老龄ICR小鼠对SARS-CoV的易感性

目的为探讨SARS的发病机制并提供易感的SARS动物模型。方法利用RT-PCR和病毒分离后免疫荧光技术检测成龄鼠和老龄鼠接种SARS-CoV后肺组织内病毒复制情况,同时观察两组动物的肺脏和肺外组织器官的病理变化,对肺组织进行免疫组化分析,观察SARS-CoV在肺内复制的主要部位。结果老龄鼠的感染率明显高于成龄鼠;老龄鼠肺脏出现更为严重的弥漫性肺泡损伤,其中两只老龄鼠的肺外器官出现了变性、灶状坏死以及血管广泛的扩张充血等全身中毒性变化;肺脏内病毒抗原主要存在于肺泡上皮细胞和间质的血管内皮细胞。结论老龄ICR小鼠对SARS-CoV的易感性明显高于成龄鼠,有可能作为研究SARS发病机制以及药物评价的动物模型。     

NRAMP1基因3′UTR多态性与新疆哈萨克族结核病易感性的研究

为了研究人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白NRAMP1基因3′UTR多态性与新疆哈萨克族结核病易感性的关系,研究选取新疆哈萨克族活动性结核病患者213例,新疆哈萨克族正常对照者211人,用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)分析的方法对NRAMP1基因3′UTR多态性进行基因分型,比较不同基因型及等位基因的频率,经统计学分析,探讨NRAMP1基因3′UTR多态性与新疆哈萨克族结核病易感性的关系.结果显示,在新疆哈萨克族活动性结核病患者组中NRAMP1基因3′UTR TGTG+/TGTG+基因型138例(64.8%),TGTG+/del基因型63例(29.6%),del/del基因型12例(5.6%);新疆哈萨克族正常对照组TGTG+/TGTG+基因型则为167例(79.1%),TGTG+/del基因型41例(19.5%),del/del基因型3例(1.4%).新疆哈萨克族结核病患者组TGTG+/del基因型和del/del基因型频率明显高于新疆哈萨克族正常对照组,差异有统计学意义(χ2=10.8,P0.01);在新疆哈萨克族结核病患者组的TGTG+等位基因频率为79.6%,del等位基因频率为20.4%,新疆哈萨克族正常对照组中TGTG+和del等位基因频率分别为88.9%和11.1%,del等位基因在新疆哈萨克族结核病患者组中的分布频率高,差异有统计学意义(χ2=13.7,P0.01).研究结果提示TGTG缺失等位基因可能是新疆哈萨克族结核病的易感基因,携带TGTG+/del和del/del基因型的新疆哈萨克族人群可能更易患结核病.     

布氏田鼠和青海田鼠自然种群鼠疫抗性差异

目的以MHC class Ⅱ gene β基因为分子标记研究布氏田鼠和青海田鼠自然种群鼠疫抗性差异的遗传基础。方法对布氏田鼠和青海田鼠进行鼠疫菌攻毒试验,并对死亡和存活的两种田鼠MHC class Ⅱ gene β基因酶切后的等位基因频率和基因型频率进行比较分析。结果布氏田鼠种群鼠疫抗性个体Rsa Ⅰ E和Rsa Ⅰ F等位基因较高的频率具有重要统计学意义(抗性个体:0.3095、0.2738;易感个体:0.0571、0.0286);青海田鼠种群鼠疫抗性个体Rsa Ⅰ F等位基因较高的频率具有重要统计学意义(抗性个体:0.3704;易感个体:0.0682)。对布氏田鼠和青海田鼠MHC class Ⅱ gene β基因纯合型序列分析显示,青海田鼠和布氏田鼠MHC class Ⅱ gene β基因有68个多态(变异)位点,占26.1%;其中布氏田鼠39个,青海田鼠27个,二者存在12碱基的差异。序列分析显示,布氏田鼠MHC class Ⅱ gene β基因在第27、53、63、70、91、126、127、128、129、160、213、214、215位碱基上存在多态性;而青海田鼠在第27、53、63、126、127、128、129、160、213、214、215位碱基上存在多态性。Rsa Ⅰ酶切揭示,青海田鼠的MHCclass Ⅱ gene β基因缺少等位基因E,多态性低于布氏田鼠,这可能是两自然种群鼠疫抗性差异的分子机制。结论 MHC class Ⅱ gene β基因多态性可能与布氏田鼠和青海田鼠鼠疫抗性存在相关性;MHC class Ⅱ gene β基因和其他未确定的鼠疫抗性标记可为研究宿主进化和疾病动力学提供有用的生物学信息。     

lncRNA CASC11靶向调节miR-498对胃癌细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响

该文探讨长链非编码RNA(lnc RNA)癌症易感性候选物11(CASC11)对胃癌(GC)细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响及分子机制。体外培养正常人胃黏膜细胞系(GES-1)和人GC细胞系(MKN-45、KATOⅢ、MKN7和HGC-27),实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-q PCR)检测细胞中CASC11、miR-498(micro RNA-498)和LIN28B m RNA的表达情况。将MKN7细胞分为对照组(NC组)、si-NC组、si-CASC11组、si-CASC11+anti-NC组、si-CASC11+anti-miR-498组,使用Lipofectamine3000转染试剂将si-CASC11、si-NC、miR-498 inhibitor、inhibitor-NC转染到细胞中。转染后, RTq PCR检测细胞中CASC11、miR-498、LIN28B mRNA的表达情况, Western blot检测细胞中LIN28B蛋白的表达情况, CCK-8法检测细胞增殖活性,流式细胞术检测细胞凋亡, Transwell实验检测细胞迁移、侵袭能力。双荧光素酶和RNA免疫...     

