基于序列特征的环状RNA识别

环状RNA是新发现的一类具有重要生物学功能的RNA。现有的环状RNA识别工具依赖高通量测序数据,因数据本身和识别方式的弊端而普遍存在准确性不足、不同方法间重复性低以及假阳性率/假阴性率高等缺点。为了解决该问题,我们搭建模型来实现不依赖于测序数据而根据序列的内在特征的环状RNA从头预测。本文选取了包括剪接位点上下游内含子的长度、A-to-I密度和Alu重复序列等100个与RNA成环相关的序列特征,建立了机器学习模型,并识别了人类基因组中的环状RNA,比较了两种机器学习方法随机森林法(RF)和支持向量机(SVM)的分类效果。结果表明,所选序列特征能有效地鉴别RNA能否成环,同时,不同序列特征对模型的分类预测能力的贡献也不同。相比于SVM方法,RF分类的效果更好。     

城市绿地-三维建筑格局对大气污染物的影响研究进展

随着城市化的快速扩展,城市大气污染已成为威胁城市居民身心健康的重要因素。城市绿地和三维建筑格局是构成城市格局的主要要素,对城市下垫面大气污染物的扩散具有重要作用。本文系统分析了城市绿地对大气污染物沉降、吸收和扩散的影响,明晰了三维格局的量化及其对大气污染物的影响,综合评述了城市绿地-三维建筑格局对大气污染物的复合调控作用。建议未来研究以实地监测为污染物浓度的主要获取途径,从街谷、社区、城市和城市群等4个尺度系统探索城市绿地-三维建筑格局对大气污染物分布和扩散的影响,揭示多尺度大气污染物浓度的扩散及其驱动机制,基于大气污染物减缓为城市绿地、建筑格局的规划与管理提供科学依据。     

云南思茅翠云石灰岩山剑叶龙血树群落的研究

根据6个10m×10m样地的调查资料,对思茅翠云石灰岩山森林的群落学特征进行了分析研究,结果显示:(1)云南思茅翠云石灰岩山森林主要由常绿的剑叶龙血树形成单优群落,而群落内随乔木径级的增大,个体/种的数量逐渐减小。(2)该群落在600m2样地内,共计维管束植物123种,隶属于65科110属;其中乔木种类最为丰富,共有51种,隶属29科46属,而林下草本和层间藤本植物种类次之,灌木和附生植物种类较少。(3)群落主要以高位芽植物为主,其中又以中高位芽植物比例最大,占所统计总数的35.77%;在叶片生态学特征方面,群落以常绿(65.04%)、中叶(56.1%)和小叶(40.7%)、单叶(73.98%)、纸质(59.35%)、全缘(64.23%)、非尾尖(91.06%)为主。(4)该群落是一种基本上常绿或半常绿的森林群落,与经典的“季雨林”特征不符,应是一种滇南石灰岩山地上发育的特殊森林植被类型。     

美国西北部森林动物危害控制研究动态

美国西北部森林动物危害控制研究动态张知彬（中国科学院动物研究所北京１０００８０）关键词动物危害控制，森林生态系统，免疫不育，美国１危害状况华盛顿州和俄勒冈州是美国西部的重要森林基地。松树（Ｐｉｎｕｓｐｏｎｄｅｒｏｓａ）、雪杉（Ｐｓｅｕｄｏｔｓｕｇａｔ...     

森林旅游资源评价中的空气负离子研究

空气负离子被喻为空气维生素或生长素,对人体健康有利。自英国学者威尔逊与法国学者埃尔斯特和格特尔证实空气负离子的存在,人们对空气负离子的研究经历了近百年的发展、应用阶段１）。在我国,解放区战地医院曾采用了空气雾疗法,５０年代有关文献中出现了空气负离子的...     

林隙（gap）更新动态研究进展

林隙（ｇａｐ）更新动态研究进展臧润国（中国林业科学研究院生态环境研究所,北京１０００９３）ＲｅｓｅａｒｃｈＡｄｖａｎｃｅｓｏｆＧａｐＲｅｇｅｎｅｒａｔｉｏｎＤｙｎａｍｉｃｓ．ＺａｎｇＲｕｎｇｕｏ（ＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＥｃｏｌｏｇｙａｎｄＥｎｖｉｒ...     

九寨沟自然保护区森林植物的数量分类

九寨沟自然保护区森林植物的数量分类杨远兵刘玉成方任吉（西南师范大学生命科学系,重庆６３０７１５）ＮｕｍｅｒｉｃａｌＣｌａｓｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆｔｈｅＦｏｒｅｓｔＶｅｇｅｔａｔｉｏｎｉｎｔｈｅＪｉｕｚｈａｉｇｏｕＮａｔｕｒｅＲｅｓｅｒｖｅ．ＹａｎｇＹ...     

棉田多虫复合危害互作效应及“两红”复合防治指标应用研究

针对长江中游棉区棉花多虫复合危害问题,设计了６种害虫４种组合的复合危害系统．运用通径分析方法,定量描述了多种害虫对棉花的侵害及其间的互作效应．通过多种害虫对棉花产量和品级的直接影响效应和间接影响效应分析,认为当多虫复合危害时,害虫间的相互作用就其对作物的侵害而言,表现为增强效应和减弱效应．在此基础上,研究并制定了“两红”（棉红铃虫和朱砂叶螨）复合危害动态防治指标,经验证、示范及推广应用,取得了显著的经济、生态和社会效益．     

森林流域土壤饱和渗透系数与有效孔隙度模型的研究

以长白山自然保护区内未受扰动的两种典型原始森林土壤为对象,通过野外选取原状土样,在实验室内测定其饱和渗透系数和有效孔隙度,利用回归分析法分别建立了森林土壤内饱和渗透系数和有效孔隙度随深度变化的数学模型,即Ｋｓ（ｚ）＝Ｋ０－ｆ１ｌｎａ１ｚ和ω（ｚ）＝ω０－ｆ２ｌｎａ２ｚ．将所得出的对数模型与Ｂｅｖｅｎ所提出的指数模型进行比较表明,在森林流域内对数模型不仅适用范围比指数模型广,而且精度明显高于指数模型,它更接近于野外实际情况．     

江苏宜兴森林自然保护区种子植物区系特点及植被性质

对江苏宜兴森林自然保护区及周边地区的种子植物区系成分进行统计分析,归为４大类１５个分布类型。属的成分以温带比例最高（６１％）,东部成分亦较明显（２５％）,中西部成分极少,几无本地特有成分,属较典型的华东植物区系地区。对该地区现存植物进行计算分析,结合栽培植物及古植被资料,得出以青冈〔Ｃｙｃｌｏｂａｌａｎｏｐｓｉｓｇｌａｕｃａ（Ｔｈｕｎｂ．）Ｏｅｒｓｔ．〕、石栎〔Ｌｉｔｈｏｃａｒｐａｇｌａｂｅｒ（Ｔｈｕｎｂ．）Ｎａｋａｉ〕等为建群种的中亚热带常绿阔叶林是本地区的地带性植被。自然保护区建立（１９８１）以后植被恢复明显,许多样地已接近自然植被。