池蝶蚌致雄性化基因fem-1c及其蛋白分子的结构特征分析

研究首次获得淡水珍珠贝池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)的致雄性化基因feminization-1C亚型,即fem-1c基因,并进行全长克隆及序列分析。从转录组中Race-PCR扩增fem-1c基因全长cDNA序列,用生物信息学方法对fem-1c基因进行基因组结构分析、多序列同源性比较、跨膜区段、亲疏水性分析、功能结构域预测等。研究结果如下:该cDNA序列全长2328 bp,包含一个1869 bp的最大开放阅读框,编码622个氨基酸,经同源比对和进化树分析,fem-1基因c亚型编码的氨基酸与太平洋牡蛎的同源性最高,为79%;疏水性分析显示该蛋白为亲水性蛋白;二级结构预测发现该蛋白有大量的α螺旋和随机卷曲,形成9个锚蛋白重复序列(Ankyrin repeat,ANK),同时,三级结构预测中可以清楚的看到9个ANK模体,跟SMART预测的结构位点结果相近。从无脊椎动物到脊椎动物fem-1c基因的保守性表明它们有共同的起源,暗示这个基因家族在功能上具备保守性,推测池蝶蚌fem-1c基因可能具备与线虫fem-1基因在性别决定方面上相似的功能。     

落叶型大丽轮枝菌T-DNA插入突变体库的构建

采用ATMT技术建立大丽轮枝菌落叶型菌株XJ2008菌株的T-DNA插入突变体文库,共获得6 043个突变体。从中随机挑选104个突变体,以野生型XJ2008菌株为参照,评价其致病性、菌落生长速率、分生孢子及微菌核的产生能力等。结果表明,有12.5%的突变体丧失产孢能力,4.8%的突变体的生长速率显著减慢,8.7%的突变体的生长速率显著加快,12.5%的突变体丧失产生微菌核的能力,47.1%的突变体的致病性显著低于野生型菌株XJ2008,且突变体2-736、2-740、2-745的病情指数分别约为野生型菌株XJ2008的0.184、0.168和0.197倍。该突变体库突变体遗传稳定性好,性状多样性丰富。     

三角帆蚌金属硫蛋白基因的克隆及序列分析

采用RACE技术,获得了三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)金属硫蛋白基因的全长cDNA序列.该序列全长467 bp,由长92 bp的5'UTR(untranslated region),159 bp的3'UTR,和216 bp的开放阅读框(openreading frame,ORF)组成.共编码71个氨基酸,分子量大约为7.1 ku,理论等电点为7.24.该蛋白序列中半胱氨酸含量最丰富(29.6%),其次是甘氨酸(14.1%),存在软体动物金属硫蛋白的特征序列CKCXXXCXCX,且C-末端的氨基酸序列也符合软体动物金属硫蛋白标签序列C-X-C-X(3)-C-T-G-X(3)-C-X-C-X(3)-C-X-C-K.蛋白序列特征分析表明,该序列与其他贝类的金属硫蛋白基因具有很高的相似性,具备金属硫蛋白的典型特征,是金属硫蛋白家族的成员.     

奥尼罗非鱼寄生单殖吸虫中国二新纪录属(锚首虫科)

记述了锚首虫科Ancyrocephalidae单殖吸虫中国2新记录属、2新纪录种,即嗜丽鱼虫属Cichlidogyrus Paperna,1960,几丁嗜丽鱼虫Cichlidogyrus sclernsus Paperna ＆ Thurston,1969;盾形片虫属Scutogyrus Pariselle ＆ Euzet,1995,长角盾形片虫Scutogyrus tongicornis（Paperna＆Thurston,1969）Pariselle＆Euzet,1995。对新纪录属种作了新的形态描述并给出特征图。围绕此2属分类学地位的争议性问题,结合分子系统学的研究作以下推测：其一,盾形片虫属可能应与嗜丽鱼虫属合并;其二,鉴于28SrDNA变异较小,2属可能是最近才分化出的两个分类单元,并处在物种形成活跃期。     

丽格海棠组培苗离体生根的研究

为了建立有效的丽格海棠组培苗离体生根系统,降低培育丽格海棠组培苗离体生根的成本,对基本培养基的不同离子强度、白糖浓度以及培育琼脂浓度对丽格海棠的组培苗离体生根进行了研究。研究发现,培养基的基本离子强度和白糖浓度对丽格海棠组培苗的离体生根有一定的影响,从降低成本的角度考虑,1/4MS培养基为最佳的培养基,15 g·L^-1的白糖为最佳的白糖浓度。所采用的琼脂浓度对丽格海棠组培苗的离体生根没产生明显的影响,从降低成本的角度选择3 g·L^-1的琼脂为最佳的琼脂浓度。     

吉林省担子菌补记(七)

报道了吉林省新记录分布担子菌6种,即肉褐鳞环柄菇(Lepiota brunneoincarnataChodat&C.Martín)、短柄金舌囊蘑[Melanoleuca brevipes(Bull.)Pat]、紫皮丽蘑[Calocybe ionides(Bull.)Donk]、皮尔松湿伞(HygrophoruspersooniiArnolds)、微黄拟锁瑚菌[Clavulinopsis helvola(Pers.)]和弹球菌(Sphaerobolus stellatusTode)。其中,弹球菌属为吉林省新记录属。凭证标本存放于吉林农业大学菌物标本馆(HMJAU)。     

