筛选选择性降解玉米秸皮的菌株

目的:筛选能选择性降解玉米秸皮的菌株,用于玉米秸皮生物机械法制浆的研究。方法:采用Bavendamm-PDA平板对玉米种植地土壤内的真菌进行初筛选,之后采用玉米秸皮降解实验对产生棕色变色圈的菌株和实验室现有白腐菌进行复筛选。结果:筛选到4株能在Bavendamm-PDA平板上产生棕色变色圈的菌株;降解实验显示杂色云芝引起了最大31.76%的重量损失,重量损失最小的菌株为粗毛栓菌lg-9;除杂色云芝和白耙齿菌降低了玉米秸皮苯醇抽出物外,其他处理样均增加;碳水化合物测定结果表明白耙齿菌处理样综纤维素的损失最大,且各种菌株所引起的综纤维素损失中,纤维素和聚戊糖损失所占的比例有很大差别。结论:粗毛栓菌lg-9对玉米秸皮木素降解的选择性最强,之后为Sd、黄袍原毛平革菌-14和黄袍原毛平革菌-25。     

征稿启事

《生物信息学》期刊主要刊载生物信息及相关领域的研究进展、综述、研究论文、研究简报、技术与方法、专题评论等学术文章。1.征稿范围:生物信息各分支领域及相关领域。包括基因组学、蛋白质组学、糖原组学、高通量药物筛选、组合化学、统计遗传学、生物数据挖掘、生物数据库、生物软件等。     

产γ -氨基丁酸乳酸菌的筛选及鉴定

从泡菜汁样品中初步筛选得到6株乳酸菌,采用纸层析和分光光度法对含1％谷氨酸的GYP发酵液中GABA含量分析,复筛得到一株产量较高的3#菌株,培养3d其GABA含量可达8.006 g/L.经形态学、生理生化特性分析及16S rDNA鉴定,所筛乳酸菌株为乳酸肠球菌.     

中草药α-葡萄糖苷酶抑制剂研究进展

葡萄糖苷酶抑制剂在控制餐后高血糖方面具有重要的作用。目前已发现的中草药中的α-葡萄糖苷酶抑制剂包括:黄酮类,生物碱类、多糖、酚类等化合物以及一些活性成分尚未确定的中草药。本文对以中药为来源的α-葡萄糖苷酶抑制剂及其体内外抑制作用的评价进行了综述。     

一株具有IMPDH抑制活性的稀有放线菌的筛选和鉴定

从重庆南川药用植物乌头根际土中分离到一株具有次黄嘌呤核苷磷酸脱氢酶(IMPDH)抑制活性的根际稀有放线菌株.通过菌株形态特征、培养特征观察、生理生化特征测定、细胞化学组分分析及16S rRNA基因序列同源性分析等多相分类特征研究,确定I06-03147属于动孢囊菌属(Kineosporia)的菌株.     

组蛋白去乙酰化酶6(HDAC6)抑制剂分子水平高通量筛选模型的建立

旨在建立分子水平HDAC6小分子抑制剂的高通量筛选模型,用于新型HDAC6特异性小分子抑制剂的发现。建立HDAC6的昆虫表达系统,分离纯化HDAC6蛋白,利用底物Boc-Lys(Ac)-AMC对纯化的HDAC6进行测活,并对测活体系进行优化,以SAHA为阳性抑制剂,确定适合高通量筛选的酶及底物浓度,反应时间等。首先构建HDAC6昆虫真核细胞表达载体,转入昆虫细胞中表达,并利用GST亲和柱纯化获得较高纯度的GST-HDAC6融合蛋白;建立体外HDAC6分子测活方法,表明昆虫表达的GST-HDAC6融合蛋白具有去乙酰化酶活性,并通过对多种参数优化使得Z’因子达到0.60,表明分子水平的HDAC6小分子抑制剂高通量筛选体系成功建立。     

植物抗逆诱变育种技术研究进展

随着分子生物学技术的飞速发展,通过基因工程方法可以更快更好地获得农作物抗逆新品种,其首要任务是通过分离相应的表型改变的突变体来鉴定、克隆在胁迫条件下表达模式发生改变的基因。主要介绍几种常用的及最新的突变体诱变和筛选技术,并分析每种技术的优缺点。     

表位疫苗的设计及应用研究进展

表位疫苗相对传统疫苗拥有较多优势,其最大的优点就是可以克服传统疫苗造成的毒力恢复或散毒的可能。另外表位疫苗本身无毒、稳定,符合未来疫苗发展的方向。表位疫苗的设计需要从表位的筛选、优化及表位的组合等多方面展开。现对表位疫苗的设计策略及应用作一介绍。     

一株微囊藻毒素降解菌的筛选及鉴定

从蓝藻爆发期间的巢湖底泥中筛选微囊藻毒素降解菌,为水体中藻毒素-LR(MC-LR)污染的生物治理提供有效的菌源。以MC-LR为唯一碳氮源,利用富集驯化培养技术分离筛选MC-LR降解菌,并对其进行形态观察、生理生化实验及16S rRNA序列分析鉴定。从巢湖底泥中分离得到一株藻毒素-LR降解菌株M6,生理生化实验及分子鉴定结果均表明,该菌株为蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus)。分离出的MC-LR降解菌为蜡状芽孢杆菌,该菌株对MC-LR有较高的降解能力。     

人IgG四亚类对噬菌体展示Ig结合蛋白单结构域随机组合文库的体外进化筛选

金黄色葡萄球菌蛋白A(Staphylococcal protein A,SpA)和链球菌蛋白G(Streptococcal protein G,SpG)是细菌产生的特异结合宿主抗体的细菌免疫球蛋白结合蛋白(Immunoglobulin(Ig)-binding proteins,IBPs)的代表分子。SpA和SpG均包含由多个序列高度同源的结合结构域重复组成的抗体结合区,各单结构域都具有完全的结合IgG的功能。为研究这些单结构域随机组合能否产生具有新结合特性的组合分子,将SpA的A、B、C、D、E以及SpG的B2、B3共7个单结合结构域随机组合构建成噬菌体展示文库后,应用人IgG1、2、3、4为诱饵分子对该文库进行4轮筛选,获得了SpA天然分子中不存在的单结构域排列组合分子D-C。在筛选过程中,阴性对照噬菌体的逐渐减少、展示两个结构域以上的噬菌体比例不断增多,尤其是D-C组合的选择性富集和其随机连接肽的严格筛选都显示了筛选的有效性和D-C组合的重要性。噬菌体ELISA进一步证实D-C与人IgG四亚类的结合能力远强于天然SpA分子。该研究应用分子进化技术首次获得了一种与人IgG四亚类具有结合优势的新型组合分子D-C,不仅可为IgG纯化、制备、检测等方面的应用提供新的候选分子,还为细菌IBP结构功能的进一步研究提供新的手段。