植物乳杆菌p-8亚油酸异构酶系的氨基酸序列及同源建模分析

利用生物信息学相关服务器分析植物乳杆菌p-8的亚油酸异构酶系的CLA-HY、CLA-DH、CLA-DC和CLA-ER的一级和二级结构,预测了其亲疏水性、跨膜区域、信号肽和磷酸化位点,构建了CLA-HY、CLA-DH、CLA-DC和CLA-ER蛋白家族的系统进化树并进行同源建模分析了其三维结构.结果 表明,4个蛋白均呈酸...     

染料木素抗结直肠癌分子机制的研究进展

结直肠癌是世界范围内的恶性肿瘤,发病率逐年上升,预后差且尚无有效治疗药物。迫切需要探索挖掘结直肠癌发生发展的机制及寻找新的治疗药物。染料木素已被大量研究证明可用于结直肠癌的治疗。它是一种多酚异黄酮化合物,大量存在于大豆或大豆制品中,在亚洲人群中被广泛食用。具有多种生物活性,包括抗糖尿病、抗炎症、抗肥胖和抗血管生成、心脏保护功能及抗癌,其中抗癌作用研究最为广泛。染料木素抗结直肠癌的分子机制涉及多个方面：抑制肿瘤细胞增殖、侵袭及迁移,抗凋亡、氧化应激和炎症等。本文将围绕以上几个方面展开论述,将近年研究成果进行总结,以开发具有良好抗癌潜力的新型治疗药物,为结直肠癌的治疗提供理论基础。     

蛋白质二硫键异构酶的纯化和活力测定

 从500g新鲜牛肝制得蛋白质二硫键异构酶(PDI,EC 5.3.4.1)98mg。该酶制剂在SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳中表现为亚基分子量62,000的均一条带。在260nm追踪,因二硫键错接而失活的牛胰核糖核酸酶A,经PDI作用使其二硫键重排恢复活力,从而催化酵母RNA的水解来测定PDI活力。这种单波长法比文献中介绍的追踪A_(260)—A_(280)的双波长法更为灵敏方便。酶的克分子消光系数ε_M=1.03×10~5(pH7.5),其比活性为1400单位/克蛋白质。     

大肠杆菌拓扑异构酶I结合重金属的特性及功能影响

【背景】大肠杆菌拓扑异构酶Ⅰ(Escherichia coli topoisomerase I,E.coli TopA)在DNA复制、转录、重组和基因表达调控等过程发挥关键作用。研究表明E.coli TopA只有结合锌离子才具有活性,然而E.coli TopA能否结合其他金属离子尤其是重金属离子,以及结合其他金属后是否具有活性,目前仍不清楚。【目的】探究大肠杆菌拓扑异构酶Ⅰ是否结合环境中常见重金属离子,研究重金属离子结合E.coli TopA蛋白后对其活性的影响。【方法】在分别添加有锌、钴、镍、镉、铁、汞、砷、铬、铅、铜离子的M9基础培养中表达、纯化出E.coli TopA蛋白,并对纯化得到的蛋白用电感耦合等离子体质谱仪进行相应金属离子含量的测定;利用表达E.coli TopA锌指结构的突变体蛋白鉴定重金属离子的结合位点;通过体外超螺旋DNA松弛实验测定不同金属结合E.coli TopA的拓扑异构酶活性;通过测定蛋白内源性荧光推测不同金属结合E.coli TopA的空间构象差异。【结果】E.coli TopA在体内除了能结合锌和铁之外,还能够结合钴、镍、镉3种离子,但是不能结合汞、砷、铬、铅、铜离子。钴、镍、镉结合形式的E.coli TopA,每个蛋白分子最多可以结合3个相应的金属离子,他们与TopA蛋白的结合位点也是位于3个锌指结构域,而且每个锌指结构域结合1个金属离子。此外,E.coli TopA结合钴、镍、镉离子后,其DNA拓扑异构酶活性并未受到影响,可能是由于钴、镍、镉离子结合形式的E.coli TopA蛋白,其空间构象与锌结合形式相比并未发生显著变化。【结论】由于DNA拓扑异构酶在维持细胞正常生理功能中发挥关键作用,研究表明E.coli TopA的功能不会受到常见重金属的干扰(不结合或者结合后活性无影响),这也有可能是大肠杆菌在进化过程中产生的对抗环境中重金属离子毒害作用的一种自我保护和耐受机制,具有重要的生理意义。     

