括２Ｄ ＮＭＲ技术）得到鉴定。其中化合物１是一新奇的单萜烯酸和单糖衍生物的缩合物,命名为ｓｅｒｒａｔｕｍｉｎ Ａ（１）;化合物２～６为首次从该植物中分离得到。