噬菌体phi29末端酶gp16蛋白C端结构域在溶液中的构象分析

噬菌体phi29是一种双链DNA病毒,它的增殖和成熟过程需要将较大的子代DNA包装入一个空间极其有限的新生病毒衣壳中,这一步骤由其转运马达完成.转运马达具有三个部分:头颈连接器蛋白(the connector)、pRNA和ATP水解酶蛋白(gp16).在结构预测中发现gp16蛋白的C端结构域可能与pRNA或DNA结合,但尚未有相关文献可以证明这种相互作用,因此其结构的解析成为研究其功能的关键.本文利用大肠杆菌SUMO表达系统,对噬菌体phi29 gp16蛋白的C端结构域进行重组构建并诱导表达后,通过Ni-NTA亲和层析纯化,再用分子排阻色谱获得高纯度的目的蛋白质单体,纯度达到95%左右.最后用X射线小角散射技术(small angle X-ray scattering)对其构象进行分析,收集小角散射数据,当目的蛋白的浓度为1.3 g/L、所得到的目的蛋白的三维结构与同源蛋白FtsK的晶体结构高度拟合,且通过CRYSOL软件反推计算的曲线与实验曲线高度重合.通过原核表达、纯化及结构分析,成功获得了该结构域在溶液中的状态信息.这一研究不仅为后续关于该结构域的功能研究奠定基础,也为病毒感染的诊断和治疗提供新思路.     

解脂假丝酵母中神经酰胺的鉴别和定量分析

采用制备型薄层板分离解脂假丝酵母 (Yarrowialipolitica)中与神经酰胺标样近似的脂类成分 ,将其用于二级质谱分析 ,确认了其结构为脂肪酸碳链长度为 2 4的神经酰胺。结合高效液相色谱 蒸发光散射检测器 (HPLC ELSD)的检测方法 ,首次定量报道了解脂假丝酵母中神经酰胺的含量为 2 5‰。     

基于光纤式动态光散射的人血清白蛋白研究

人体尿液中血清白蛋白急剧增加会导致肾脏病发生几率增大,利用动态光散射技术(dynamic light scattering,DLS)研究人血清白蛋白有助于推动诊断肾脏病的早期发现。分析了人血清白蛋白的物理模型;利用单模光纤搭建了动态光散射实验系统,并配制了实验所需的人血清白蛋白水溶液;最后使用该系统研究了人血清白蛋白分子的扩散系数在不同蛋白浓度和pH值条件下的扩散系数。实验和分析结果表明库仑力对蛋白质的扩散起主要作用,在等电位点下(pH=5.2)库仑力的影响消失,蛋白质的扩散系数最小;在等电位点测量出扩散系数随浓度的增加而线性减小;在浓度5 mg/mL～40 mg/mL内互扩散系数Dm=D0[1-(0.00194±0.00008)],D0=(6.74±0.01)×10-7cm2/s为外推至零浓度下23℃时蛋白质的扩散系数。这里C为蛋白质浓度,实验测得人血清白蛋白的半径为(3.44±0.01)nm。     

抗ErbB2嵌合抗体chA21聚集现象的鉴定和分析

聚集现象是目前基因重组抗体面临的挑战之一.采用高效排阻色谱(HPSEC)、动态光散射(DLS)、SDS-PAGE和间接ELISA鉴定抗ErbB2嵌合抗体chA21聚集的形式和性质,并比较温度和添加剂对抗体聚集程度,抗原结合活性的影响,用圆二色谱(CD)检测不同聚集条件下蛋白构象的变化,最后将抗体酶解分离分析聚集的部位.结果表明:chA21在溶液中可形成二聚和更高形式的聚集,聚集体是通过非共价键相互作用形成,并仍保留抗原结合活性,聚集程度和活性受温度和添加剂影响,而蛋白质的构象相对稳定,抗体可变区的相互作用可能是引起聚集的主要原因之一.对抗体聚集现象的分析有助于建立稳定的抗体保存条件,并为今后抗体进一步改造提供依据.     

