基于支持向量机的细菌基因组水平转移基因预测

随着各种生物基因组序列测定工作的完成,大量的DNA序列数据涌现出来,为研究在基因组中寻找水平转移基因提供了极大的便利.将基因序列特征分析和支持向量机技术结合起来,通过分析基因序列的特征差异发现水平转移基因.依据以前研究工作的基础,选取了绝对密码子使用频率(FCU)作为序列特征,主要因为它既包含了基因密码子使用偏性的信息,也包含了基因所编码蛋白的氨基酸组成信息,支持向量机利用这些信息进行水平转移基因分析和预测,可以提高预测的准确性.另外,提出了基于分链的水平转移基因预测新方法,即将细菌基因组前导链和滞后链上的基因区别对待,分别进行水平转移基因预测.结果显示,基本预测方法要优于目前预测结果最好的Tsirigos等提出的基于八联核苷酸频率的打分算法,命中率的相对提高率最高达31.47%,而基于分链的方法对水平转移基因的预测取得了更好的结果.     

某院解热镇痛抗炎药使用分析

目的分析某院解热镇痛抗炎药的临床应用情况,为临床合理用药提供参考。方法回顾性分析2015年1~12月某院解热镇痛抗炎药的销售金额、DDDs、DDDc、排名比等项目,并进行统计分析。结果某院不同品规的解热镇痛抗炎药31种,季度销售金额突破万元的药品有10种;DDDc≤1元的药品占总品种数的38.7%,1元DDDc10元的药品占比38.7%,DDDc≥10元的药品占22.6%。结论某院解热镇痛抗炎药品配备基本合理,优质药品在临床使用广泛,临床用药宜综合考虑药品的安全性、有效性、经济性。     

动物进化稳定对策(ESS)及其研究进展

介绍进化博弈理论及进化稳定对策的原理及其在进化生物学的应用:简要述评动物进化稳定对策的研究进展及发展趋势。     

宋朝中国人的姓氏分布与群体结构分化

姓氏是一种十分有用的文化遗传因子,它的传递方式类似于Ｙ染色体的表现。１０００年前宋朝（公元９６０￣１１７９年）中国人姓氏频率的分布,是一组十分吻合Ｋａｒｌｉｎ－ＭｃＧｒｅｇｏｒ的中性等位基因分布理论的随机数据。１６个省区的姓氏种类丰度的相对参数α和迁移率的相对参数ｖ的分析,反映了这一时期的中国人群的迁移和人群间混合的程度。姓氏遗传距离和现状聚类图的分析,表明在１０００年前的宋朝中国人群已经形成了南     

达乌尔黄鼠种群空间分布型研究及其应用

本文根据1987年在内蒙古东北部低山丘陵区和平原区草原的调查资料,应用频数分布比较法研究了达乌尔黄鼠的空间分布型。结果表明：在抽样单位(样方)大小为1公项(1OO米×100米)时,4个样地内达乌尔黄鼠交尾期和幼鼠分居期的空间分布型均属poisson分布(随机分布)。环境与密度制约因素的影响不明显。并经回归分析得到：种群密度(m)与零样方频率(Po)和有鼠样方频率(Px )的曲线关系分别为m=4.5451-0.96721nPo和m=4.5451-0.96721n(1-Px)。经X²检验与poisson分布理论曲线基本一致(x²《x^{2 _0.05},P>0.05)。为达乌尔黄鼠种群密度估计提供了理论依据.     

云南省彝、白、傣、哈尼族人红细胞乙二醛酶I的分型调查及其频率研究

采用淀粉/琼脂糖电泳技术对云南省彝族、白族、傣族、哈尼族四个少数民族人群红细胞乙二醛酶I(GLO I)进行分型调查,结果：GLO¹ 彝族0.1163、白族0.1468、傣族0.1205、哈尼族0.2070。比较上述四个少数民族之间及其与我国汉族和其他少数民族之间,以及与国外不同人种、不同地区人群之间比较,表明GLO I基因在中华民族大群体中具有一定的分布特征;但在我国各民族之间仍然存在着程度不同的差异,而这种民族间差异却明显小于种族间差异。通过对生活在不同地域的同一民族间比较,表明GLO I基因频率的分布无显著性的地域差异。     

