基于同位素标记相对和绝对定量技术研究耐铬(VI)菌株CM01的蛋白定量组学

【背景】六价铬[Cr(VI)]作为一种高毒性的重金属污染物,用微生物学方法还原Cr(VI)既经济又环保。【目的】探究耐铬菌株CM01中与耐受或还原铬Cr(VI)有关的蛋白或基因,从分子水平上阐述其耐铬Cr(VI)机制。【方法】运用同位素标记相对和绝对定量技术(isobarictagsforrelativeand absolute quantitation techniques,iTRAQ)分析耐铬菌株CM01在有无铬Cr(VI)胁迫下的蛋白表达差异。运用RT-qPCR技术验证4种与代谢途径有关的上调蛋白的m RNA表达量。运用紫外分光光度计测定细胞表面疏水性。【结果】共鉴定到2 570个蛋白,其中存在显著差异的蛋白数为646个,上调蛋白数量343个,下调蛋白数量303个。CM01中的Fe/Mn超氧化物歧化酶、甜菜碱醛脱氢酶、磷酸戊糖途径、磷酸肌醇代谢途径、氨基酸代谢共同参与了菌株对于外源性Cr(VI)的响应机制。RT-qPCR实验结果表明,与代谢途径有关的4种蛋白其基因转录水平和蛋白水平一致。对照组CM01的细胞表面疏水性高于实验组。【结论】初步探索了耐铬菌的Cr(VI)响应机制,为利用微生物治理环境污染提供了理论支持和新的研究思路。     

内蒙古典型草原几种不同植物的生长动态比较

选择内蒙古典型草原羊草 大针茅群落中的优势植物羊草、大针茅、冰草和冷蒿,采用多种数量化指标,分别比较一个生长季内的生长动态、绝对生长速率(AGR)、相对生长速率(RGR)。结果表明:植物地上生物量均呈S形增长,8月中旬达到最大值;主要生长季内受降水不足的抑制作用依次为羊草>冰草>大针茅>冷蒿。羊草和冰草AGR均呈双峰曲线,大针茅呈三峰曲线,冷蒿呈单峰曲线。生长主要集中在中前期,AGR大小依次为冷蒿(0.099g.株-1.d-1)>大针茅(0.029g.株-1.d-1)>羊草(0.003g.株-1.d-1)>冰草(0.002g.株-1.d-1)。RGR与AGR有相似的季节性变化,其中羊草、冰草、冷蒿RGR均呈单峰曲线,大针茅呈三峰曲线;生长季初期RGR均表现出最高,生长潜能较大,7月末至8月中旬呈现负值;4种植物的最大净积累效率依次为冷蒿(0.108g.株-1.d-1.g-1)>大针茅(0.064g.株-1.d-1.g-1)>羊草(0.055g.株-1.d-1.g-1)>冰草(0.042g.株-1.d-1.g-1)。不同生活型的生长曲线及生长速率均存在较大差异,但同属于根茎型的羊草和冰草生长动态曲线明显相似。     

白蜡虫体内杀雄菌属(Arsenophonus)共生菌的分子检测

[目的]研究白蜡虫体内杀雄菌属(Arsenophonus)共生菌的含量与白蜡虫性比之间的关系.[方法]采用16S rDNA文库的方法对白蜡虫雄虫体内的共生菌进行分析,利用杀雄菌属特异的2条16S rDNA引物以及23S rDNA引物进行PCR检测.对昭通、昆明、金口河、杭州、长春、江华6个不同地理种群白蜡虫体内的杀雄菌属共生菌进行半定量分析,并采用荧光定量PCR对昭通、昆明、金口河白蜡虫体内的杀雄菌属共生菌进行绝对定量分析.[结果]在白蜡虫体内首次发现杀雄菌属共生菌.在白蜡虫雌雄虫体内均扩增出杀雄菌属的两条不同长度的16S rDNA序列,分别为445bp和1462bp,并扩增得到长度为582bp的23S rDNA序列.杭州和江华地理种群白蜡虫的一些个体不含杀雄菌属共生菌.昭通地理群的杀雄菌属共生菌含量显著高于金口河和昆明,而昆明和金口河白蜡虫的杀雄菌属含量无显著差异.[结论]白蜡虫体内杀雄菌属共生菌的含量与白蜡虫性比无关.     

论文“甲烷氧化菌20Z利用Embden-Meyerhof-Parnas途径高效同化甲烷”的撤稿声明

<正>崔金玉等发表在《生物工程学报》的论文:甲烷氧化菌20Z利用Embden-Meyerhof-Parnas途径高效同化甲烷(2014,30(1):43-54),因作者提出该论文中所述部分研究方法学应用于该细菌尚有缺陷,可能导致相关的研究结果 (详见作者来信)存在较大偏差,考虑到科学研究的严谨性和真实性,为了不对该领域同行和其他读者造成误导,本刊尊重作者请求撤销该论文,特此声明。编委会同时对作者实事求是,有错即纠的科学态度表示赞赏和肯定。     

