EST-based analysis of gene expression in the porcine brain

Since pig is an important livestock species worldwide, its gene expression has been investigated intensively, but rarely in brain. In order to study gene expression profiles in the pig central nervous system, we sequenced and analyzed 43,122 highquality 5’ end expressed sequence tags (ESTs) from porcine cerebellum, cortex cerebrum, and brain stem cDNA libraries, involving several different prenatal and postnatal developmental stages. The initial ESTs were assembled into 16,101 clusters and compared to protein and nucleic acid databases in GenBank. Of these sequences, 30.6% clusters matched protein databases and represented function known sequences; 75.1% had significant hits to nucleic acid databases and partial represented known function; 73.3% matched known porcine ESTs; and 21.5% had no matches to any known sequences in GenBank. We used the categories defined by the Gene Ontology to survey gene expression in the porcine brain.     

细胞存活信号和细胞生死的群体控制

程控性细胞死亡（ＰＣＤ）是细胞死亡的一种特殊形式。当细胞完成其功能使命,或遭受严重伤害,或发生异常时,由各种细胞内外信号分子激活细胞所固有的自杀程序而导致细胞死亡。ＰＣＤ的调节控制是由于某种缺失所引起的,即细胞不能接受对细胞内在的自杀程序有抑制作用的...     

鉴定猪,牛及绵羊肥大细胞的组织化学技术

研究证实Ｃａｒｎｏｙ液和中性缓冲福尔马林溶液（ＮＢＦ）是猪、牛及绵羊肥大细胞的优良的固定液,ＮＢＦ虽能很好地保存牛和绵羊的肥大细胞,但却阻断了猪的大多数肥大细胞、特别中肠粘膜肥大细胞（ＭＭＣ）及胸腺髓质肥大细胞（ＴＭＭＣ）对碱性染料的着染力。力苯胺蓝及阿尔辛蓝均为动物肥大细胞的优良染料,但阿尔辛蓝能使更多的肥大细胞着力。甲苯胺蓝及阿尔辛蓝均为动物肥大细胞的优良染料,但阿尔辛蓝能使理多的肥大细胞着染     

计算机模拟在群体遗传教学中的应用

计算机模拟在群体遗传教学中的应用黄远樟（北京师范大学生物学系,北京１００８７５）ＴｈｅＡｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｏｆＣｏｍｐｕｔｅｒＳｉｍｕｌａｔｉｏｎｉｎＴｅａｃｈｉｎｇＰｏｐｕｌａｔｉｏｎＧｅｎｅｔｉｃｓＨＵＡＮＧＹｕａｎｚｈａｎｇ（Ｄｅｐａｒｔｍｅ...     

PCR-RFLP检测LDL受体基因TaqⅠ多态性位点的研究

应用聚合酶链反应(PCR)扩增人类LDL受体基因外显子4-内含子4-外显子5片段,PCR产物为1.55kb,DNA片段经序列鉴定后,进行TaqI酶切位点的RFLP分析。结果显示:中国汉族人群LDL受体基因中存在着TaqⅠ酶切位点多态性; 200个LDL受体等位基因中TaqⅠ酶切位点出现的频率为0.515,该点频率较为适中, 可作为中国汉族人群LDL受体基 因的遗传标志来进行家族性高胆固醇血症(FH)的基因诊断。所建立起的LDL受体基因TaqⅠ位点的PCR -RFLP方法具有快速、简便的特点,在FH的基因诊断上有应用价值。 Abstract:To develop rapid and sensitive technique for detectin the TaqI polymorphism at the human LDL receptor gene in Chinese,the exon4-intron4-exon5 of the human LDL receptor gene was amplified by polymerase chain reaction(PCR).The PCR products were directly analysed by restriction fragment length polymorphisms(RFLP).The results showed that the TaqI polymorphism is associated with the LDL receptor gene in Chinese of Han nationality;The frequency of T= allele (presence of TaqI cutting site)is 0.515 in 200 LDL receptor alleles.This technique may be used for rapid and sensitive screening of the LDL receptor gene for the TaqI polymorphism.     

