肿瘤亚型识别研究中智能算法的应用

目的:为解决肿瘤亚型识别过程中易出现的维数灾难和过拟合问题,提出了一种改进的粒子群BP神经网络集成算法。方法:算法采用欧式距离和互信息来初步过滤冗余基因,之后用Relief算法进一步处理,得到候选特征基因集合。采用BP神经网络作为基分类器,将特征基因提取与分类器训练相结合,改进的粒子群对其权值和阈值进行全局搜索优化。结果:当隐含层神经元个数为5时,候选特征基因个数为110时,QPSO/BP算法全局优化和搜索,此时的分类准确率最高。结论:该算法不但提高了肿瘤分型识别的准确率,而且降低了学习的复杂度。     

Yangtzedonta是双壳类吗?

对Yangtzedonta pri mitivaYu模式标本(标本登记号:84430)的化石保存类型进行讨论,确认这应当是一枚单壳瓣实体标本,而非内模标本,由此判断,余汶(1985;Yu,2005)所描述的肌痕实际上是不存在的。所谓的"片状齿突"(余汶,1985)或"片状脊"(Yu,2005)很可能是外来的附加物,并非壳体的组成部分。无论如何,84430标本现有的形态证据尚不足于将它与双壳类联系在一起。     

昆明小鼠物体识别模型的建立及其在检测化学药物对记忆损伤中的应用

本研究的主要目的是建立昆明小鼠物体识别模型并评价该模型在安全药理学研究中的潜在应用价值。研究了昆明小鼠物体识别记忆随时间而减弱的特性,在训练结束后4h或1h,检测昆明小鼠的物体识别记忆,并评价了东莨胆碱对昆明小鼠物体识别记忆的影响。结果表明:1h间隔组昆明小鼠熟悉期探究物体的时间差和测试期探究物体的时间差存在显著差异(P<0.05),昆明小鼠在训练结束后1h记忆保持良好,可以进行物体识别;东莨胆碱组昆明小鼠熟悉期探究物体的时间差和测试期探究物体的时间差比较(P>0.05),没有显著性差异。因此,东莨胆碱损伤了昆明小鼠的物体识别记忆。用昆明小鼠建立的物体识别模型具有简单、快速、可靠等特点,在安全药理学研究中可用于检测化学药物对记忆的损伤。     

mtDNA条形码在鹦形目物种鉴定中的应用及评估

鹦鹉是具有超凡魅力的鸟类,其羽毛和学习能力使它们成为备受追捧的宠物.近年来,大量的非法贸易对鹦鹉原生种群的生存造成了严重威胁.为了减少贩运活禽的运输困难,走私者经常选择鸟蛋来运输,这也给物种的形态学鉴定带来了困难.本研究以北京海关缉私局查获的97枚鹦鹉蛋为材料,探讨了基于线粒体基因Cyt b,CO Ⅰ,12S rRNA和16S rRNA四种条形码的鹦鹉物种识别率,根据现有的参考数据库,81％的鹦鹉蛋能鉴定到物种水平,19％的蛋只能鉴定到科或属的水平.本研究同时对GenBank中鹦形目现有的线粒体基因条形码序列及其全基因组数据进行了全面统计与分析,发现目前GenBank中只有77.33％的物种具有线粒体基因Cyt b,CO Ⅰ,12S rRNA和16S rRNA的相关序列信息,参考数据库中mtDNA序列的缺失,为其物种的准确识别造成了很大阻碍.本研究以期通过对参考数据库中鹦形目鸟类mtDNA条形码的统计与评估,为相关执法部门以及检验鉴定机构提供一定参考.     

基于RFID技术的西方蜜蜂采集行为研究

蜜蜂能够灵活调整出巢觅食行为,从而有效保证蜂群的正常发育与繁衍.为了探索采集蜂的行为特性,本文利用由江西农业大学蜜蜂研究所与广州市远望谷信息技术股份有限公司合作研发的蜜蜂无线射频识别(RFID)系统,对西方蜜蜂进行为期38 d的全天候监控记录.结果表明: 两蜂群中分别有63.4%和64.5%的采集蜂存在轮休现象,轮休时间比例为22.5%~26.4%;轮休与非轮休蜜蜂的采集工作总量差异不显著,但轮休蜜蜂寿命显著高于非轮休蜜蜂;提前发育的采集蜂的寿命显著低于正常采集蜂.本研究丰富了蜜蜂社会行为学内容,为进一步探索蜜蜂采集行为的形成机制奠定了基础.     

