一株橡胶降解菌Rhizobacter gummiphilus NBRC109400的全基因组测序及功能挖掘

Rhizobacter gummiphilus NBRC 109400是一种新发现的具有降解天然橡胶能力的革兰氏阴性菌,为进一步探究该菌株降解天然橡胶的作用机制,挖掘菌株可能存在的功能特性,本研究使用第三代高通量测序技术对R. gummiphilus NBRC 109400进行全基因组测序,基于完成图进行基因预测、功能注释以及次级代谢产物合成基因簇预测,并对其橡胶降解蛋白进行挖掘。该菌株基因组大小为6 398 100 bp,GC含量为69.72%。该基因组共预测得到9个次级代谢产物合成基因簇,其中2号基因簇与来自菌株Delftia acidovorans SPH-1的delftibactin金生物矿化基因簇同源并进行了探究。定位了该菌株的橡胶降解关键蛋白LatA橡胶加氧酶,同时,预测到一个可能与菌株降解橡胶途经相关的同工蛋白CPZ87_07230。全基因组序列已提交至美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GenBank数据库,登录号为CP024645。以上研究将为菌株NBRC 109400的功能基因组学研究及橡胶降解特性研究提供基础数据。     

杜仲橡胶合成相关酶基因HMGR的克隆与表达分析

为解析HMGR基因在杜仲橡胶生物合成中的作用,本研究以杜仲良种华仲6号叶片和果皮为材料,参考杜仲基因组和转录组数据,克隆了杜仲HMGR基因,命名为Eu HMGR,全长1770 bp,编码590个氨基酸。实时荧光定量PCR测定结果显示,EuHMGR基因在果皮中的表达量于5月中旬达到最大值,而在叶片中的最大值出现在7月中旬。通过索氏提取测定相应时期果皮和叶片的含胶量表明,果皮中的含胶量从4月中旬到5月下旬迅速增加,而叶片中的含胶量一直平稳增长。分析不同发育时期果皮和叶片Eu HMGR基因表达量和含胶增长速率相关性发现,果皮Eu HMGR基因在不同发育时期的相对表达量和含胶增长速率呈显著正相关,而二者在叶片中无明显相关性。因此,推测Eu HMGR基因的表达与杜仲果皮中橡胶生物合成相关。     

橡胶炭疽病病原菌生物学特性初步研究

测试了7个来自云南省版纳地区的橡胶树炭疽病菌的菌株在不同培养基、温度及pH条件下的生长速率,观察了这些菌株在PDA上的菌落和分生孢子形态,测定了这些菌株的致病力。发现这些菌株的最适生长的培养基、温度、pH和对橡胶树的致病力存在明显的差异,对橡胶树的致病力有明显不同,菌落和分生孢子形态也存在可观察到的差异。     

中国橡胶种植北界

基于中国橡胶的地理分布信息及其相应的气候资料,结合最大熵模型,明确了影响中国橡胶种植的5个主导气候因子,即最冷月平均温度、极端最低温度平均值、月平均温度≥18℃月份、年平均气温和年平均降水量。在此基础上,给出了80%气候保证率下中国橡胶树稳产高产的种植北界,该北界准确覆盖了目前中国橡胶主产区的实际种植区域。研究结果可为中国橡胶种植优势区域布局规划及防灾减灾提供科学决策依据。     

黄斑橡胶榕离体再生体系的建立

以黄斑橡胶榕(Ficus robusta“Yellow spot”)的顶芽为外植体进行离体培养与植株再生研究。结果表明,黄斑橡胶榕的诱导培养基以MS BA 2.0 mg L-1 NAA 0.1 mg L-1为宜;继代增殖以MS BA 1.0 mg L-1 NAA 0.05 mg L-1为宜,每个外植体可产生3个芽;生根培养基以MS IBA 0.1 mg L-1 AC 100 mg L-1为宜,生根率96.67%以上。试管苗移栽成活率达到98%以上。     

纳版河自然保护区橡胶和农作物种植对畜禽养殖数量的影响

为评价纳版河流域国家级自然保护区橡胶和农作物种植对畜禽养殖数量的影响,选取13个村寨、207户农户为调查对象,从种植业和养殖业两个方面进行了系统调查.结果表明:纳版河保护区饲养的畜禽主要是本地水牛、黄牛、滇南小耳猪、茶花鸡和少量版纳斗鸡,外来品种极少.1991-2008年,纳版河保护区橡胶种植面积逐年上升,影响了玉米、水稻和其他经济作物的种植和畜禽养殖数量.橡胶种植对水牛和滇南小耳猪养殖数量影响显著,未种植橡胶的家庭水牛和滇南小耳猪养殖数量显著高于种植橡胶的家庭;玉米、水稻和其他经济作物种植面积对水牛、黄牛和滇南小耳猪养殖数量产生积极影响;总种植面积对水牛和茶花鸡养殖数量有着积极的影响.橡胶的发展导致纳版河保护区土地利用方式发生明显改变,种植模式对畜禽养殖数量产生显著影响,随着橡胶种植面积的逐年上升,当地的畜牧业受到抑制.     

