基于Petri网T不变量的PHB新陈代谢建模分析(英文)

从拓扑结构的角度分析生化反应网络是生物信息学研究中的一个热点问题。通过将两种传统的途径分析方法(基元模式和极端途径)与Petri网的T不变量分析进行了比较,结果表明:它们本质上是一致的,但是采用Petri网的T不变量分析更便捷。然后,利用Petri网技术构建了PHB代谢模型。对该模型作了结构分析,将计算得到的23个T不变量进行了分组:I组表示简单的可逆反应,II组表示循环的反应,III组可用于调控ATP/ADP比率,IV组是与PHB生产直接相关的反应,可用于代谢工程以提高PHB的产率。最后讨论了Petri网的T不变量分析在这个领域中的应用。     

树干毕赤酵母酒精发酵碳元素代谢流向分析

实验对树干毕赤酵母（Pichia stipitis）进行了4个阶段共400 h连续恒化培养,在不同阶段以30.0 g/L葡萄糖作为基本碳源,添加30.0或15.0 g/L的木糖,通过控制温度（35±1）℃,进气量100～150mL/min,搅拌转速250～300 r/min。4个阶段共建立4个连续培养的"稳态"。对碳元素进行物料衡算发现,四个阶段碳元素回收率分别为118.0 %、105.6 %、113.5 %和94.7 %。对4个近似"稳态"的碳元素的代谢流向进行分析发现：将近50.0 %左右碳元素流向产物酒精,其次是CO2和酵母细胞;木糖醇浓度与流入底物中木糖浓度有直接关系,在相同发酵条件下流入的木糖浓度越大代谢生成木糖醇浓度也越高;实验所采用的通气条件更适合底物为30.0 g/L葡萄糖和30.0 g/L木糖混合液的连续发酵。     

濒危植物桃儿七种子休眠特性的研究

桃儿七种子在自然条件下具有休眠期长、萌发不良的生理特性,为了探讨和研究桃儿七种子的休眠特性,利用分离胚培养、生物鉴定法、GA₃浸种、以及综合利用GA₃和低温层积处理等方法。结果表明：种皮和胚乳的限制以及生理后熟是引起桃儿七种子休眠的主要原因,用400 mg·L^-1的GA₃溶液浸种24 h或低温层积后用GA₃处理均能在一定程度上解除休眠促进萌发,其中以低温层积90 d后用500 mg·L^-1的GA₃浸种36 h效果最好,发芽率和发芽势分别达到81.11%和50.00%。     

油橄榄叶中橄榄苦苷的分离纯化

考察了6种不同大孔树脂对橄榄苦苷的吸附,筛选出吸附选择性好的D101大孔吸附树脂为实验材料.得到的D101大孔树脂的最佳吸附条件:试样上样质量浓度41.06[J].,流速5 mL/min,50％乙醇溶液洗脱,洗脱液用量260mL,树脂可以反复使用.经大孔树脂富集后,橄榄苦苷的纯度可达55％以上,再经葡聚糖凝胶精纯化后,可达76％以上.     

蛇肌果糖1,6—二磷酸酯酶,果糖2,6—二磷酸,AMP的结…

腺苷一磷酸对４个快反应巯基被修饰的蛇肌果糖１,６－二磷酸酯酶活性的抑制作用增强,而该修饰的酶受果糖２,６－二磷酸的抑制脱敏,ＡＭＰ对酶抑制为半部位反应,酶受果糖２,６－二磷酸抑制的脱敏则表现为全部位反应,经枯草杆菌蛋白酶限制性酶解的果糖１,６－二磷酸酯酶的Ｋ１增大１０倍,但受果糖２,６－二磷酸抑制的性质不变,经胰蛋白酶限制性酶解的果糖１,６－二磷酸酯酶的活性不再为ＡＭＰ抑制,但果糖２,６－二磷酸对     

藤茶香树脂醇合成酶基因编码区克隆及表达分析

为研究藤茶(Ampelopsis grossedentata)三萜类化合物的生物合成,采用RT-PCR方法,从藤茶叶片cDNA中扩增得到香树脂醇合成酶(amyrin synthase)基因,命名为AgAS。该基因编码区长2 250bp,编码750个氨基酸,与葡萄的同源蛋白亲缘关系最近。亚细胞定位和Southern blot结果表明,AgAS编码蛋白主要定位于细胞核与细胞膜,在藤茶基因组中存在2个拷贝。实时荧光定量PCR结果显示,AgAS基因在紫芽藤茶的根、茎和叶均有表达,其中叶片中表达最高,茎次之,根中表达量最少,且随着叶片成熟程度的增加,表达量呈先升后降趋势;而在绿芽藤茶中,AgAS基因在叶片中的表达量随着成熟程度的增加呈上升趋势,根与茎中表达量相对较少。     

海藻酸转化生物乙醇研究进展

作为第三代生物燃料,大型褐藻类生物质转化燃料乙醇的研究受到广泛的关注。但是,现有的乙醇工业菌株并不能利用褐藻中的主要成分海藻酸,这个问题是海藻生物乙醇实现工业化生产的主要技术难关。近几年随着对海藻酸裂解酶和海藻酸降解菌代谢途径的深入研究,科研人员构建了不同的海藻酸发酵菌株,为高效转化大型海藻生产生物乙醇提供了可行的技术基础。这篇文章对海藻酸资源概况和海藻酸转化生物乙醇存在的科学问题及其研究进展进行了综述。     

《自然一细胞生物学》：科学家发现肿瘤发生新机制

中国科学技术大学生命科学院吴缅教授与美国宾夕法尼亚大学医学院杨小鲁教授合作，在癌症代谢机制研究中取得一项新的突破性发现。即证实p73蛋白激活了癌细胞中的磷酸戊糖途径，支持了肿瘤细胞的增殖。