Sequence Diversity and Enzyme Activity of Ferric-Chelate Reductase LeFRO1 in Tomato

Ferric-chelate reductase which functions in the reduction of ferric to ferrous iron on root surface is a critical protein for iron ho- meostasis in strategy I plants. LeFROI is a major ferric-chelate reductase involved in iron uptake in tomato. To identify the natural variations of LeFRO1 and to assess their effect on the ferric-chelate reductase activity, we cloned the coding sequences of LeFRO1 from 16 tomato varieties collected from different regions, and detected three types of LeFRO1 （LeFRO1MM, LeFRO1Ailsa and LeFRO1Monita） with five amino acid variations at the positions 21, 24, 112, 195 and 582. Enzyme activity assay revealed that the three types of LeFRO1 possessed different ferric-chelate reductase activity （LeFRO1AiISa 〉 LeFRO1MM 〉 LeFRO1M~nita）. The 112th amino acid residue Ala of LeFRO1 is critical for maintaining the high activity of ferric-chelate reductase, because modification of this amino acid resulted in a significant reduction of enzyme activity. Further, we showed that the combination of the amino acid residue lie at the site 24 with Lys at the site 582 played a positive role in the enzyme activity of LeFRO1. In conclusion, the findings are helpful to understand the natural adaptation mechanisms of plants to iron-limiting stress, and may provide new knowledge to select and manipulate LeFRO1 for improving the iron deficiency tolerance in tomato.     

应用聚合酶链式反应快速特异鉴定假单胞菌和伯克霍尔德氏菌(R)-3-羟基酯酰载酯蛋白-辅酶A转酰基酶基因

聚羟基脂肪酸酯(PHA)是一类具有广泛应用前景的可降解生物塑料。因其可以以葡萄糖等廉价底物直接发酵生产PHA而日益受到重视。目前的研究表明在积累中长链PHA的假单胞菌中,由phaG基因编码的(R)-3-羟基酯酰载酯蛋白-辅酶A转酰基酶(PhaG)起关键作用,但目前为止对该蛋白还知之甚少。通过聚合酶链式反应(PCR)建立了一种快速、特异鉴定phaG基因的方法,应用该方法成功地从两株积累不同PHA的假单胞菌Pseudomonas stutzeri 1317和Pseudamanas nitroreducens 0802中分别克隆得到phaG基因,并在phaG基因突变株Pseudomonas putida PHAGx-21中表达成功。同时,还首次报道了从非假单胞菌菌株Burkholderia caryophylli AS 1．2741中鉴定得到phaG基因,提示PhaG介导的中长链PHA合成途径作为一种通用的代谢模式在细菌中广泛存在,为进一步实现从廉价的非相关底物合成中长链PHA提供了必要的分子生物学基础。     

古老的嗜极微生物

在极端环境条件下生存的微生物又有古微生物之称，主要是古菌，所谓“古”，即有些细菌几千万年来一直生活在地球表面下层几万公里的深处，它们生活在没有阳光的黑暗深处，靠什么来维持其生存呢？研究人员（LIN Li-Hung）极其同事在南非一个金矿钻到2．8km深处的一个水层中对其有水、有矿的地方进行采样，发现一类靠分解硫酸盐化合物获得能源以维持生存的细菌。     

退化设施蔬菜地修复过程中土壤可溶性有机碳与无机氮动态

土壤强还原处理(reductive soil disinfestation,RSD)可以有效修复退化设施蔬菜地土壤,但实施过程中亦会存在可溶性有机碳(DOC)与无机氮(NO3--N和NH4+-N)的淋溶风险。本研究选用水稻秸秆及其制备的生物质炭(biochar,BC)作为修复材料,采用BC、RSD以及RSD+BC三种方法修复退化蔬菜地土壤,探究修复过程中土壤基本性质、DOC与无机氮的动态变化。结果表明,与对照土壤相比,BC处理显著提高了土壤pH、EC和DOC含量(P<0.05),但对土壤NO3--N和NH4+-N无显著影响。对于RSD和RSD+BC处理,土壤NO3--N含量在1~3 d内快速下降,之后维持在较低水平;土壤DOC含量呈先上升后下降趋势,在整个培养时段均显著高于对照处理(P<0.05)。方差分析表明,BC与RSD处理对土壤DOC、全碳(TC)、全氮(TN)和C/N存在交互作用。可见,RSD和RSD+BC处理能有效去除NO3--N,但DOC含量大幅度增加,存在淋溶风险。     

应用聚合酶链式反应快速特异鉴定假单胞菌和伯克霍尔德氏菌（R）-3-羟基酯酰载酯蛋白-辅酶A转酰基酶基因

聚羟基脂肪酸酯 (PHA)是一类具有广泛应用前景的可降解生物塑料。因其可以以葡萄糖等廉价底物直接发酵生产PHA而日益受到重视。目前的研究表明在积累中长链PHA的假单胞菌中 ,由phaG基因编码的（R）3 羟基酯酰载酯蛋白 辅酶A转酰基酶 (PhaG)起关键作用 ,但目前为止对该蛋白还知之甚少。通过聚合酶链式反应 (PCR)建立了一种快速、特异鉴定phaG基因的方法 ,应用该方法成功地从两株积累不同PHA的假单胞菌Pseudomonasstutzeri 1317和Pseudomonasnitroreducens 080 2中分别克隆得到phaG基因 ,并在phaG基因突变株PseudomonasputidaPHAG_N-21中表达成功。同时 ,还首次报道了从非假单胞菌菌株Burkholderiacaryophylli AS 1.274 1中鉴定得到phaG基因 ,提示PhaG介导的中长链PHA合成途径作为一种通用的代谢模式在细菌中广泛存在 ,为进一步实现从廉价的非相关底物合成中长链PHA提供了必要的分子生物学基础。