人冠状病毒OC43易感细胞系的高效筛选

为了筛选获得可用于人冠状病毒OC43(Human coronavirus OC43,HCoV-OC43)分离与研究的细胞系,本研究利用表达海肾荧光素酶基因的重组HCoV-OC43(rOC43-ns2DelRluc)对28种常见真核细胞系进行了易感性高效筛选研究,进一步利用亲本病毒HCoV-OC43-WT进行了细胞病变效应的观察,并采用荧光定量PCR进行复制动力学分析。实验结果显示:18种细胞对HCoV-OC43易感,HCoV-OC43在其中5种细胞中表现出较强的复制能力,包括BHK-21、293T、Huh7.0、RD等常见贴壁细胞。复制高峰在第5d出现,但HCoV-OC43感染的细胞系在6d内均未观察到典型细胞病变效应。本研究为今后HCoV-OC43的复制规律、致病机制的研究以及筛选广谱抗冠状病毒药物的提供了参考细胞系。     

利用LightCycler研究食管鳞状细胞癌与MTHFR C677T多态性的关系

亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)在叶酸代谢中起重要作用.MTHFR基因第677位核苷酸的多态性(C→T)能影响其酶活性并与肿瘤易感性有关.为比较中国北方人群MTHFR C677T多态性与食管鳞状细胞癌(ESCC)易感性之间的关系, 通过高速实时聚合酶链反应(real-time PCR)和解链曲线(melting curve)方法分析了189名ESCC患者和141名健康对照的MTHFR C677T多态性位点的基因型.结果显示,健康对照组的MTHFR C/C(纯合野生)、C/T和T/T(纯合突变)基因型的频率分别为17.7%、38.3%和44.0%.ESCC患者的T/T基因型频率(42.3%)与健康对照组无显著差异(χ2=0.089, P＞0.05),其C/T基因型频率(49.2%)仅略高于对照组(χ2＝3.890, P＜0.05),而患者组的C/C基因型频率(8.5%)显著低于健康对照组(17.7%) (χ2=6.37, P=0.012).与C/T和T/T基因型相比,C/C基因型可显著降低ESCC的发病风险(相对风险度的比值比(OR)=0.43, 95%可信区间(CI)=0.22～0.84),在吸烟者和有上消化道肿瘤家族史的患者中这一倾向更加明显.研究提示,在中国北方人群中, MTHFR C677T纯合野生基因型对ESCC的发病起保护作用.     

系统生物学、统计遗传学与分子进化演讲班通知

值此复旦大学一云南大学人类群体遗传学联合实验室成立十周年之际,两校联合邀请十多名遗传学界知名院士、教授举办统计遗传学、系统生物学与分子进化演讲班。其目的是为中美统计遗传学领域的专家学者、计算系统生物学家、从事复杂疾病遗传易感性研究的专业人员、生物信息科学工作者、研究生提供一个互相交流的平台,并为今后的项目交流和相互合作创造条件。     

恶性淋巴瘤患者及一级亲属染色体脆性部位的研究

本文对24例恶性淋巴瘤患者和20例患者的一级亲属染色体脆性部位进行了观察,发现两组的脆性部位表达率均高于正常对照,并且脆性部位3 14、11 13、6 22和12 13表达显著增高。提示这些特异的脆性部位可能与恶性淋巴瘤遗传易感性有关。Abstract:The Chromsomal aberration rate and expression frequency of common fragile sites were examined in peripheral blood lymphocyted with TC199 medium from 24 patients with malignant lymphoma and 20 of their first-degree relatives. Both the chromosomal aberration rates and expression frequencies of fragile sites obscrved in patient and their relatives were significantly higher than those of control subjects, especially the expression of fra(3)(p14), fra(11)(p22) and fra(12)(q13) which migh be affected by some genetic factors and might play an important role in genetic susceptibility to malignant lymphoma.     

RUNX3、SLC22A4和PPAR-γ的基因多态性与溃疡性结肠炎的关系

目的:探讨RUNX3(rs2236851,A→G)、SLC22A4(rs3792876,C→T)和PPAR-γ(rs3892175,A→G)基因的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)与溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)遗传易感性之间的关系.方法:选取经过临床表现、内镜、病理等方法共同确诊的UC患者81例,健康对照组154例,提取患者的全血基因组DNA,用聚合酶链反应序列特异性引物(PCR-SSP)的方法,检测UC患者、SLC22A4和PPAR-γ的基因型分布,并与健康对照组进行比较.结果:RUNX3的rs2236851位点的多态性与UC紧密相关(P<0.05);而SLC22A4的rs3792876位点与PPAR-γ的rs3892175位点的基因型分布与对照组相比.其差异无统计学意义(P>0.05).结论:RUNX3的rs2236851位点的基因多态性为溃疡性结肠炎的遗传易感因素,而SLC22A4的rs3792876位点与PPAR-γ的rs3892175位点的基因多态性与溃疡性结肠炎的遗传易感性无关.