浙江地方猪种线粒体DNA多态及遗传多样性研究

本实验用ＡｐａＩ、ＡｖａＩ、ＢａｍＨⅠ、ＢｃｌⅠ、ＢｇｌⅠ、ＢｇｌⅡ、ＣｌａⅠ、ＤｒａⅠ、Ｅｃｏ ＲＩ、Ｅｃｏ ＲＶ、Ｈａｅ Ⅱ、Ｈｉｎｃ Ⅱ、ＨｉｎｄⅢ、ＨｐａⅠ、ＫｐｎⅠ、ＰｖｕⅠ、ＰｖｕⅡ、Ｓａｃ Ⅰ、ＳａｌⅠ、ＳｃａⅠ、ＳｍａⅠ、ＳｔｕⅠ、ＸｂａⅠ和ＸｈｏⅠ等２５种识别６个碱基对的限制性内切酶分析了浙江地方品种猪、浙江野猪等３０个个体的线粒体ＤＮＡ,共检出３０种限制性态型,可归结成３种单倍     

AHL类似物作为细菌群体感应系统促进剂的研究进展

应用N-酰基高丝氨酸内酯（N-acyl-L-homoserine lactones，AHL）介导的群体感应（quorum sensing，QS）系统调控生物膜形成和次级代谢物合成具有巨大的商业价值，但自然界中许多微生物能够产生群体淬灭（Quorum Quenching，QQ）酶，QQ酶能够降解天然AHL信号分子，使外源天然 AHL 信号分子的半衰期缩短，限制了天然AHL 信号分子的应用范围。化学合成的AHL类似物作为QS促进剂，通过与天然信号分子类似的结合方式形成转录二聚体，激活下游基因表达，但与天然AHL信号分子相比，化学合成的QS促进剂具有活性高、半衰期长等优点。本文综述了化学合成AHL类似物的设计思路、种类、作用机制及其在提高次级代谢物产量和生物浸矿方面的应用，并讨论了QS促进剂今后主要的研究方向，以期为QS促进剂的合成设计和实际应用提供参考。     

基于DUS测试的上海粳稻地方品种遗传多样性分析

利用水稻DUS测试指南(2012版)中的38个水稻标准品种和52个基本测试性状对上海地区的172个粳稻地方品种进行遗传多样性分析,并与14个上海地区选育的申请品种保护的粳稻品种作比较。结果表明:地方品种表型性状共检测到176个等位变异,平均每个测试性状检测到3.6667个,变幅介于1~8个。Shannon's多样性指数(H')平均值为0.6834,变幅介于0~1.9327,77.08%的性状存在3个及以上的等位变异;地方品种的等位变异数、每个性状的等位变异数及其变异幅度、多样性指数平均值等均大于现代育成品种,在外观形态上,地方品种的遗传多样性比现代育成品种更丰富。利用UPGMA法进行聚类分析发现在相似系数为0.53时,可将186个粳稻品种分为3个类(亚)群,现代育成品种单独组成一个亚群;而主坐标分析将186个粳稻品种明显的分为地方品种和现代育成品种两大区。地方品种具有丰富的多样性,与现代育成品种具有明显的形态差异,可为今后粳稻育成品种的改良提供更多的形态基础。     

江口萝卜猪FABPs主要家族基因SNPs筛选及生物信息学分析

以江口萝卜猪为试验材料构建DNA池,采用直接测序技术对猪L-FABP、I-FABP、H-FABP、A-FABP基因进行SNPs快速筛查,共检测出7个SNPs,分别为intron1-T1745C、exon2-T125C、exon2-A131C、exon2-C153A、exon2-A65T、exon2-G40A、intron3-C65T。其中intron1-T1745C、intron3-C65T位于内含子上;exon2-T125C、exon2-C153A为同义突变;exon2-A131C、exon2-A65T、exon2-G40A为错义突变,分别使编码氨基酸发生Glu→Ala、Lys→Met、Glu→Lys的改变,对其进行生物信息学分析表明,突变前后的等位基因频率估算,mR NA二级结构预测,蛋白质二级、三级结构预测分析均有差异。