用蒙特卡罗方法模拟光在多层组织中的吸收特性

在讨论目前新颖的组织功能成像打骂能性（例如光声成像）时,光子在组织中的吸收和散射特性是一个很重要的问题,鉴于这一点,本文利用一个多层模型研究了光子在皮肤,脂肪和肌肉组织中的吸收和散射特性,得到了在组织中某一深度处光子在一个平面上的吸收分布,以及在不同吸收系数和散射系数的情况下,光子的反射,吸收和透射几率,结果表明在经过多次散射后,大部分的光子被吸收,在本文的模型中只有7.3%的光子从表面反射（包括镜面反射和漫反射）,还讨论了不同光学参灵敏对参流分布的影响。     

HPLC—ELSD法测定桔梗中桔梗皂苷D的含量

首次采用高效液相-蒸发光散射检测器色谱法测定桔梗[Platycodon     

Scanning Microfocus Small Angle X-ray Scattering Study of the Avian Eggshell

Synchrotron microfocus small angle X-ray scattering was used to investigate the nanostructure and microscopic variation of eggshells. It uses a microbeam allowing the ability to probe interactions between the organic and inorganic components at nanometer level and is ideal for mapping over small areas to obtain a detailed analysis of structural variations. Thin sections of eggshells were scanned from the shell membrane （inner） to the cuticle （outer） surface. The data collected was used to produce two-dimensional maps showing microscopic changes within the different layers of the eggshell. The structural alterations ap- parently could have implications at the macroscopic level of the resulting eggshell. As the organic matrix is embedded within the eggshell this may contribute to the variations observed in calcite crystal form and texture, Structural information obtained about a biomaterial at different length scales is important in relating the structure to its functional properties. This knowledge and the principles behind the formation of biomaterials could be used in the attempt of bioengineering new systems.     

分析超速离心研究多聚酸性氨基酸对SnRK2.6的影响

分析超速离心技术是一种通过检测分子在离心场作用下的沉降行为,分析获得其沉降系数、扩散系数、流体力学半径、摩尔质量、结合常数等水力学和热力学性质的方法,被广泛应用于蛋白质分子溶液性质的研究中.本文利用分析超速离心技术研究了拟南芥Sn RK2.6(sucrose non-fermenting1-related protein kinase 2.6)末端一段多聚酸性氨基酸序列对其溶液性质的影响,并将多聚酸性氨基酸序列Sn RK2.6(333~362)及人源PDI(protein disulfide isomerase)(441~491)连接至拟南芥PYL10(PYR like protein 10)分子末端进行分析,同时结合分子排阻层析和静态光散射技术,研究了上述蛋白质分子的分子质量和聚合状态.结果表明,多聚酸性氨基酸序列可以引起蛋白质分子轴长比增加,在溶液中运动时摩擦系数增加,水合半径明显增大,分子排阻层析洗脱体积明显变小.     

线型链支化链网状链生物大分子的分维测量

本文应用光散射技术研究了几种生物大分子在水溶液中的分形性质。当温度高于胶凝临界温度时,直链淀粉（线型链）、明胶（线圈状链）的分维ｄｆ为５／３,支链淀粉（支化链）的分维为２．２￣２．５。在直链淀粉及明胶水溶液胶凝点（网状链）ｄｆ＝２．０。文章还讨论了ｄｆ与样品温度、浓度的关系。     

基于信号稀疏表示的高光谱散射图像苹果粉质化分类

苹果的粉质化是指苹果果肉发软、汁液减少等一系列物理和生理变化现象,采用高光谱散射图像技术结合信号稀疏表示分类算法(SRSA)研究了苹果的粉质化分类问题。首先利用平均反射算法(MEAN)提取了600～1000 nm的高光谱散射图像特征;引入遗传算法(GA)解决分类样本的不均衡问题,在此基础上,把苹果的粉质化分类问题,转化为一个求解待识别样本对于整体训练样本的稀疏表示问题。仿真结果表明,基于信号稀疏表示分类算法的苹果粉质化分类精度为79.8%,高于偏最小二乘判别分析(PLSDA)的74.8%,为苹果的粉质化分类提供了一种新的有效的方法。