《侏罗纪公园》可能实现吗?

正科幻电影《侏罗纪公园》自1993年首映以来,在全球引起了恐龙热,很多地方都建立了与恐龙有关的主题公园。关于古生物和化石的各种宣传与介绍逐渐变得方兴未艾,可以毫不夸张地说,系列科幻电影《侏罗纪公园》对于古生物等方面知识的科普宣传功不可没。电影《侏罗纪公园》再现了1亿4千多万年前恐龙繁盛的地     

High-accuracy mapping of protein binding stability on nucleosornal DNA using a single-molecule method

Dear Editor, The conformation of nucleosomal DNA is significantly different from that of B-form double stranded DNA （dsDNA） （Richmond and Davey, 2003）. In nucieosomal DNA, specific DNA sequences are less flexible and less accessible than in free dsDNA, which might be due to the tight association of histone cores. The allosteric effect via DNA has been documented recently （Kim et al., 2013）, suggesting that DNA is not merely a solid rod providing recognition sequences. Previous studies of nucleosomal DNA-protein interactions only demonstrated the key mechanism involved--histone shielding （Li and Wrange, 1993; Hinz et al., 2010; Sahu et al., 2010）.     

不同干扰素应答慢性乙型肝炎患者的基因组DNA甲基化谱差异分析

α干扰素,包括长效干扰素——聚乙醇化α干扰素(PEG-IFNα),是临床用以治疗慢性乙型肝炎的首选药物。但干扰素治疗通常只能在有限的患者中获得完全应答。目前干扰素治疗应答相关指标预测的灵敏度与特异度远未令人满意,因此继续寻找潜在的与干扰素疗效预测相关的分子标记仍是一个十分有意义的工作。为探讨慢性乙型肝炎患者基因组DNA甲基化状态与干扰素治疗疗效的关系,本研究采用RocheNimbleGen人甲基化DNA免疫共沉淀-芯片(MeDIP-chip)技术,分析20例不同干扰素疗效慢性乙型肝炎患者的血浆基因组启动子甲基化谱差异,并利用MeDIP-定量聚合酶链反应(MeDIP-qPCR)检验部分基因启动子区域DNA甲基化的水平。结果显示,与快速应答组相比,无应答组中有588个基因启动子区甲基化水平存在显著差异(P0.05)。这些基因主要涉及多个信号通路,即钙离子信号通路、细胞周期调节通路、肝脏代谢相关通路等。MeDIP-qPCR验证与芯片结果的一致性超过80%。本研究为探讨差异甲基化基因在干扰素应答中的作用及发现潜在的预测干扰素疗效的血液分子标记奠定了基础。     

石油作业习惯性流产女性细胞遗传毒性研究

目的:研究石油作业环境对女性习惯性流产的遗传毒性。方法:随机选择习惯性流产的石油作业女性38人和正常的育龄女性20人,检测其外周血淋巴细胞姐妹染色单体互换,记数SCE发生率。结果:观察组的外周血淋巴细胞SCE发生率为8.81±0.35,明显高于对照组(P0.05)。结论:SCE的发生可作为石油作业习惯性流产女性染色体结构稳定性的检测指标。石油作业环境对女性生育具有遗传毒性。     

TET蛋白去甲基化作用的相关研究进展

TET(ten-eleven translocation)蛋白属于酮戊二酸和Fe2+依赖的双加氧酶,能够产生催化氧化作用。在TET蛋白家族的催化氧化作用下5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)可转化为5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC),并可进一步转化为5-甲酰胞嘧啶(5-formylcytosine,5fC)和5-羧基胞嘧啶(5-carboxylcytosine,5caC)。TET蛋白在DNA胞嘧啶的去甲基化、胚胎发育和基因重新编码等过程都存在重要作用,其中TET蛋白参与DNA胞嘧啶的去甲基化过程的作用机制一直是研究热点,另外,有研究发现TET与肿瘤的发生也存在联系,可能成为新的肿瘤分子标志。     

