植物ms 级叶绿素荧光动力学数据采集和分析软件

本文介绍了一套可在IBM PC(兼容)微机上运行的植物ms级荧光动力学数据采集和分析软件。本软件用C语言写成,具有汉化界面、菜单驱动、彩色人机对话窗口、操作简便、灵活,兼容性好等优点。本文着重讨论了本软件如何减少荧光动力学测量中的误差、在不过分占用内存的情况下扩大采样时间范围以及如何精确测量固定荧光(Fo)和偏转荧光(Fi)等问题。本软件和我们自行组装的植物ms级动力学荧光计——植物产量荧光计PFM-101型可广泛应用于农业、植物生态学及植物生理学的光合测量和研究。     

超声诊断科中的计算机应用

计算机发展的日新月异,其功能强、运算快、精度高、存取和查询方便,现已成为本科不可缺少的一个重要工具。我们利用图像处理软件将原灰阶图伪彩色化,检查近方例病人取得良好的效果;同时能将图像重排、加字等编辑和对某一区域作直方图计算;将图像存储、再现和传输,决不会降低图像质量。利用FOXBASE+等软件进行病人资料的管理、数据统计和文件处理。作者提出了超声的三维成像和图像处理网络的会诊中心,如能实现将是超声诊断上一台阶。     

时间分辨荧光光谱测量结果的一种数据处理改进方法

在综合矩方法和拉普拉斯变换方法原理的基础上,本文报道一种时间相关单光子计数测出的荧光衰变动力学曲线的数据处理的改进方法.此方法使我们能在花费时间较少的条件下得出和用最小二乘法拟合相比拟的准确分析结果.这一方法的优点已被用于分析香豆素102+DCM和香豆素102+PBBO激光染料乙醇溶液的双指数荧光衰变过程的结果所证实,此外,本文也讨论了仪器时间漂移校正及拉普拉斯变换的数据截取问题.     

一种图像分层表述的快速算法

提出一种新的灰度图像分层表述算法.该算法的核心是基于一系列具有高度规律性的灰度函数gn(x,y)来逼近不规则的原图像灰度函数f(x,y).本算法具有快速收敛性,是一个良好的逼近器.由于gn具有高度规律性,致使用较少的存储空间就可实现对它的存储.这一算法为生物图像的数据处理和重构提供一条新的途径.     

基于ChIP-seq的差异组蛋白修饰区域的筛选

组蛋白修饰是在基因组水平上起到重要调控作用的表观遗传修饰,随着ChIP-Seq的广泛使用,高通量数据的积累,为从全基因组研究组蛋白修饰模式奠定了基础。但目前缺乏在多样本间筛选疾病相关的调控区域的方法,因而本文开发了一种多细胞系的差异筛选算法来识别差异组蛋白修饰区域。本文通过窗口移动法来估计组蛋白修饰水平,并根据信息熵理论定量各个细胞系之间的差异。基于随机背景来确定差异显著性阈值。利用此算法来筛选人类全基因组9个细胞系间H3K4me3差异的区域,结果显示这些区域显著富集在基因启动子上和其他重要的染色质状态上,且与先前人们发现的活性启动子染色质状态显著重叠。通过文献挖掘进一步证实了与白血病相关的基因组标记。这些结果表明基于熵的策略可有效地挖掘多细胞系间以及与疾病相关的差异组蛋白修饰。     

河北省康保县景观变化研究

利用1999年TM5和2003年的SPOT5遥感影像辅助GIS技术对河北省康保县土地利用景观变化进行系统研究,并用Logistic逐步回归对驱动因素进行分析;利用Kappa指数对分类结果进行精度评价-结果表明,1999和2003年分类结果的Kappa指数分别为86.72%和89.76%.康保县的旱地大面积减少,但仍为景观基质.菜地、人工草地、有林地面积和未成林造林地明显增加,主要由旱地、天然草地和改良草地转化而来菜地、人工草地的变化速率增加最快,研究区的景观格局破碎化程度加剧.其景观变化主要是退耕政策实施的结果,坡向因素为主要退耕驱动因素,而直接的驱动因素是由坡向决定的水热条件和肥力因素.     

