基于数据挖掘及网络药理学研究新安固本培元高频药对及其治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制CSCD

本文基于数据挖掘、网络药理学及分子对接方法,探讨新安固本培元高频药对人参-黄芪治疗慢性阻塞性肺疾病的分子机制。采用Apriori算法建立关联模型挖掘出人参-黄芪为新安固本培元高频药对。使用Cytoscape 3.7.2软件构建“化合物-靶点”网络、蛋白互作网络及进行拓扑分析。采用Metascape数据库,进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,筛选度值较高的“有效成分-靶点”进行分子对接。结果表明人参-黄芪有效成分33种,相关靶点206个,慢性阻塞性肺疾病靶点946个,获取目标靶点64个。GO分析共包含1629条生物过程、48条细胞组分、91条分子功能,247条KEGG富集结果。分子对接结果显示山奈酚、人参皂苷Rh及常春藤皂苷元能够与AKT1、IL6、CXCL8、MAPK1及TNF-α结合。本研究总结出人参-黄芪为新安固本培元医家治疗慢性阻塞肺疾病的高频药对,初步揭示了人参-黄芪治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制。     

肺微生物组在慢性阻塞性肺疾病中的研究进展CSCD

慢性阻塞性肺疾病（chronic obstructive pulmonary disease,COPD）是一种以持续的呼吸道症状和气流受限为主要特征的异质性疾病。新一代基因测序技术已经证明健康肺部存在庞大的微生物群落。越来越多的研究表明,肺微生物群失调与COPD的发生、急性加重次数及病死率有关。肺微生物可能通过调控炎症或免疫过程参与COPD的发病机制。全面了解肺微生物群在COPD不同阶段的动态变化和微生物与宿主的相互作用,有助于进一步揭示其在COPD发病机制中的作用。本文综述了肺微生物组在COPD中的研究进展,探讨其与COPD进展之间的关系及潜在的机制,以期开发有针对性的治疗方法。     

基于COⅠ基因对温州沿海岛屿疣荔枝螺遗传多样性研究

温州沿海岛屿众多,水文环境复杂,疣荔枝螺（Reishia clavigera）是岩相潮间带常见种,对其群体间遗传多样性的分析,有助于合理保护和开发利用种质资源。本实验对温州沿海14个典型岛屿的158个疣荔枝螺个体,进行细胞色素氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ）基因片段序列测定,得到158 条长度为672 bp的序列,A、T、C、G 四种碱基含量分别为23.0%、38.4%、17.4%和21.2%。共检测到保守位点562个,变异位点108 个,其中包括简约信息位点57 个,单突变位点51 个。所有个体的核苷酸多样性指数Pi为0.008 0 ± 0.029 7,单倍型多样性为指数Hd为0.978 ± 0.006,平均核苷酸差异度为5.328。群体间遗传距离在0.005 7 ~ 0.011 1之间,群体内遗传距离在0.005 7 ~ 0.010 8之间,不同疣荔枝螺群体之间的遗传距离处于同一水平。霓屿岛和大竹峙岛群体内遗传距离最小,洞头岛群体内遗传距离最大。共检测到102 个单倍型,大部分单倍型聚合为一支,没有形成明显的区系结构,各个岛屿的疣荔枝螺存在基因交流。     

十一种无尾两栖类物种皮肤和肺显微结构

无尾两栖类动物的呼吸方式为肺呼吸和皮肤辅助呼吸,为探究两种呼吸器官的显微结构,本文采用解剖学和组织学的方法,对大蹼铃蟾(Bombina maxima)、腺角蟾(Megophrys glandulosa)、中华蟾蜍(Bufo gargarizans)、华西雨蛙(Hyla gongshanensis)、昭觉林蛙(Rana chaochiaoensis)、滇蛙(Dianrana pleuraden)、双团棘胸蛙(Gynandropaa yunnanensis)、贡山树蛙(Rhacophorus gongshanensis)、斑腿泛树蛙(Polypedates megacephalus)、饰纹姬蛙(Microhyla fissipes)、多疣狭口蛙(Kaloula verrucosa)的皮肤和肺的形态及显微结构进行观察。结果显示,背部和腹部皮下可见血管交错成网状,皮肤由表皮层和真皮层构成。除华西雨蛙外,其余10种均有分布于真皮疏松层与致密层间的钙化层;色素细胞位于疏松层上层,体背色素层较发达。肺囊状,中空密布血管,分为大小相当的左右肺叶,两肺叶相通并与心粘连,无气管和支气管。肺由肺囊壁、隔膜、毛细血管、肺泡细胞等结构组成。肺囊壁分为胸膜层、中间层和内层:胸膜层由扁平细胞构成,中间层由结缔组织构成,内层由肺细胞和毛细血管组成,隔膜由毛细血管和结缔组织构成,游离隔膜向中部靠拢可形成半封闭腔室,结合隔膜与肺囊壁形成封闭小腔室。在这11个物种中,肺较发达的个体,其皮肤结构中黏液腺的数量就会相对较少,组织形态学特征表现出与环境适应性关系较大,而受到系统发育关系影响较小。     

