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181.
结合基因功能分类体系Gene Ontology筛选聚类特征基因 总被引:3,自引:0,他引:3
使用两套基因表达谱数据,按各基因的表达值方差,选择表达变异基因对样本聚类,发现一般使用方差较大的前10%的基因作为特征基因,就可以较好地对疾病样本聚类。对不同的疾病,包含聚类信息的特征基因有不同的分布特点。在此基础上,结合基因功能分类体系(Gene Ontology,GO),进一步筛选聚类的特征基因。通过检验在Gene Ontology中的每个功能类中的表达变异基因是否非随机地聚集,寻找疾病相关功能类,再根据相关功能类中的表达变异基因进行聚类分析。实验结果显示:结合基因功能体系进一步筛选表达变异基因作为聚类特征基因,可以保持或提高聚类准确性,并使得聚类结果具有明确的生物学意义。另外,发现了一些可能和淋巴瘤和白血病相关的基因。 相似文献
182.
热激蛋白的分子生物学研究进展 总被引:7,自引:0,他引:7
热激蛋白的分子生物学研究进展费云标,黄涛,舒念红,江勇(中国科学院发育生物研究所,北京100080)ADVANCESOFMOLECULARBIOLOGYONHEATSHOCKPROTEINS¥FeiYun-biao;HuangTao;ShuNian-... 相似文献
183.
大白菜包叶特异基因的克隆及其结构特征和表达方式 总被引:2,自引:0,他引:2
大白菜营养生长经历幼苗期、莲座期、包心期和结球期4个生育时期,每个时期分别以幼叶、莲座叶、包叶和球叶为主要形态标志.构建了大白菜包心早期茎尖组织特异的cDNA文库,分别与莲座叶和包叶cDNA两个探针进行差异杂交,筛选出一个全长的cDNA克隆BcpLH.DNA序列和推导氨基酸序列同源性比较表明,该基因编码的蛋白质含有两个双链RNA结合结构域(dsRNA-binding domains),与人和小鼠dsRNA结合蛋白基因TRBP具有较高的同源区域.PCR表达分析的结果表明,BcpLH基因主要在包心期的包叶组织中表达.在包心期用IAA涂抹植株显著增加了包叶中BcpLH基因的转录产物.据此认为,BcpLH基因与包叶的发生和叶球的形成有关,它的表达受生长素的诱导调节. 相似文献
184.
本文以哺乳动物细胞表达载体pSV2-dhfr为运载体,构建了受控于SV40早期启动子β-hCG基因的表达载体,转染CHO-dhfr-细胞后,挑选CHO(dhfr-)细胞,结果表明β-hCG不仅在细胞中表达,还分泌到培养液中。通过氨甲喋呤(MTX)加压后,表达量逐渐提高,0.1μmol/LMTX条件下培养液中β-hCG最高表达量可达到1.5μg/106细胞·24小时。经亲和层析获得纯的重组β-hCG,其分子量与天然制品一致,放射免疫测定的免疫原性为天然制品的84.9%。 相似文献
185.
生物信息技术在基因组和蛋白质组研究中的应用 总被引:2,自引:0,他引:2
综述了生物信息技术在生物学研究前沿领域,特别是基因组和蛋白质组研究方面的应用,重点展示生物信息技术在基因克隆与定位、核酸和蛋白质序列分析、空间结构预测和蛋白质功能研究方面的运用,丰富了生物技术概念的内涵并拓展了其外延。 相似文献
186.
187.
对拟南芥(Arabidopsis thaliana)IQM3基因的功能进行了分析.结果表明,推定IQM3的启动子中存在多种光、非生物胁迫和植物激素反应的顺式作用元件,可能参与植物对环境变化的反应.RT-PCR分析表明,IQM3在拟南芥莲座叶、花序叶、茎、花和根中的表达较强,但在荚果中的表达很弱;IQM3基因的T-DNA插入突变体iqm3-1和iqm3-2分别是功能缺失和超表达突变体,对这些突变体的表型分析表明,IQM3基因与种子萌发及幼苗子叶膨大有密切关系. 相似文献
188.
载脂蛋白A-I是一种重要的血浆蛋白,其基因表达具有明显的组织特异性、种属特异性和发育阶段桃煨浴ApoA-I基因5’调控区的肝细胞特异性增强子等顺式作用元件同ARP-1、HNF-4、RXRa等反式作用因子相作用,调控该基因的特异性表达。 相似文献
189.
σ^32是由E.coli rpoH基因编码的一为32KD的热应激蛋白转录调控因子。当热应激或其它应激反应发生时,它迅速激活热应激基因的启动子,大量转录其mRNA,合成热应激蛋白。本综述了σ^32在细胞内的表达及其对热应激基因转录的调控。 相似文献
190.
在胚胎发育,特别是早期胚胎发育时期,基因转录活跃、蛋白质大量合成,细胞的增殖和分化非常剧烈,细胞的环境在不断变化,细胞对外界刺激十分敏感。这个时期的HSPs变化和作用表现得非常突出。本文简要总结了近十年有关热休克蛋白在胚胎发育中作用的研究成果。根据胚胎发育地HSPs的依赖性、HSPs基因表达的发育阶段特异性和组织特异性、干扰胚胎发育中HSPs表达程序以后导致胚胎异常发育等现象推测:(1)热休克基因与和/功调控体形形成、肌肉及神经分化,而在胚胎发育中具有看家基因的功能;(2)热休克蛋白作为伴侣分子,通过介导新合成的和/或可逆变性的蛋白质正确折叠、装配、转动及促进不需要的和/或不可逆变性的蛋白质降解,参与胚胎的正常发育和保护胚胎不受不良刺激的影响。这方面的深入研究,必将有助于阐明胚胎发育、细胞增殖、细胞分化和去分化、细胞转化、生物适应性等的分子机理。 相似文献