CAAT结合蛋白CBF在转录中的作用

ＣＡＡＴ结构是一种在真核生物启动子中普遍存在的顺式作用元件。ＣＢＦ,又称为ＮＦ -Ｙ、ＣＰ１,是一个ＣＡＡＴ特异性转录因子。在转录过程中 ,ＣＢＦ与ＣＡＡＴ特异性结合 ,共同调控启动子的转录 ,本文综述了ＣＢＦ的结构及其在转录中的作用。１ＣＡＡＴ结构ＣＡＡＴ结构存在于由ＲＮＡ聚合酶Ⅱ所转录的大多数真核生物基因的近端启动子中〔１〕,它与其他的启动子元件相互协调 ,一起控制启动子的转录活性。在高等的真核细胞启动子中 ,ＣＡＡＴ一般位于 -８０区〔２〕。对不同物种的某些基因进行比较 ,发现ＣＡＡＴ结构在启动子上的位置以…     

Computational approaches to understanding protein aggregation in neurodegeneration

The generation of toxic non-native protein conformers has emerged as a unifying thread among disorders such as Alzheimer＇s disease, Parkinson＇s disease, and amyotrophic lateral sclerosis. Atomic-level detail regarding dynamical changes that facilitate protein aggre- gation, as well as the structural features of large-scale ordered aggregates and soluble non-native oligomers, would contribute signifi- cantly to current understanding of these complex phenomena and offer potential strategies for inhibiting formation of cytotoxic species. However, experimental limitations often preclude the acquisition of high-resolution structural and mechanistic information for aggregating systems. Computational methods, particularly those combine both aU-atom and coarse-grained simulations to cover a wide range of time and length scales, have thus emerged as crucial tools for investigating protein aggregation. Here we review the current state of computational methodology for the study of protein self-assembly, with a focus on the application of these methods toward understanding of protein aggregates in human neurodegenerative disorders.     

甘肃马鹿myogenin基因克隆、序列结构特征预测及其分子系统进化分析

根据GenBank中公布的绵羊、水牛、猪、小鼠及人的肌细胞生成素基因(myogenin)DNA序列,设计了3对引物,采用PCR扩增和克隆技术,首次从甘肃马鹿血液基因组中获得了myogenin基因序列,并利用生物信息学方法对甘肃马鹿该基因核苷酸及其编码氨基酸序列的结构特征进行初步预测和分析,进一步基于该基因氨基酸序列构建了15个物种的分子系统进化树。结果表明,获得的甘肃马鹿myogenin基因序列大小为3168bp(GenBank登录号:FJ746497),包括3个外显子、2个内含子、部分5'UTR和3'UTR,其序列包括1个684bp的开放阅读框,编码227个氨基酸,myogenin蛋白理论分子质量为25.2493kDa,PI为5.68,不稳定系数是66.22,属于酸性不稳定蛋白质。进一步分析发现,该序列不含有信号肽和跨膜区域,含有11个广泛磷酸化位点,第1～136个氨基酸为甘肃马鹿myogenin基因bHLH保守结构功能域,二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主。序列相似性及分子系统进化分析显示,甘肃马鹿myogenin基因与反刍动物山羊、绵羊和水牛的亲缘关系最近。甘肃马鹿myogenin基因的克隆及序列结构特征的生物信息学预测为进一步探讨鹿科动物肌肉生长发育的分子调控机理奠定了理论基础。     

走进婆罗洲（马来西亚）热带再林

热带雨林具有独特的外貌和结构特征,与世界上其他森林类型有清楚的区别,它主要生长在年平均温度24℃以上、或者最冷月平均温度18℃以上的热带潮湿低地。在世界上,热带雨林主要分布在美洲、亚洲和非洲的热带地区。     

木犀科植物叶绿体基因组结构特征和系统发育关系

木犀科11属19个种叶绿体基因组的一般特征和变异特征的比较分析显示, 结果表明, 该科叶绿体基因组大小为154-165 kb, 其差异主要是大单拷贝(LSC)长度的差异所致。Jasminum属3个物种的叶绿体基因组长度与其余物种有较大差异, 该属clpP基因内含子和accD基因丢失。共线性分析表明, Jasminum属3个物种多个基因出现基因重排现象, 倒位可能是重排的主要原因。Jasminum属在IRb/SSC和SSC/IRa边界的基因均与其它物种不同; 重复序列与SSR数量检测结果表明, Jasminum属与其余物种在数量及重复长度上差异较大。基于CDS数据构建的系统发育树表明, Abeliophyllum distichum和Forsythia suspensa为木犀科中较早分化的类群。     

大夏河临夏段肉鞭虫群落结构特征及其与水质的相互关系

2005年2月-2007年3月对大夏河临夏段的肉鞭虫物种多样性和分布特征进行了研究.结果表明:大夏河临夏段的肉鞭虫共记录135种,隶属于5纲16目,其中优势类群为眼虫目(Euglenida)和变形目(Amoebida);大夏河临夏段同一水期不同采样点之间以及不同水期同一采样点之间群落相似性系数均较低,均表现出明显的空间异质性;肉鞭虫群落结构特征表明,大夏河临夏段水体已受到不同程度的污染,枯水期较丰水期污染严重.     

莲花山主要森林群落空间格局的分形特征

应用信息维数对莲花山主要森林群落的空间格局进行了研究.结果表明:森林群落的格局强度尺度变化程度由高至低的次序为:岷江冷杉一糙皮桦一白桦群落(Q4)1.84＞云杉-紫果云杉-糙皮桦群落(Q2)1.53＞岷江冷杉群落(Q3)1.14＞紫果云杉-云杉-岷江冷杉群落(Q7)1.10＞华山松群落(Q5)0.99＞岷江冷杉人工林(Q1)0.82＞辽东栎群落(Q6)0.45;群落格局信息维数的差异反映了更新状况的差异,揭示出群落个体分布的非均匀性状况.综合3种分形维数,确定各亚高山寒温性森林群落生长与更新状况的次序为Q4＞Q2＞Q3＞Q7＞Q5＞Q1＞Q6.各群落总体平均记盒维数为1.76,关联维数为1.71,信息维数为1.12;各森林群落生长状况较好,个体聚集程度较低,更新状况一般.分形维数谱将不同森林群落的空间结构特征明确区分开来.     

转铜伴侣的功能与结构特性

铜是生物体不可缺少的一种元素,在细胞内把铜转运到含铜的蛋白质是细胞正常代谢的基本要求,转铜伴铝在体内执行重要的生理功能,它们不但保护细胞免受游离铜离子的有害作用。而且也确保铜被运输到其特异的靶蛋白。作者综述了转铜伴铝的功能、结构特性,以及可能的金属转移机制。     

乳铁多肽,一种具有潜在抗菌能力的活性多肽

乳铁多肽(1actoferricin,Lfcin)是具有广谱杀菌,抑真菌,抑病毒,抑杀肿瘤细胞等作用的一类活性多肽,是乳铁蛋白(lactoferrin,Lf)经蛋白酶水解而产生的。该主要介绍Lfcin的来源、结构特征、生物学功能及机制等方面的研究进展。