群体遗传学研究中的数据处理方法I．RAPD数据的AMOVA分析

近年来,RAPD数据和AMOVA分析广泛地应用于群体遗传学和保护遗传学研究。然而,由于RAPD标记具显性特点。加上目前进行AMOVA分析所依赖的RAPDistance软件不完善,使得对RAPD数据进行AMOVA分析时存在许多不足。本文介绍了AMOVA分析的基本过程,同时引入一个新的程序DCFA用以替代RADistance并详述了将DCFA与WINAMOVA联用,对RAPD数据进行AMOVA分析的具体步骤与注意事项,最后,以产自中国和巴西8个普通野生稻（Oryza furipogon)天然群体为例,演示了对RAPD表型数据进行AMOVA分析的过程,讨论了AMOVA分析结果在群体遗传结构上的意义。通过对AMOVA算法的分析,同时比较4种距离系数所得AMOVA结果,我们认为在进行AMOVA分析时选择NEI－LI距离和欧氏距离平方较为合适,而目前国内使用较多的JACCARD系数不适合AMOVA分析。     

植物生理学综合性和设计性实验的考核方法

综合性实验是指实验内容涉及本课程的综合知识或与本课程相关课程知识的实验,其目的是培养学生的综合分析能力、实验动手能力、数据处理能力及查阅中外文资料的能力。而设计性实验是指教师给出实验目的和实验条件,让学生自行设计并以实验加以证明的实验,其目的是培养学生的质疑能力、探索精神和创新能力。     

并基角毛藻若干分类学疑问的初步探讨

并基角毛藻是硅藻门角毛藻属的典型种类, 以“相邻角毛基部并行融合”作为标志性特征, 但该特征是否稳定, 及如何赋予其分类学价值?尚存较多争议。研究以符合现存并基角毛藻分类标准的藻株作为目标藻株, 采用毛细管显微操作技术从我国沿海代表水域分离藻株, 建立了目标藻株的单克隆培养株系, 利用光学显微镜、扫描电镜和透射电镜分别对其形态学特征进行观察, 同时还扩增了核糖体大亚基编码基因的D1-D3区序列, 并构建系统进化树。综合分析形态学特征和分子系统学数据, 初步得到以下结论: (1)具有相同遗传特征的并基角毛藻株系在“相邻角毛基部并行融合”特征上具有不稳定性, 即“相邻角毛基部并行融合”不能作为并基角毛藻种类的标志性特征; (2)并基角毛藻和洛氏角毛藻作为相似种类, 均显示出较高的物种多样性, 高于目前的认知, 预示着或许存在隐形种或拟隐形种; (3)推测并基角毛藻单胞变型只是并基角毛藻原种的一个生活史阶段, 是并基角毛藻的同种异名, 不宜继续保留其独立的分类学地位。     

磷脂脂肪酸分析中内标物的使用及数据处理建模

【目的】评估未知样品内标进样量的参考范围,优化数据处理方法。【方法】采用C19为内标,不同进样量进行分析;编写数据分析程序优化数据处理模型。【结果】随着内标进样量的增加,检测到的PLFA数量和响应值等指标均有增加,但进样量超过16 nmol/g时反而下降;25组数据显示采用响应值计算PLFA含量比百分比值计算所得含量略高;采用Dot Net C#语言编写数据分析模型。【结论】初步确定了未知样品内标进样量的参考范围,得出最优处理方法;采用响应值计算PLFA含量可避免由于百分比值缺失带来的误差;校准系数的引入可减少仪器参数条件改变等因素带来的误差;通过编写谱图数据分析程序获得一定自动化操作,提高了数据分析效率和准确性。