木糖异构酶突变体的研究—纯化与性质

纯化了ＡｒｔｈｒｏｂａｃｔｅｒＤ－木糖异构酶的三个突变体,Ｔ８９Ｓ,Ｖ１３４Ｉ的比尖（Ｕ／ｍｇ）分别为３．４２和６．１８,Ｗ１３６Ｅ没有生。Ｔ８９Ｓ和Ｖ１３４Ｉ的活性需要二价阳离子,对于Ｔ８９Ｓ,Ｍｇ＾２＾＋的作用强于Ｃｏ＾２＾＋。在以木糖为底物时,Ｔ８９Ｓ的Ｋｍ值为４９．８ｍｍｏｌ／Ｌ,Ｖ１３４Ｉ的Ｋｍ值为９．８ｍｍｏｌ／Ｌ,在以果糖为底物时,木糖醇对Ｔ８９Ｓ是竞争性抑制剂,山梨糖醇对Ｔ８９Ｓ和     

树状单杆菌变株U—616葡萄糖异构酶的研究

以树状黄杆菌ＮＲＲＬ１１０２２为出发菌株,用紫外线对其进行诱变,经筛选得到一株葡萄糖异构酶的高产菌株Ｕ－６１６,其酶活力提高３１％,经保存三年和多次传代复测,其产酶能力保持稳定,其生长和产酶需较高的溶氧水平,最适产酶温度为３０℃,最适产酶ｐＨ为７．０－７．５,铁离子对其生长和产酶无明显的影响。所产葡萄糖异构酶的最适温度为６０￣８０℃,最适ｐＨ为７．５－８．５,Ｃｏ＾２＋和Ｍｇ＾２＋对酶有激活作用,     

拓扑异构酶Ⅱ的结构、功能及作用机制研究进展北大核心CSCD

拓扑异构酶是存在于细胞核内的一类酶,它们能够催化DNA链的断裂和结合,从而调控DNA的拓扑状态,在基因复制、转录、重组、修复和染色体重塑过程中参与了DNA超螺旋结构模板的调节。拓扑异构酶通过催化切断DNA链的磷酸二酯键,产生DNA缺口而发挥作用,这种缺口可以改变DNA分子的拓扑结构,从而解决DNA缠结状态这一问题。在哺乳动物中,主要存在I型和II型两种拓扑异构酶。拓扑异构酶I(type I topoisomerase,Top1)催化产生DNA分子上的单链缺口,而拓扑异构酶II(type II topoisomerase,Top2)则催化产生DNA分子上的双链缺口。Top2在哺乳动物中又分为α亚型和β亚型。其中,Top2α的功能主要与细胞的增殖和多潜能性相关,而Top2β在神经发育中具有重要作用。本文就Top2的结构、功能和作用机制的相关研究进展作一综述。     

人脾DNA拓扑异构酶Ⅰ的提纯及其性质的研究

 经三个步骤从人脾提纯了拓扑酶Ⅰ。SDS-PAGE和等电聚焦均显示单一蛋白带。分子量77kD,pI7.3。新生霉素和香豆霉素A_1不抑制酶活性。本实验表明,反应最适K~(+)或Na~(+)浓度为180mmol/L。反应活性不要求Mg~(2+),但5mmol/L存在时,活性增加90％。在pH5.0～9.0均有活性,但在7.5～8.0时活性较大。30℃放置24小时或50℃处理30分钟活性基本丧失。最适反应温度为37℃。对-氯汞苯甲酸强烈抑制酶活性。