HNRNPC可能成为肺腺癌独立的预后因子

为探讨RNA m⁶A甲基化调节因子在肺腺癌中的作用,从TCGA数据库下载肺腺癌患者的RNA表达数据和临床数据。通过limma软件包分析12种m⁶A调节剂的表达情况。使用Pheatmap、vioplot和corrplot软件包生成热图、小提琴图和表达相关图。采用Kaplan-Meier方法分别计算肺腺癌中12种RNA m⁶A调节因子的生存曲线。使用Cox回归和Kaplan-Meier方法分析TCGA肺腺癌患者的总体存活相关的临床病理学特征。最后用Kruskal(KS)检验和logistic回归分析临床病理学特征与HNRNPC表达的关系。 在肺腺癌的TCGA队列中,发现HNRNPC、WTAP、YTHDF3、FTO、ZC3H13、METTL14、METTL3、YTHDF1、YTHDF2这些基因是差异表达的。Kaplan-Meier生存分析显示,在这些差异表达的基因中仅仅HNRNPC和YTHDF2的表达与生存显著相关。然后,通过多因素Cox回归结果表明HNRNPC的表达在肺腺癌TCGA队列中是个独立危险因素。最后,HNRNPC在肺腺癌中的表达与临床分期(IV vs I, OR=3.692 308)和组织浸润(T2 vs T1, OR=1.776 471;T4 vs T1, OR=6.303 03)显著相关(所有p<0.05)。 结论认为HNRNPC可能作为肺腺癌的独立的预后因子。     

扁玉螺中枢神经系统解剖及显微结构观察

对扁玉螺(Neverita didyma)中枢神经系统的大体解剖和显微结构进行了初步研究。结果表明,扁玉螺中枢神经系统包括一对口球神经节、一对脑神经节、一对侧神经节、一对足神经节及一个脏神经节。各神经节均由神经节被膜、胞体区及中央纤维网三部分组成。左右脑神经节之间和左右足神经节之间的联合以及脑-侧、脑-足和侧-足神经节之间的连索均较短。足神经节有明显的分区现象。     

降钙素基因相关肽通过增加自噬对抗新生大鼠氧化应激性肺损伤

本研究组前期研究显示,降钙素基因相关肽(calcitonin gene-related peptide, CGRP)对高氧诱导的氧化应激性肺损伤具有保护作用。本研究旨在探讨细胞自噬是否参与CGRP对新生大鼠氧化应激性肺损伤的保护作用。新生Sprague-Dawley (SD)大鼠随机分为5组：空气对照组(Control组)、高氧损伤模型组(Model组)、CGRP干预组(Model+CGRP组)、Model+CGRP+自噬激动剂组(Model+CGRP+Rapamycin组)和Model+CGRP+自噬抑制剂组(Model+CGRP+LY294002组)。采用新生SD大鼠持续吸氧(吸入氧浓度百分比FiO2为90%～95%)14天的方法制备氧化应激性肺损伤模型。苏木精-伊红(HE)染色观察肺组织病理变化并测定肺泡平均线性截距(mean linear intercept, MLI)。透射电镜观察肺泡II型上皮细胞(type II alveolar epithelial cell,AECII)内自噬囊泡数量改变。Western blot检测肺组织裂解液中Caspase-3、Bcl-2、mTO...     

小鼠Ⅱ型肺泡上皮细胞类器官三维培养体系的建立

本研究旨在建立小鼠Ⅱ型肺泡上皮细胞(type 2 alveolar epithelial cells, AT2)类器官三维(three-dimensional, 3D)培养体系的方法。采用酶消化与磁珠分选分离和纯化ICR小鼠肺AT2细胞,proSPC免疫荧光染色鉴定AT2细胞纯度;2维(two-dimensional, 2D)培养8 d,5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷(5-ethynyl-2’-deoxyuridine, EdU)掺入和荧光染色法观察AT2细胞的增殖与分化;将AT2细胞与小鼠肺成纤维细胞(mouse lung fibroblasts, Mlg) 3D共培养,光学显微镜下观察类器官生长情况,收集生长13d的类器官,2%多聚甲醛固定后行HE染色,荧光染色观察类器官内部形态结构。结果显示,提取AT2细胞纯度超过95%;在体外培养1～8 d期间,AT2细胞EdU荧光染色阴性,未见增殖;AT2细胞形状逐渐趋向扁平鳞状、细胞表面积显著增大;在体外培养3 d后,有部分AT2细胞特异性标志物proSPC阳性细胞开始出现I型肺泡上皮细胞(type 1 alveolar epithelia...     

嗜肺军团菌调控宿主非折叠蛋白反应的研究进展

内质网作为细胞内重要的细胞器之一,参与胞内蛋白的成熟及转运,其稳态与细胞的存活及免疫反应密切相关.非折叠蛋白反应是维持内质网稳态的重要机制之一,参与细胞的天然免疫反应,在宿主细胞抵抗病原体入侵中具有重要作用.嗜肺军团菌是一种革兰氏阴性致病菌,能够感染人体肺泡巨噬细胞引起严重肺炎,即军团菌病.在入侵宿主细胞后,嗜肺军团菌通过其Ⅳ型分泌系统将330多个效应蛋白转运至宿主细胞中,干扰宿主细胞的多种细胞进程,以形成其生存和复制所需的场所——含嗜肺军团菌囊泡(Legionella-containing vacuole, LCV).LCV的形成与宿主细胞的内质网密切相关.本文主要从嗜肺军团菌的致病机制、细胞非折叠蛋白反应及其与病原体的关系、军团菌对宿主细胞的非折叠蛋白反应的调控等方面进行综述,以期为揭示病原体与内质网应激之间的关系提供参考.     

传统Cronquist系统的泽泻亚纲在APGⅣ系统中的地位

APGⅣ(2016)系统对Cronquist(1981)系统中的泽泻亚纲作出了适当调整,得到了经典分类和分子数据的支持,这是较理想的状态.1)APGⅣ系统将天南星科并入泽泻目,将天南星科的菖蒲属独立为菖蒲目,成为单子叶植物基部群,得到了胚胎学、分子数据的支持;而苞片分化等形态特征揭示了菖蒲属和天南星科其他属不同.2)岩...