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971.
972.
Himabindu Kudapa Arvind K. Bharti Steven B. Cannon Andrew D. Farmer Benjamin Mulaosmanovi Robin Kramer Abhishek Bohra Nathan T. Weeks John A. Crow Reetu Tuteja Trushar Shah Sutapa Dutta Deepak K. Gupta Archana Singh Kishor Gaikwad Tilak R. Sharma Gregory D. May Nagendra K. Singh Rajeev K. Varshney 《植物生理与分子生物学学报》2012,(5):1020-1028
973.
将粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)的注释基因分别与30 种丝状子囊菌基因组比较, 根据E值大小预测同源序列, 从中选择Hsp90, AAC, CDC48和EF3作为候选基因, 以丛赤壳科(Nectriaceae)13 个属34 个概念清晰的种为材料, 对215个序列片段采用不同方法进行分析, 筛选适合于该科的DNA 条形码. 将种内与种间序列差异以及序列获得的难易程度作为评价指标. 结果表明,Hsp90 和AAC基因虽然具有较高的 PCR 扩增与测序成功率, 但种内、种间距离频率分布存在重叠, 可能导致部分种的鉴定错误;CDC48基因可以恰当地区分种内与种间差异, 但扩增与测序成功率相对较低; EF3基因不存在种内、种间遗传距离重叠, 序列容易获得, 适合作为该科真菌的DNA 条形码. 相似文献
974.
利用公共数据库中果蝇F1代和栽培水稻基于高通量Illumina测序平台的RNA Seq短序列数据,比较了8个 (ABySS, Velvet, SOAPdenovo, Oases, Trinity, Multiple k, T IDBA and Trans ABySS) 转录组从头组装软件。结果显示,在基于单一k mer和多重k mer方法的两类软件中,Trinity和Trans ABySS分别表现出最好的组装性能,而其它软件性能比较接近。我们还发现基于多重k mer比单一k mer可以组装获得更多的总碱基数目,但是即使利用最好的多重k mer组装软件,所获得的数据质量也比研究人员所期望的要低。鉴于此,我们提出了“ETM”优化方法,将多重k mer方法组合到Trinity中,使其在具有最好的组装性能的基础上兼具了多重k mer的优势,测试结果显示了该方法具有一定的优越性。我们的研究结果为用户选择合适的软件提供了依据,对推动基于高通量Illumina测序的转录组研究具有重要意义。 相似文献
975.
976.
《中国生物工程杂志》2011,(7):141
我国将采取五项措施推动生物技术研究和产业化发展科技部副部长王志刚在近日召开的"2011国际生物经济大会"上表示,"十二五"时期,我国将采取五项措施推动生物技术的研究和产业化发展。王志刚表示,"十二五"是我国建设创新型国家、全面实现小康社会战略目标的关键时期,也是生物技术和 相似文献
977.
978.
979.
基因测序技术日新月异,基于个体遗传差异的个性化医疗是否即将实现,且能普遍推广?测序成本的降低,让普遍高中也打算购买测序仪以供教学使用?新的测序技术正让这一切都成为可能。 相似文献
980.