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81.
羽叶金合欢的DNA提取和SSR引物筛选 总被引:2,自引:0,他引:2
利用SSR分子标记对羽叶金合欢( Acacia pennata )的野生种和栽培种进行了分析,利用改良的CTAB方法优化了其总DNA的提取方法,并优化了PCR扩增条件.从已有的金合欢属植物的82对SSR引物中筛选出多态性高,稳定性好的12对引物作为羽叶金合欢的SSR分析引物,为进一步对其进行遗传多样性研究提供了依据. 相似文献
82.
83.
多发性骨髓瘤细胞中一个表达上调基因的克隆与分析 总被引:1,自引:0,他引:1
根据GenBank收录的多发性骨髓瘤细胞株 (ARH 77)表达上调ESTAF4 2 5 30 0设计引物 ,运用RT PCR检测了 5例多发性骨髓瘤患者及 4例正常人骨髓细胞中该EST的表达水平 .Northern印迹杂交分析该EST在多种组织中的表达 .进一步利用该EST作探针 ,筛选ARH 77cDNA文库 ,获得全长cDNA克隆 ,对该序列进行了分析 .结果显示 ,该EST在多发性骨髓瘤患者骨髓细胞中亦有较高的表达 ,而在正常人骨髓细胞中低表达 .经测序证实 ,该cDNA全长为 4 5 2bp(GenBank收录号 :AF4 87338) .预测其编码一个 5 7个氨基酸的小分子量蛋白质 ,属于与DNA复制有关的解旋酶 引物酶基因家族的新成员 .该基因在多发性骨髓瘤细胞中表达上调 ,其表达水平的改变可能与多发性骨髓瘤的发生与发展有关 相似文献
84.
目的:应用随机引物扩增多态性DNA技术( random amplified polymorphic DNA , RAPD)对大耳白黑眼兔( white hair black eyes rabbit , WHBE rabbit )、日本大耳白兔( Japanese white rabbit , JW rabbit )和新西兰兔(New Zealand white rabbit, NZW rabbit)3个实验兔品系进行遗传分析。方法选用90只实验兔的皮肤组织样品提取基因组DNA,用60个随机引物对实验兔基因组DNA进行PCR扩增,根据电泳结果筛选出多态性较高的引物进行RAPD-PCR分析,再利用Popgene 3.2统计软件对3个品系的扩增条带进行遗传分析,获得实验数据。结果分析结果表明:(1)60个随机引物中筛选出25个多态性较高的引物,3个品系实验兔共检测到493个扩增片段,长度在100~1800 bp之间,筛选的25个引物中,其中16个引物既可扩增出3个品系共同的DNA条带,也可扩增出WHBE兔特有的特征条带;(2) WHBE兔位点数为234个,其中多态位点数166个,多态位点比为70.94%,JW兔位点数为228个,其中多态位点数122个,多态位点比为53.51%,NZW兔位点数为231个,其中多态位点数94个,多态位点比为40.69%;(3)三个群体的Shannon多样性指数分别为0.3385,0.2222和0.1905;(4) JW兔和NZW兔的遗传相似系数最高,为0.8443,其次为WHBE兔和JW兔的遗传相似系数,为0.8204,WHBE兔和NZW兔的遗传相似系数最低,为0.7862。结论结果表明WHBE兔与JW兔和NZW兔之间有遗传的相似性,也存在着遗传差异,应用RAPD技术可以很好地检测实验兔不同品系之间以及同一品系不同个体之间的亲缘关系。 相似文献
85.
86.
向日葵黑茎病菌的快速分子检测 总被引:3,自引:0,他引:3
从新疆采集的向日葵黑茎病罹病植株的茎秆、叶片和花盘共分离获得20个真菌分离物。经致病性测定,证明分离物XJ011和XJ111是引起该病害的病原物。采用ITS通用引物ITS1/ITS4对XJ011和XJ111菌株的rDNA-ITS区进行PCR扩增和测序,并结合形态学特征,将该菌鉴定为麦氏茎点霉Phoma macdonaldii。同时,在rDNA-ITS的多态性丰富区域设计了一对特异性引物320FOR/320REV,建立了P. macdonaldii病菌的快速分子检测体系,能特异性检测出向日葵黑茎病菌,灵敏度 相似文献
87.
Mei-Qin Liu Xin Shen Wei-Lun Yin Cun-Fu Lu 《植物学报(英文版)》2007,49(3):382-385
T-A cloning takes advantage of the unpaired adenosyl residue added to the 3' terminus of amplified DNAs by Taq and other thermostable DNA polymerase and uses a Ilnearlzed plasmld vector with a protruding 3' thymldylate residue at each of Its 3' termini to clone polymerase chain reaction (PCR)-derived DNA fragments. It Is a simple, reliable, and efficient Ilgatlon-dependent cloning method for PCR products, but the drawback of variable cloning efficiency occurs during application. In the present work, the relationship between variable T-A cloning efficiency and the different 5' end nucleotlde base of primers used In PCR amplification was studied. The results showed that different cloning efficiency was obtained with different primer pairs containing A, T, C and G at the 5' terminus respectively. The data shows that when the 5' end base of primer pair was adenosyl, more white colonies could be obtained In cloning the corresponding PCR product In comparison with other bases. And the least white colonies were formed when using the primer pair with 5' cytldylate end. The gluanylate end primers resulted In almost the same cloning efficiency In the white colonies amount as the thymldylate end primer did, and this efficiency was much lower than that of adenosyl end primers. This presumably is a consequence of variability In 3'dA addition to PCR products mediated by Taq polymerase. Our results offer instructions for primer design for researchers who choose T-A cloning to clone PCR products. 相似文献
88.
该研究以洋桔梗(Eustoma grandiflorum)2个品种‘玛丽艾基粉色’和‘圣剑白底紫边’为试材,提取叶片DNA,经过EcoRⅠ/MseⅠ双酶切、连接、预扩增、选择性扩增,建立了洋桔梗的AFLP最佳反应体系;并以64个常用引物组合进行扩增,得到154个多态性条带,从中筛选出扩增条带较多且多态性较好的4个引物组合(E-ACA/M-CTC,E-ACC/M-CAC,E-AGC/M-CTT,E-ACT/M-CAG),其多态位点百分率均值为24.36%。利用上述4个引物组合,以最佳反应体系为基础,构建了7个常见洋桔梗品种的AFLP指纹图谱,统计7个品种各4个引物组合在1 000~300bp区间7个区段的扩增条带,并将各个品种的AFLP指纹图谱转换成各品种4组7位数构成的28位特异数字指纹,极大地方便了种质比较及鉴定;7个品种间的遗传相似系数介于0.683 5~0.860 8之间,平均值为0.774 6。研究结果为进一步进行洋桔梗的种质研究及利用奠定了基础。 相似文献
89.
CO1在侧耳属物种快速鉴定中的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
以侧耳属Pleurotus15个种的15个菌株为材料,根据GenBank上侧耳属细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ基因(cytochrome c oxidase subunit 1 gene,CO1)序列信息,设计引物CO332F、CO332R,进行第一轮PCR扩增,结果显示所有菌株都能得到单一条带,根据条带大小,15个菌株可分为4组。随后针对每个种设计特异性引物,进行第二轮PCR扩增,结果显示每个菌株只有在自己特异的引物中出现目的条带。通过两轮扩增,根据扩增条带的大小和有无,即可对15个种进行快速鉴定。 相似文献
90.