ATOM 1.0:基于GPU的电子断层重构软件

电子断层成像技术能够在纳米尺度下重构出不具有全同性的细胞或大分子的三维结构,正受到越来越广泛的重视。针对现有电子断层成像技术中重构软件的不足,特别是迭代重构算法速度慢的缺点,我们开发了一款基于Graphic Processor Unit(GPU)平台的电子断层重构软件——ATOM,实现了图像对位、重构参数计算、三维重构及数据可视化等电子断层重构的基本功能。其中,在二维对位方面,ATOM实现了迭代的无标记平移和旋转对位;在三维重构方面,实现了背投影和多种迭代重构算法,并实现了迭代重构在GPU平台上的并行加速,获得了良好的加速比,如SIRT算法得到了47倍加速比。ATOM是绿色开源软件,可以运行在支持Qt和CUDA的所有操作系统上。ATOM为图形界面软件,结合详尽的安装及使用文档,便于用户使用。     

图像引导放射治疗老年非小细胞肺癌30例

目的:分析图像引导放射治疗(IGRT)对老年非小细胞肺癌患者的临床疗效.方法:30例老年非小细胞肺癌患者,全部采用医科达图像引导放射治疗系统,GTV:60Gy,参考剂量线为95%～98%,分割方式3～4Gy/次.结果:肿瘤完全缓解率为33%(10/30),部分缓解率为50%(15/30),总有效率为83%(25/30).1、2、3年生存率为85%、70%、67%.结论:图像引导放射治疗(IGRT)对老年非小细胞肺癌有较好的局部控制率,是治疗老年非小细胞肺癌患者的有效方法之一.     

图像分析系统在小儿白血病细胞DNA定量分析中的研究

白血病细胞 DNA图像分析可为白血病的诊断、了解白血病细胞的分化程度、判断疗效 ,提供一个新的生物学定量参考指标。本文采用真彩色图像分析系统对 33例小儿白血病和 1 0例非血液病的骨髓涂片进行了 DNA定量分析研究 ,现将结果报告如下。1 .对象和方法1 .1　受检对象　 90～ 96年本院住院患儿首次骨髓涂片　 ( 1 )急性淋巴细胞白血病 ( ALL组 ) 1 8例 ,男性 1 0例、女性 8例、年龄 1～ 1 2岁 ,平均 5 .5岁。其中 L - 1型 1例、 L- 2型 1 5例、 L- 3型 2例。 L-2型病人 3例各有 4次骨髓涂片 ,可供动态分析。( 2 )急性非淋巴细胞白血病…     

一种新的基于蒙特卡罗模拟和光子传输模型的图像分割算法

本文以蒙特卡罗模拟方法为基础,结合组织光学的光子传输模型,提出了一种新的图像分割算法,该算法将复杂的图像分割问题简化为大量简单的光子传输随机实验,通过分析传输规律来获取目标区域.在随后的实验中,结合细胞核提取这一问题建立了一个简单的光学传输模型,并依据此模型分别对人造图和实际图进行了分割.人造图的分割结果表明了该算法的可行性,说明了该算法的一些优点;而实际图的分割结果则反映了该算法的不足之处,文章针对其中存在的问题和算法待改进之处进行了分析.     

菌丝形态分化与头孢菌素C合成的关系

利用显微图像分析法对顶头孢霉菌的菌丝形态进行了定量研究,并统计分析了头孢菌素C发酵过程中的菌丝形态的变化规律,具体对菌丝长度、菌丝宽度和菌丝生长单位进行了定量分析,分析了菌丝形态分化与头孢菌素C合成的关系。研究表明头孢菌素C的合成是在细长菌丝分化成膨大菌丝片段后才启动的,头孢菌素C可能主要是在膨大菌丝分化成节孢子的过程中被合成。     

iNOS和eNOS在严重急性呼吸综合症肺标本中的表达和意义

将确诊的SARS病人肺标本用甲醛固定,常规石蜡切片,厚度6μm,其他非SARS肺标本为对照标本。采用免疫组织化学技术LSAB法,第一抗体为iNOS和eNOS,所有实验结果进行使用Motic-CMIAS多功能病理彩色图像分析系统图像分析,测定指标为平均光密度（AOD）,每个病例测试25个视野。结果显示,iNOS阳性反应部位表现为肺巨噬细胞、肺泡上皮细胞、中性粒细胞和血管内皮细胞等;eNOS阳性反应部位表现为血管内皮细胞和部分间质细胞。iNOS部分,2个SARS标本与正常和其它病理标本比较有较明显差异;eNOS部分,各个标本之间没有明显差异。     

基于区域相似性测量的CT／PET图像配准

图像配准在临床诊断中有重要意义,针对这一问题已经提出了许多方法。本文以区域相似性匹配测度,运用改进的分割方法,结合Powell寻优算法实现了CT／PET多模医学图像配准。实验结果表明,该算法易于实现,配准速度快、精度高,鲁棒性较好。     

基于多小波的胃癌病理细胞图像边缘检测与分析

对胃癌细胞图像的多尺度小波变换边缘检测进行了研究,为医生运用现代信息理论的方法进行相关疾病诊断提供了一种新的思路和途径。提出了多尺度小波边缘检测的新方法,归纳了改善小波边缘检测效果的一些策略。实验结果表明,对于具有复杂纹理的医学病理细胞图像,采用传统的边缘检测方法会产生伪边缘和方向性误差,它影响了图像边缘检测的可信度;而运用小波变换的时频尺度特性和对奇异变化的优良检测性能,可得到无噪声污染的图像实际边缘。     

利用Excel的VBA语言自动分析大量共聚焦线扫描图像数据的方法

目的：Microsoft Excel的内置控制语言是VBA(visual basic for application)。它可以极大地增强Excel的数据处理能力。本文通过一个简单的例子说明如何利用VBA自动分析大量共聚焦线扫描图像数据并图示分析结果。方法与结果：文中首先描述了取自共聚焦线扫描图像的实验数据的结构及处理要求。然后具体说明宏程序(用VBA编写)的录制、修改和使用的详细方法。宏程序代码很接近自然语言,较好理解,而且在大多数情况下可通过“录制宏”功能自动生成,把编程的工作减至最少。结论：与手工使用Excel一步步进行数据处理相比,使用Excel中的VBA处理数据可少花时间、少犯错误、减少大量单调重复的劳动．．这些可极大地提高数据处理效率,使研究者可把更多的时间用于数据处理方案的设计和完善上。特别在处理量大而复杂的实验数据时更需要如此。这样,数据中蕴含的有用信息才能更好地被有效而准确地提取出来并加以显示。     

医学图像中的边缘分析

根据医学图像处理的要求,需要将图像划分若干区域,其划分过程要求迅速、精确。本文结合实际经验,介绍了图像分割的重要方法——边缘提取,并着重分析了其中边缘检测和边缘跟踪的过程和方法,同时还给出了用计算机模拟得到的边缘提取的结果。