亮氨酸拉链作为一种蛋白二聚化的工具

亮氨酸拉链是蛋白质中一种常见的结构模体,也是最简单的二局界面之一,它由可特异结合DNA的"碱性区"和螺旋盘绕起二聚作用的"拉链区"组成。本文简述其二聚化的特性,探讨了利用其诱导蛋白二聚化的思路。     

伊蚊浓核病毒三维结构的比较分析

细小病毒是目前已知的结构最小的病毒, 其宿主范围很广. 利用冷冻电镜和三维重构技术获得了伊蚊浓核病毒1.2 nm分辨率下的三维结构, 并利用计算机生物信息处理技术和氨基酸序列比对技术比较了该病毒和其他细小病毒的结构和序列的异同. 尽管均属于浓核病毒亚科, 但是无论从衣壳结构还是其蛋白质的氨基酸序列上, 伊蚊浓核病毒和其他昆虫的细小病毒都有很大差异. 相比之下, 伊蚊浓核病毒和人类B19细小病毒的衣壳蛋白相似性较大, 两者的结构蛋白和非结构蛋白一致性也高于伊蚊浓核病毒与其他昆虫的细小病毒的一致性. 此结果表明: 伊蚊浓核病毒和人类B19细小病毒有着密切关系, 前者可能来源于B19病毒的较近期变种.     

沙眼衣原体多形态膜蛋白D基因序列分析及其B细胞抗原表位预测

分析沙眼衣原体多形态膜蛋白D(PmpD)的基因序列并预测PmpD蛋白的B细胞抗原表位。在GenBank中检索沙眼衣原体不同血清型的PmpD基因序列,进行序列比对分析。以L2血清型PmpD基因序列为材料,采用Karplus-Schulz、Chou-Fasman和Gamier-Robson方案预测蛋白质的二级结构和柔性区;按Jamesonv-Wolf方案预测抗原指数,运用Kyte-Doolittle方案预测PmpD氨基酸的亲水性,利用Emini方案预测蛋白质的表面可及性。检索到20个沙眼衣原体不同菌株的PmpD基因序列,分析发现其核苷酸序列非常保守,一致性高达99.14%~100%;对预测结果综合分析,推测最有可能的B细胞表位位于PmpD N端的67~74、132~140、335~340、851~861、972~988及1091~1097。多参数方案综合预测PmpD蛋白的B细胞抗原表位,为进一步实验鉴定PmpD抗原表位及其多表位疫苗设计和研究奠定基础。     

热激蛋白的分子生物学研究进展

热激蛋白的分子生物学研究进展费云标,黄涛,舒念红,江勇（中国科学院发育生物研究所,北京１０００８０）ＡＤＶＡＮＣＥＳＯＦＭＯＬＥＣＵＬＡＲＢＩＯＬＯＧＹＯＮＨＥＡＴＳＨＯＣＫＰＲＯＴＥＩＮＳ￥ＦｅｉＹｕｎ－ｂｉａｏ;ＨｕａｎｇＴａｏ;ＳｈｕＮｉａｎ－...     

云南地方猪种血液蛋白多态性研究

采用蛋白电泳技术研究了云南地方猪种血液蛋白多态性。共分析了3个云南地方猪种32-36个遗传位点,其中AKP、CAT、DIA、ES、G6PD、PA、6PGD、PHI、TF等9个 位点检测到多态性,多态位点百分比为0.1875-0.2121,平均杂合度为0.0712-0.1027。结果表明,云南地方猪种血液蛋白多态程度较高,反映在蛋白水平上的遗传多样性较为丰富。 Abstract:In this paper,protein electrophoresis was used to analyze the blood protein polymorphism in Yunnan local pig breeds and 32~36 genetic loci in the Yunnan local pig breeds were surveyed,Nine of them,such as AKP、CAT、DIA、ES、G6PD、PA、6PGD、PHI and TF,were found to be polymorphic,the mean heterozygosit(H)was 0.0712~0.1027.The results indicated that the blood protein polymorphism in the Yunnan local pig breeds is high,the Yunnan local pig breeds are wealthy in genetic diversity in point of their protein level.     

水通道蛋白1-C末端肽段/GST融合蛋白的原核表达(简报)

水通道蛋白(Aquaporin,AQP)是一类选择性高效转运水分子的细胞膜通道蛋白,广泛存在于原核和真核生物细胞的细胞膜上,主要介导自由水分子的被动跨膜转运,对保持细胞内外液环境的稳态平衡起着重要的作用.     

大白菜包叶特异基因的克隆及其结构特征和表达方式

大白菜营养生长经历幼苗期、莲座期、包心期和结球期4个生育时期,每个时期分别以幼叶、莲座叶、包叶和球叶为主要形态标志.构建了大白菜包心早期茎尖组织特异的cDNA文库,分别与莲座叶和包叶cDNA两个探针进行差异杂交,筛选出一个全长的cDNA克隆BcpLH.DNA序列和推导氨基酸序列同源性比较表明,该基因编码的蛋白质含有两个双链RNA结合结构域(dsRNA-binding domains),与人和小鼠dsRNA结合蛋白基因TRBP具有较高的同源区域.PCR表达分析的结果表明,BcpLH基因主要在包心期的包叶组织中表达.在包心期用IAA涂抹植株显著增加了包叶中BcpLH基因的转录产物.据此认为,BcpLH基因与包叶的发生和叶球的形成有关,它的表达受生长素的诱导调节.     

免疫信号轴揭示水稻与病原菌斗争的秘密

近年,我国学者在水稻(Oryza sativa)广谱抗病机制、抗性与产量协调机制等方向的研究取得了一系列突破性进展。最近,何祖华和杨卫兵团队在水稻抗病性研究中再次取得突破,发现1个以钙感应蛋白ROD1和过氧化氢酶CatB为核心的信号轴,通过负调控水稻免疫反应,保证正常生长条件下维持低水平的免疫反应,促进水稻正常生长发育...     

人红细胞膜上阴离子交换蛋白和葡萄糖运输蛋白的相互影响

用细胞松弛素Ｂ抑制红细胞膜上葡萄糖运输蛋白（ＧｌｕＴ－１）对葡萄糖的运输,观察到对阴离子运输有促进作用。当ＧｌｕＴ－１结合其底物分子－葡萄糖后同样加快了阴离子运输速率．另一方面,实验办给出了葡萄糖跨膜运输特性和Ｃｌ－离子浓度的关系,表明随着Ｃｌ－离子浓度的加大能使葡萄糖运输过程中Ｋｍ减小、Ｖ（ｍａｘ）增大。这些结果表明了在完整红细胞膜上阴离子交换蛋白Ｂａｎｄ３和ＧｌｕＴ－１之间存在着双向联系,即一种膜蛋白的构象改变能影响另一种膜蛋白的功能。     

支持向量机方法预测蛋白质结构中的二硫键

在蛋白质结构预测的研究中,一个重要的问题就是正确预测二硫键的连接,二硫键的准确预测可以减少蛋白质构像的搜索空间,有利于蛋白质3D结构的预测,本文将预测二硫键的连接问题转化成对连接模式的分类问题,并成功地将支持向量机方法引入到预测工作中。通过对半胱氨酸局域序列连接模式的分类预测,可以由蛋白质的一级结构序列预测该蛋白质的二硫键的连接。结果表明蛋白质的二硫键的连接与半胱氨酸局域序列连接模式有重要联系,应用支持向量机方法对蛋白质结构的二硫键预测取得了良好的结果。