5种寄生蚌螨COI基因片段序列及系统发育分析

采用PCR技术对5种寄生蚌螨COI基因片段进行序列测定.序列分析的结果表明,比对后的序列总长度均为658 bp;其中A、G、C、T 4种碱基的平均含量分别为34.6%、20.2%、14.3%、30.9%,平均嘧啶含量（65.5%）明显高于嘌呤含量（34.5%）,说明碱基存在偏向性.弯弓蚌螨Unionicola arcuata与Y纹蚌螨U.ypsilophora 的种间遗传差异为26.4%,达到属间分类水平,结果支持Vidrine将沃蚌螨亚属从寄蚌螨亚属中分离的修订;螫爪蚌螨U.chelata与敏捷蚌螨U.agilex之间遗传差异为23.3%,达到属间分类水平,结果支持文春根等将敏捷蚌螨与其姊妹种腰蚌螨U.lumbaria放入韦蚌螨亚属中的修订.以营自由生活的厚蚌螨U.crassipes作为外类群,使用PAUP4.0b 10软件中的最大似然法（ML）和邻接法（NJ）构建系统树,结果显示：在5种寄生蚌螨中敏捷蚌螨可能是最早从祖先种分化出来的种;弯弓蚌螨与Y纹蚌螨可能起源于蚌螨属的同一个祖先.     

孕育对褶纹冠蚌滤食率的影响及鳃微结构变化

对比了褶纹冠蚌(Cristaria plicata)孕育蚌、未孕雌蚌和雄蚌的滤食率,并运用组织学、扫描电镜和透射电镜对实验蚌的鳃结构进行比较观察,以此探讨鳃结构变化对滤食功能的影响。滤食实验结果表明:孕育事件显著降低了雌蚌的滤食率,而未孕雌蚌与雄蚌的滤食率无显著差异。孕育雌蚌内外鳃均由两鳃小瓣愈合而成,每一鳃小瓣由成排的鳃丝组成,在中介区鳃丝之间通过丝间隔连接,在内部侧区则通过瓣间隔相连。雌蚌内鳃的鳃间隔为外鳃的2～3倍,而雄蚌的内外鳃无差异。孕育雌蚌外鳃在初级水管、瓣间隔等出现明显的变化,并出现了二级水管结构,而内鳃未发现显著变化。扫描电镜显示:在褶纹冠蚌鳃丝表面存在3种类型的纤毛(前纤毛、前侧纤毛和侧纤毛),其形态结构和分布各具特点,长径58～85μm椭圆形的鳃小孔成排相间分布于鳃丝之间,而3组实验蚌的内外鳃丝之间无明显差异。透射电镜观察发现:孕育雌蚌鳃丝表皮细胞表面形成突起,显著增加了表面微绒毛的数量,可能有利于雌蚌在孕育期间由于初级水管转化成育儿囊后对呼吸、滤食等功能的补偿,与其他蚌科物种报道类似。综合实验表明,孕育雌蚌外鳃结构的变化,尤其是初级水管的结构改变和二级水管、鳃丝表面褶皱的出现可能是影响孕育雌蚌滤食功能的主要原因。     

池蝶蚌HsPif基因的克隆及表达分析

为了探究池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)酸性基质蛋白Pif基因的基本功能,研究通过RACE-PCR技术首次在池蝶蚌中获得了Pif基因的cDNA全长序列,命名为HsPif,其全长为3457 bp, 5′端非翻译区(5′UTR)为485 bp,3′端非翻译区(3′UTR)为363 bp,开放阅读框(ORF)3072 bp,共编码1023个氨基酸,生物信息学分析结果显示HsPif蛋白含有一个von-Willebrand因子A型结构域和三个几丁质结合结构域;氨基酸组成成分结果表明天冬氨酸含量最高,组氨酸含量最低; HsPif蛋白亲水指数为–0.566,为亲水蛋白。构建系统进化树分析显示Pif基因保守性较高,与三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)Pif相似度最高,且与其他贝类在同一个大支上。组织荧光定量PCR结果表明:HsPif基因主要在外套膜中表达;分子原位杂交显示杂交反应主要在外套膜上皮细胞发生。进行植核手术后进行qPCR检测HsPif基因的表达量变化,实验结果表明, HsPif基因可能与珍珠层的分泌有关,有助于进一步了解珍珠形成的机制,为珍珠养殖提供参考。     

几种生物CaCO3霰石结晶的取向性

CaCO3结晶广泛分布于生物界,其主要结晶形式为方解石、霰石及球霰石。用X－射线衍射法对三角帆蚌及合浦珍珠母贝的珍珠层、墨鱼骨和大黄鱼耳石的CaCO3结晶进行测定,发现各样品均有一定取向性,以三角帆蚌和合浦珍珠母贝珍珠层的取向性为最强,墨鱼骨的取向性次之,大黄鱼耳石的取向性最小,以上材料粉末样的衍射分析表明,各样品对应d值间差异极小,均为X射线衍射卡（5－0453）所表征的CaCO3霰石结构。