非核糖体肽合成酶工程改造研究进展

非核糖体肽合成酶合成的非核糖体肽类天然产物具有丰富的结构和多样的功能,在医药、农业、工业等领域具有广泛的应用潜力.利用合成生物技术工程改造非核糖体肽合成酶,在微生物细胞工厂中组合生物合成新型非核糖体肽分子顺应绿色化学的发展理念,是国内外学者关注的热点.文中归纳了3种不同的非核糖体肽合成酶工程改造策略,并对近年来相关领域...     

渐新世至中新世南海北部IODP U1499站位年龄框架与沉积演化

南海的沉积演化与构造和洋流活动关系密切,过去对沉积过程的讨论集中在陆坡区,对深水海盆的了解较少。本研究选用南海北部的国际大洋发现计划(IODP)367航次的U1499B钻孔761.86～933.17 m段,在精细的浮游有孔虫生物地层学基础上,结合Sr同位素地层年龄,建立了覆盖30–10 Ma的年龄模型。利用相邻站位同时期沉积物的沉积速率、岩芯物理参数进行对比,总结出南海北部渐新世至中新世的沉积演化历史。研究发现,南海北部陆坡和海盆的沉积演化过程并不相同。30–27 Ma海盆和陆坡大部分地区沉积速率较低,而海盆内沉积物多由浊流或泥石流搬运而来。27–25 Ma期间,洋脊跃迁导致海盆快速扩张并加深,陆地物质供应减少,同时底层流侵蚀作用强,沉积速率降至极低。海盆区域25–13 Ma沉积速率略有提高而后保持稳定,而陆坡地区在25–22 Ma期间构造沉降依然强烈, 22 Ma后才形成稳定的远洋沉积环境。27–13 Ma深水海盆内出现红层沉积, 13 Ma后,青藏高原快速隆升导致陆源输入迅速增加,南海海盆沉积速率加快致使红层消失。陆坡区域则是在15 Ma后红色沉积物增多,这是南海扩张结束后发生快速...     

寻找化石过程中板状岩石的人为碎裂方式

在寻找埋藏于海、湖相沉积板状构造岩石中的化石标本时,为了方便快捷地寻找化石迹象以及保护现场标本的完整性,野外队员常采用观察岩石断面的方法筛选化石标本.此种方法涉及到地质锤对岩石表面的直接敲击,理想的效果是能够人为地控制岩石碎裂的方向和碎裂状态,避免损伤和丢失标本,便于观察、拼接,并不使细小片渣飞溅.     

基于核范数正则化的抗癌药物组合协同作用预测

目的 抗癌药物联合疗法是一种很有前途的治疗策略。针对特定癌症类型，选择高度协同的药物组合，对提高癌症疗效至关重要。然而，确定具有协同作用的药物组合是一项复杂而困难的工作。本研究旨在完全以数据驱动、计算建模的方式优化抗癌药物组合高通量虚拟筛选，为“旧药重新定位新组合”提供理论参考。方法 借鉴矩阵填充思想，构建了基于核范数正则化的计算模型NNRM，用于预测抗癌药物组合的协同得分和协同状态。针对固定细胞系构造对称的协同得分观测矩阵；采用分折技巧将观测矩阵稀疏化；借助“交替方向乘子法”和“软阈值估计”求解模型。结果 将NNRM应用于O’Neil团队发布的数据集，预测的协同得分与观测值之间的均方根误差为14.78，预测的协同状态准确率为0.94，优于随机森林（RF）和支持向量机（SVM），完全可以与深度学习模型相媲美。此外，NNRM预测的部分缺失值结果与已有研究或临床实践相吻合。结论 NNRM可实现大规模、批量预测抗癌药物组合的协同作用，极大地降低了已有模型对数据的要求和计算成本，缩短了高通量虚拟筛选的测试时间，可以作为抗癌药物组合高通量虚拟筛选的可选择工具。     

吐哈盆地南缘晚石炭世孢粉组合

本文通过吐哈盆地南缘的LN1井64块孢粉样品的研究,建立了吐哈盆地南缘晚石炭世Crassispora kosankei-Gardenasporites pinnatus-Hamiapollenites chepaiziensis(KPC)孢粉组合,该组合与、腕足类和珊瑚等动物化石共同保存,以具单裂缝、具肋双气囊花粉和单气囊花粉等比较发育为主要特征,组合特征不同于安加拉植物地理区的孢粉组合,也有别于欧美和华夏植物地理区的孢粉组合,同准噶尔盆地西北缘上石炭统(车排子组)孢粉组合基本相似,说明吐哈盆地在晚石炭世属于亚安加拉植物地理区系。     

中国南海西沙群岛海域鸢乌贼角质颚色素沉积变化

角质颚是头足类的主要摄食器官,蕴藏着大量的渔业生物学及生态学信息。根据2017年5-8月中国灯光罩网渔船于中国南海西沙群岛海域采集的860尾鸢乌贼样本,对其角质颚色素沉积等级进行了划分和判定,研究了鸢乌贼角质颚色素沉积等级变化与胴长、体质量、净重、性腺成熟度和角质颚外部形态参数等因子的关系。结果表明:鸢乌贼的角质颚色素沉积变化存在性别间显著性差异(P<0.05),雌性个体角质颚色素沉积速度快于雄性;色素沉积等级与胴长、体质量和净重均呈正相关,并随着性腺成熟度的增加而增加;雄性个体角质颚下颚除翼长外,其余各部色素沉积的速度均快于上颚各部;雌性个体上颚各部色素沉积速度均快于下颚。本研究为后续利用角质颚研究鸢乌贼渔业生物学和对该资源的有效开发及科学管理提供了基础。