橡胶止血带表面细菌调查与医院感染关系的探讨

橡胶止血带在现行的医疗护理工作的采血和静脉输液中医院仍广泛使用。近年来，世界范围内医院感染日趋严重，尽管采用某些控制手段（如合理应用抗生素和免疫抑制剂、插入性操作的无菌程度等），但医院感染还时有发生［１］。在一次性医疗大范围应用时，唯有橡胶止血带依然多人交叉使用。能否引起医院感染，相关报道甚少，本文就此问题进行实验研究，结果报告如下。１ 材料与方法１.１１０５份橡胶止血带取自１９９９年８月～１０月间，我院３５个临床科室，以消化内科、呼吸内科、烧伤科和急诊室为主，经统计每份止血带使用１０ｄ～１４ｄ，…     

废旧橡胶颗粒填充草坪根带基质及草坪植物生态响应

选择4种不同粒径大小的废旧橡胶颗粒分别与壤土、粘土、沙土组配草坪基质,通过组配基质构建草坪建植体系,研究了草坪植物的生态响应。通过对各生态指标综合效应分析,结果表明：壤土组配基质中,胶粒粒径为0.5~1 mm与4~6 mm组配基质要好于1~2 mm和2~4 mm组配基质;粘土组配基质中,1~2 mm胶粒组配基质为最好;对于沙土组配基质,1~2 mm和2~4 mm粒径的胶粒组配基质要优于0.5~1 mm与4~6 mm的组配基质。比较发现,从草坪植物生长角度来看,以沙土填充废胶粒为介质组配运动场草坪基质具有较好的应用前景。     

橡胶褐根病拮抗放线菌17-7的筛选、鉴定及发酵条件优化

[背景]由有害木层孔菌(Phellinus noxius Corner)侵染引起的橡胶树褐根病是严重危害橡胶树的一类病害,给橡胶产业造成巨大的经济损失。[目的]从橡胶树根际土壤中筛选对橡胶树褐根病菌具有高拮抗活性的放线菌菌株,为该病害生防药剂的研发提供基础。[方法]采用稀释涂布法分离放线菌,平板对峙法、抑制菌丝生长速率法筛选拮抗菌株,通过培养特征、生理生化特征及16S rRNA基因序列分析确定其分类地位;利用单因子试验和正交试验相结合确定其最优发酵配方及培养条件。[结果]筛选到一株对橡胶褐根病具有较强抑制作用的放线菌菌株17-7,其对橡胶树上的5种病原菌均有较好的抑制作用。菌株17-7与桑树链霉菌(Streptomyces samsunensi)亲缘关系较近,且形态特征、培养特征和生理生化特征基本相符。该菌株最优发酵配方和培养条件分别为:葡萄糖20.0 g/L、大豆粉25.0g/L、KH2PO4 1.0g/L、NaCl 0.5 g/L、CaCO30.5g/L,培养基装瓶量为150 mL/500 mL,起始pH 8.0,摇瓶培养转速为140 r/min,接种量为10%,培养温度为28℃,培养时间为5 d。[结论]菌株17-7被鉴定为桑树链霉菌(Streptomyces samsunensi),其对橡胶褐根病具有较强的拮抗作用。     

浅议景观管理对云南阳春砂仁药物成份形成的重要性

阳春砂仁是我国四大南药之一,也是主要的调味品。阳春砂仁于1960年由广东引入云南西双版纳,现广泛种植于云南省热带区域。阳春砂仁含有以乙酸龙脑酯和樟脑为主的40～50种化学物质,具有提高胃酸分泌、促进胃肠动力、止泻利胆和镇痛抗炎等功效。在云南热带区域,砂仁主要传粉者为大蜜蜂和中华蜜蜂,传粉蜂的传粉行为可提高砂仁的结果和结实。在云南热带区域,大量热带雨林转换成橡胶树和耕地等非自然生境,引起生态系统景观结构变化。大蜜蜂和中华蜜蜂为社会性传粉昆虫,其种群数量易受环境干扰而变化。因此,云南热带砂仁种植区景观变化可能引起砂仁传粉蜂多样性和多度变化,从而影响砂仁药效成份的形成和含量。从理论上来看,目前并不清楚景观动态对砂仁药效的作用;在生产实践中,砂仁种植者并未考虑景观变化对砂仁药效形成的影响。本文总结已有的研究结论,在理论上提出云南砂仁种植区应综合考虑砂仁种植环境的景观调节因素,以保障昆虫传粉需求,促进砂仁药效成份的形成。