中国17个人群中的耵聍基因频率及干型基因地理分布图

报道了中国17个人群的干型耵聍基因频率,其中汉族人群8个,少数民族人群8个,还有一个未识别民族,即西藏聂拉木县的夏尔巴人。发表了我国汉族人群中以及汉族与少数民族中干型耵聍基因频率的地理分布图。干型耵聍基因在17个人群中的频率及两张基因频率地理分布图都进一步证明,中国汉族与少数民族 (新疆信仰伊斯兰教的少数民族除外)之间有许多基因流动、干型耵聍基因起源于东北亚。中国人群中干型耵聍基因的Fst应在0.1057与0.1602之间。 Abstract:Gene frequencies of serumen type of 17 populations in China are reported,including 8 Han subpopulations,8 ethnic minorities and 1 un-identified ethnic group,the Sherpas in Nyalam County,Tibet.Gene-frequency-distribution maps of dry serumen in Han,as well as in Han and ethnic minorities of China were also published.The gene frequency data of 17 populations and their distribution maps once again showed that there was a large-scale gene exchange between Han and ethnic minorities,my be,with the exception of Moslem ethnic groups in Xinjiang,and that the dry serumen gene originated in Northeast Asia.The Fst of dry serumen gene in Chinese populations as a whole was estimated to be between 0.1057 and 0.1602.     

利用显性分子标记和F_1群体进行林木遗传连锁图谱的构建

构建遗传图谱是当前生物学研究领域中的一个热点,进行图谱构建,林木与作物既有共性,又有各自的特点。因为进行图谱构建一是要有合适的分离群体,二是要有能揭示亲本多态性的遗传标记。两者可利用的遗传标记是一样的,但在进行作图群体构建时却存在一定差异,林木的遗传组成高度杂合,大多数林木为长期异交的树种,一般都有自交不亲合和近交衰退现象,象作物那样利用近交系或其它的高世代群体进行遗传图谱构建是不太可能的。由于研究方法的不同,以前的林木育种工作者很少留意建立和保存谱系清楚的Ｆ_２和ＢＣ_１群体,由于林木生命周期很长,建立这样一些高世代的群体也需要很长的时间,而且除了杨树、柳树等一些可在温室内水培杂交的物种,大多数林木的控制授粉杂交操作也是很困难的。因此研究过程中,等待材料的问题成为目前林木遗传图谱构建的主要限制因子之一。如何利用现成的材料和低世代群体,对林木遗传图谱构建工作的广泛开展具有重要意义。下面就这一问题作一些理论上的探讨和分析。     

客家人的红细胞血型分布

对父母双方上溯三代均为客家人的广东梅县200名 (其中男89人,女111人) 健康学生进行了红细胞血型ABO,MNSs,Rh,Kidd,Duffy,Diego,Xg,Lewis及P等系统的分布调查。结果显示,客家人的基因频率S=0.0250,NS=0,pl=0.0917和Fyb=0.0300,都是汉族人群中最低的。其它基因频率为r=0.6632,p=0.1863,q=0.1505;m=0.5250,n=0.4750,MS=0.0250,Ms=0.5000,Ns=0.4750,s=0.9750;C=0.6575,D=1.0000,E=0.1515,CDe=0.6226,cDE=0.1200,cDe=0.2189,CDE=0.0389;JKa=0.4642,JKb=0.4881,JK=0.0477;Fya=0.9700;Dia=0.0202,Dib=0.9798;Xga=0.3633,Xg=0.6367;P2=0.9083。发现了国内第二例Jk(a-b-)表型,未发现MNS型,NS型,NSs型,CCDEE型,CcDEE型,Fy(a-)型和Rho(-)型。Le(a+b-)型29人,Le(a+b+)型2人,Le(a-b+)型67人,Le(a-b-)型102人。客家人与国内19个群体的遗传距离计算结果表明,与客家人遗传距离最近的是福建汉族、湖南苗族、贵州汉族及广西侗族,其次为河南汉族、黑龙江汉族、陕西汉族,福建畲族及上海汉族,而与云南白族、辽宁满族、甘肃汉族、广西瑶族、广西壮族、内蒙汉族及四川彝族的遗传距离较远。与客家人遗传距离最远的是湖南土家族、海南苗族及海南黎族。     

中国及荷兰人群vWF基因内含子40多态性分析

本文调查了中国汉族及荷兰高加索群体中人类ｖＷＦ基因内含子４０ｎｔ３１／２２１５～２３８０区域ＨＵＭＦＡ３１（Ｃ）遗传多态性的基因频率及基因型频率分布。并对两群体之间的分布以拟然比方法进行比较。对９个等位基因片段测序的结果表明,在ｎｔ３１／２２３４～２２６５区域也有变异存在。提示该座位当被测等位基因ＤＮＡ片段长度相同时,仍可能存在遗传差异。