计算机视觉技术在昆虫识别中的应用进展

介绍计算机视觉技术的定义,组成系统和发展状况,总结其在昆虫识别中的应用,指出目前存在的问题以及需要重点解决的关键技术．为今后的深入研究提出了一些建议和方向。     

Toll样受体及其信号转导

Toll样受体(TLR)介导着绝大部分哺乳动物、昆虫及植物的宿主防御. TLR4与配体结合涉及膜抗原CD14和分泌蛋白MD-2的调节并一起形成受体复合物, 然后与接头分子MyD88结合, 使IRAK磷酸化, 再使TRAF6寡聚化, 随后激活控制着各种效应基因表达的转录因子NF-κB.     

生物信息学在植物miRNA研究中的应用

植物miRNA的研究已经从小规模实验向大规模计算分析方向发展,生物信息学的应用成为当前植物miRNA研究的热点问题。本文回顾了最近几年生物信息学在植物miRNA研究中取得的最新进展,简要介绍了植物miRNA的形成及其作用方式,重点对植物miRNA的计算识别、靶基因预测、启动子分析方法进行了讨论,并对相关的数据库资源进行了总结,最后展望了该领域研究的发展方向,将为植物miRNA的计算研究提供理论指导。     

限制性酶

核酸限制性内切酶是识别双链DNA中专一序列的酶,主要从原核生物中提取。限制性内切酶可分为三类:第Ⅰ和第Ⅲ类酶在同一旦白中具有修饰作用(甲基化作用)和需要ATP的限制性裂解的活性。这两种酶都识别底物DNA中非甲基化的序列,不过第Ⅰ类酶的作用是随机的,第Ⅲ类酶则切DNA的专一位点。     

HBV前S2蛋白单克隆抗体的制备和生物学特性的鉴定

目的克隆表达HBV前S2蛋白,用纯化的重组蛋白GST-S2免疫BALB/C小鼠,通过杂交瘤技术制备抗HBV前S2蛋白的单克隆抗体(mAb),并鉴定其特性.方法利用含双拷贝乙肝病毒adw2亚型基因全序列的质粒pEcob6,经PCR方法扩增出HBV前S2片段,在GST表达系统中表达,表达产物用谷胱甘肽亲和层析纯化后,用于免疫BALB/c小鼠,采用杂交瘤技术制备抗前S2蛋白的mAb,采用间接ELISA方法和Western blot进行mAb特异性鉴定;同时采用间接ELISA方法鉴定mAb相对亲和力.结果获得一株可分泌特异性mAb的杂交瘤细胞7A6;相对亲和力均在107以上.Western blot显示该株mAb能特异识别重组前S2蛋白.结论成功地制备出抗HBV前S2蛋白的一株mAb.     

全基因组扩增技术及其在法医个体识别中的应用

全基因组扩增(Whole genome amplification,WGA)技术是一种对全部基因组序列进行非选择性扩增的技术。近几年来,对WGA技术扩增痕量DNA检材的研究日渐深入,这些研究可望用于刑案现场采集到的痕量DNA样品的扩增,为法医个体识别提供足量的DNA模板。然而,对实际案件中复杂检材的扩增偏差问题一直困扰着法医工作者,寻求一个低扩增偏差、高扩增产率的WGA技术是法医工作者的主要目标。文章综述了WGA技术在法医个体识别中的研究进展及应用前景,为法医解决扩增偏差问题提供参考。     

泛素连接酶E3

蛋白质的泛素化修饰具有高度的特异性,它参与调节细胞内许多的生理活动。蛋白质的泛素化修饰涉及一系列的酶参与反应,包括泛素激活酶E1、结合酶E2以及连接酶E3。而其中泛素连接酶E3对靶蛋白的特异性识别起关键作用。泛素连接酶E3主要由HECT结构域家族、RING结构域家族和U-box结构域家族组成。现对泛素连接酶E3的分类、结构及其对靶蛋白的识别机制等进行综述。     

973项目“生物制造手性化学品的科学基础”取得突出进展

“生物制造手性化学品的科学基础”项目围绕手性生物制造的关键科学问题,在手性识别规律解析、生物催化剂理性设计、反应调控、典型生物制造过程重构等方面取得了较大进展。     

CD4+T细胞免疫识别的一种新理解

获得性免疫具有抗原特异性,但同时T细胞识别却有混杂性和NHC制约等现象,这提示T细胞对抗原肽-MHC分子复合物(pMHC)识别中可能存在不同模式。本文提出了CD4 T细胞有两种特异性识别活化基础单位(具有不同的生理学意义)的模型,一种为纯TCR模式(TCR model),对pMHC(尤其是抗原肽)高特异性识别;另一种为复合受体模式(TCR-CD4 model),对MHC-Ⅱ分子特异性要求很高(NHC制约),但有可以不同亲合度结合抗原肽的混杂性;它们在免疫应答中以不同组合形式出现,可形成细胞水平区分“自我”与“非我”的效应。由此可更合理、简化地理解各种有关免疫现象以及淋巴免疫系统的起源。     

Whole-Cell Protein Identification Using the Concept of Unique Peptides

A concept of unique peptides(CUP)was proposed and implemented to identify whole-cell proteins from tandem mass spectrometry(MS/MS)ion spectra.A unique peptide is defined as a peptide,irrespective of its length,that exists only in one protein of a proteome of interest,despite the fact that this peptide may appear more than once in the same protein.Integrating CUP,a two-step whole-cell protein identification strategy was developed to further increase the confidence of identified proteins.A dataset containing 40,243 MS/MS ion spectra of Saccharomyces cerevisiae and protein identification tools including Mascot and SEQUEST were used to illustrate the proposed concept and strategy.Without implementing CUP,the proteins identified by SEQUEST are 2.26 fold of those identified by Mascot.When CUP was applied,the proteins bearing unique peptides identified by SEQUEST are3.89 fold of those identified by Mascot.By cross-comparing two sets of identified proteins,only 89 common proteins derived from CUP were found.The key discrepancy between identified proteins was resulted from the filtering criteria employed by each protein identification tool.According to the origin of peptides classified by CUP and the commonality of proteins recognized by protein identification tools,all identified proteins were cross-compared,resulting in four groups of proteins possessing different levels of assigned confidence.