（普通小麦×山羊草）F1用普通小麦回交的初步研究

对（普通小麦×山羊草）F1用“中国春”（CS）进行回交的结实率与普通小麦×山羊草的结实率,F1二价体频率的高低与回交结实率无明显关系。山羊草的染色体组C可能促进回交结实。M0抑制回交结实。而和普通小麦同源的染色体组D无明显地促进回交结实作用。SvMcr染色体组既不促进也不抑制回交结实。     

猴类pERT87-15位点的多态性分析

应用人X染色体上的pERT87-15DNA探针,分析了猕猴属的猕猴、豚尾猕猴、熊猴、毛面短尾猴和红面短尾猴等共5种89只猴子的基因组DNA,首次发现在相当于人类 pERT87-15的位点上存在着3个“等距”的多态性位点。单体型分析提示这3个多态位点位于其X染色体上。这些结果表明,人类某些基因组探针也可适用于某些灵长类动物基因组DNA的多态性分析,并为研究动物DNA及其种系发生提供了新的信息。     

Relationship between photochemical reflectance index with multi-angle hyper-spectrum and light use efficiency in urban green-land ecosystems

Aims Light-use efficiency (LUE) is one of critical parameters in the terrestrial ecosystem production studies. Accurate determination of LUE is very important for LUE models to simulate gross primary productivity (GPP) at regional and global scales. We used eddy covariance technique measurement and tower-based, multi-angular spectro-radiometer observations in autumn 2012 to explore the relationship between bidirectional reflectance distribution function (BRDF) corrected photochemical reflectance index (PRI) and LUE in different phenology and environment conditions in urban green-land ecosystems. Methods Using the eddy covariance technique, we estimated the temporal changes in GPP during the autumn 2012 over Beijing Olympic Forest Park. LUE was calculated as the ratio of GPP to the difference between incoming photosynthetically active radiation (PAR) and PAR reflected from the canopy. Daily PRI values were averaged from the BRDF using semi-empirical kernel driven models. The absolute greenness index (2G_RB) was made by webcam at a constant view zenith and view azimuth angle at solar noon. The logistic function was used to fit the time series of the greenness index. The onset of phonological stages was defined as the point when the curvature reached its maximum value. Important findings Webcamera-observed greenness index (2G_RB) showed a decreasing trend. There was a highly significant relationship between 2G_RB and air temperature (R² = 0.60, p < 0.001). This demonstrates that air temperature is the main driving factor to determine the phenology. PRI estimated from multi-angle hyper-spectrum can estimate LUE in urban green-land ecosystems in vigorous photosynthetic period. The correlation was the strongest (R² = 0.70, p < 0.001) in the peak photosynthetic period. PRI relates better to LUE under high temperature (>15 °C) with high vapour pressure deficit (VPD) (>700 Pa) and high PAR (>300 μmol·m^-2·s^-1). The LUE was up-scaled to landscape/regional scales based on these relationships and phenology. It can also be used for the estimation of GPP of urban green-land with high accuracy.     

医患纠纷私力救济盛行的原因分析及对策研究

以医闹为主的医患纠纷私力救济不利于医患纠纷公正解决,具有违法性。私力救济成本低、效率高的特点、现有解决渠道不畅、法律建设缺陷等是导致医患纠纷私力救济盛行的原因。通过打击医闹行为、提高私力救济违法成本,完善法律建设、拓展医患纠纷解决渠道等措施可以有效预防减少私力救济的发生。     

G蛋白偶联受体及其类型的预测

G蛋白偶联受体是非常重要的信号分子受体,其功能失调会导致许多疾病的产生。在前期工作的基础上,作者将序列特征分析与支持向量机技术结合起来,通过分析序列的特征差异,对G蛋白偶联受体分子及其类型进行识别。首次提取了G蛋白偶联受体对应的mRNA序列的绝对密码子使用频率作为特征,这主要因为它既包含了基因密码子使用偏性的信息,也包含了基因所编码蛋白的氨基酸组成信息。结果显示：在G蛋白偶联受体序列及其类型预测的问题中,设计支持向量机分类器时,最好选择使用包含基因序列绝对密码子使用频率和蛋白序列双联氨基酸使用频率两部分信息的组合特征作为特征,同时采用径向基核作为核函数。     

同位素稀释法在绝对定量蛋白质组中的研究进展

绝对定量蛋白质组是指基于蛋白质组学方法对细胞、组织或体液中的蛋白质进行绝对量或浓度测定．目前,常用的绝对定量方法主要有基于同位素稀释法的蛋白质组学绝对定量方法和基于质谱数据统计分析的非标记方法．基于同位素稀释法的绝对定量方法是用已知量的同位素标记物对与其混合的样本蛋白质浓度进行测定．常见的同位素标记物包括：由AQUA法、QconCAT法产生的特异性水解肽段,由PSAQ法、Absolute SILAC法产生的标记蛋白和由PrESTs-SILAC法产生的蛋白抗原表位标签．由于同位素稀释法可以对蛋白质进行准确和精确定量,对于临床疾病的诊断和治疗具有明显的现实意义．本文对同位素稀释法在绝对定量蛋白质组中的研究进展及其优缺点和最新应用进行了评述．