PCNA泛素化修饰对DNA损伤应答途径的调控

机体细胞在多种化学物质和内外环境不断攻击下会诱发DNA损伤。为了维持基因组的稳定性,细胞内拥有一系列完善而精确的细胞应答机制来保护基因组DNA的完整性。细胞首先通过DNA损伤检测点,然后通过一系列细胞信号转导通路,启动细胞周期阻滞,进而介导细胞修复或凋亡。大量研究表明泛素化作为一种重要的蛋白质翻译后修饰方式,参与调控了多种细胞生理过程。近期研究表明,DNA损伤导致复制应激可诱发PCNA的翻译后泛素化修饰,泛素化修饰的PCNA可能参与了多种DNA损伤应激过程,影响细胞选择不同的DNA损伤应答途径,导致细胞截然不同的转归。因此,更好地了解PCNA泛素化的作用及其影响DNA损伤应答通路可为我们更深入地了解人类细胞如何调控异常的DNA代谢过程和癌症的发生和发展机制提供依据。     

DNA异常甲基化在宫颈癌中的研究进展

长期以来人们一直认为基因突变或基因缺失参与肿瘤的形成。近年来众多研究表明,表观遗传修饰对肿瘤的发展也具有非常重要的意义,它的主要表现形式有DNA甲基化、组蛋白修饰、微小RNA调节、染色质重组等。DNA异常甲基化可通过影响染色质结构、癌基因及抑癌基因表达而参与肿瘤的形成。了解目前宫颈癌中DNA甲基化的研究进展不仅有助于宫颈癌的早期诊断,对其分子靶向治疗及预后评估亦显示出良好的应用前景。     

Nature:世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景图谱问世

<正>北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组和北京大学第三医院乔杰研究组合作在国际知名期刊《自然》上在线发表题为"The DNA methylation landscapes of human early embryos"的文章,利用该团队去年在《基因组研究》上发表的单细胞DNA甲基化组高通量测序方法(Genome Res.2013 Dec;23(12):2126-35.),在国际上首次实现了对人类早期胚胎发育过程中DNA甲基化组的系统研究,揭示了人类早期胚胎DNA去甲基化过程的异质性和其他独特特点。DNA甲基化在基因表达调控、基因印记的维持、X染色体失活状态的维持、以及抑制转座子重复序列的转座等方面都有非常重要的作用。而     

X射线损伤修复交叉互补基因1(XRCC1)单核苷酸多态性与神经胶质瘤易感性关系的meta分析(英文)

目的:采用meta分析方法探讨X射线损伤修复交叉互补基因1(XRCC1)单核苷酸多态性与神经胶质瘤易感性的关系。方法:研究检索了PubMed、EMBASE、ISIWeb ofsciences、ScienceDirect及CNKI数据库从建库至2012年9月关于XRCC1基因多态性与神经胶质瘤相关性的相关文献。合并的OR值及其95%CI用于评估不同基因模型与神经胶质瘤风险的关联强度。采用亚组分析和meta回归分析来探索潜在的异质性来源。结果:研究最终纳入12篇Arg399Gln、8篇Arg194Trp和5篇Arg280His XRCC1位点多态性与神经胶质瘤关系文章用于meta分析。Arg399Gln位点多态性在所有基因模型下合并OR值均有显著意义;Arg194Trp位点多态性在纯合子基因模型和隐性基因模型下合并OR值具有显著意义;未发现Arg280His位点多态性与神经胶质瘤风险相关基因模型。亚组分析和meta回归分析显示Arg399Gln位点多态性的所有基因模型风险仅在亚洲人群当中具有显著意义,亚洲人群的风险显著高于白种人群。Arg194Trp对照组人群不符合Hardy-Weinberg平衡(HWE)可能高估了风险。结论:本研究结果显示XRCC1 Arg399Gln基因多态性仅为亚洲人群的神经胶质瘤风险的候选基因,Arg194Trp基因多态性的风险可能是由于对照组不符合HWE的研究所导致的。     

Functional implications of mitochondrial reactive oxygen species generated by oncogenic viruses

Between 15% and 20% of human cancers are associated with infection by oncogenic viruses. Oncogenic viruses, including HPV, HBV, HCV and HTLV-1, target mitochondria to influence cell proliferation and survival. Oncogenic viral gene products also trigger the production of reactive oxygen species which can elicit oxidative DNA damage and potentiate oncogenic host signaling pathways. Viral oncogenes may also subvert mitochondria quality control mechanisms such as mitophagy and metabolic adaptation pathways to promote virus replication. Here, we will review recent progress on viral regulation of mitophagy and metabolic adaptation and their roles in viral oncogenesis.