桃儿七属的命名学考订

桃儿七属（SinopodophyUum）是中国一喜马拉雅地区特有的单型属,仅桃儿七（S．hexandrum）一种。桃儿七的根茎和果实均具有较高的药用价值,人类的过度采挖和种群恢复较慢使其种群数量急剧下降,现已被列入《中国物种红色名录》。在近年来的一些研究论文中,学名S．hexandrum和S．emodi常被}昆用,这使得有必要考证桃儿七学名的命名学历史,确认正确的学名使用。查阅原始文献发现．S．hexandrum的基名Podophyllum hexandrum Royle发表于1834年．而S．emodi的基名PodophyUum emodiWall．ex Honigberger到1852年才合格发表（大多数学者认为是Hooker和Thomson在1855年合格发表）．因此,名称S．hexandrum比名称S．emodi具有优先权。名称的混乱起于1979年应俊生建立桃儿七属时,他提出组合“S．emodi（Wall．）Ying”作为桃儿七的学名。另外,由于他未引证Honigberger或Hooker和Thomson的文献信息,所以组合“S．emodi”没有被合格发表（规则41．5）。随后,1985年出版的《西藏植物志》桃儿七属中,应俊生发现之前的错误并采用名称“S．hexandrum”取代了“S．emodi”。遗憾的是他虽然意识到该名称是新组合,但未引证基名P．hexandrum合格发表的文献信息,使得组合“S．hexandrum（Rolye）Ying”没有被合格发表。近年来出版的《云南植物志》、《青海植物志》、《中国植物》和《Flora of China〉〉均未发现该错误,一直认为“S．hexandrum（Rolye）Ying”合格发表时间是1985。实际上．在1993年由于编写格式要求,应俊生在王文采和武素功主编的《横断山区维管束植物》中引证了基名合格发表的文献信息。因此,该名称的合格发表时间是1993年,而不是常认为的1985年。     

灰花纹鹅膏菌(Amanita fuliginea)子实体发育及核相观察

采用石蜡切片、压片等方法对灰花纹鹅膏菌(Amanita fuliginea)子实体发育过程进行了观察,并用核荧光染料Hoechst 33258对灰花纹鹅膏菌子实体发育过程中的核相变化进行了观察。结果表明,灰花纹鹅膏菌子实体发育是典型的半被果型发育,菌褶是子实层同时发育类型,属于同型菌髓。在子实体发育过程中,单倍的二核担子核配后形成短暂的二倍体单核担子,经过减数分裂形成四核担子,有近40%的担子中核再进行一次有丝分裂形成8核担子,担子进一步发育产生担孢子,其中,二核担孢子约占95%,单核担孢子约2.4%,三核孢子2%左右,4核担孢子约0.4%。灰花纹鹅膏菌基因组中染色体数目2n=10条。     

以庐山或牯岭命名的植物资源调查

通过初步调查及查阅文献统计分析,以庐山或牯岭命名的庐山植物资源有33科41属41种,其中蕨类植物5科,6属,6种,分别占总科、属、种数的15.15%、14.63%、14.63%;被子植物28科,35属,35种,分别占总科、属、种数的84.85%、85.37%、85.37%。进一步分析了该类植物种类组成丰富多样及习性多样性,蕨类植物6种,占总种的14.63%,双子叶植物有31种,占总种的75.61%,单子叶植物有4种,占总种的9.76%。探讨了其在庐山的生境、用途及存在的问题。     

The structure of Rap1 in complex with RIAM reveals specificity determinants and recruitment mechanism

The small GTPase Rap1 induces integrin activation via an inside-out signaling pathway mediated by the Rapl-interacting adaptor mol- ecule （RIAM）. Blocking this pathway may suppress tumor metastasis and other diseases that are related to hyperactive integrins. However, the molecular basis for the specific recognition of RIAM by Rap1 remains largely unknown. Herein we present the crystal structure of an active, GTP-bound GTPase domain of Rap1 in complex with the Ras association （RA）-pleckstrin homology （PH） structural module of RIAM at 1.65 A. The structure reveals that the recognition of RIAM by Rap1 is governed by side-chain interactions. Several side chains are critical in determining specificity of this recognition, particularly the Lys31 residue in Rap1 that is oppositely charged compared with the Glu31/Asp31 residue in other Ras GTPases. Lys31 forms a salt bridge with RIAM residue Glu212, making it the key specificity determinant of the interaction. We also show that disruption of these interactions results in reduction of Rapl：RIAM association, leadingto a loss of co-clustering and cell adhesion. Our findings elucidate the molecular mechanism by which RIAM med- iates Rapl-induced integrin activation. The crystal structure also offers new insight into the structural basis for the specific recruitment of RA-PH module-containing effector proteins by their smaU GTPase partners.