中国耳蕨属后生耳蕨组的分类研究(I)(待续)

本文首次对国产耳蕨属后生耳蕨组进行了较系统的分类研究,对组的概念进行子修订,首次将耳蕨属小鳞片根据长度分为长型和短型两类。本文共记载后生耳蕨组植物22种,包括中国新分布1种: P.longipinnulum Nair, 新异名2种：P. glingense Ching et Y. X. Ling, P. shennongense Ching, Boufford et Shing．本组共分五系,即线鳞系、水囊系、缺耳系、长小鳞系和黑鳞系。本文编制了后生耳蕨组的分种检索表,对一些种的分类问题进行了讨论,认为中国甚至喜马拉雅地区并无P. mucronifolium (BI.) Presl 和P. setiferum (Forsk.) Moore ex Woynar的分布。     

广西杜鹃花研究(一)

<正> 1.岩谷杜鹃 新种 图1 (杜鹃亚属,长尾种子组) 附生小灌木,高20—6O厘米;枝圆柱状,密布小疣瘤,近似越橘杜鹃Rh.vaccinioides Hook.f.和匍枝杜鹃Rh.euonymifolium Lévl.;不同于前者为:叶密集,非散生,边缘外折,花黄色;不同于后者为叶向枝端聚生,较小,花萼裂片长圆形,被缘毛,花较小;不同于二者为子房和蒴果有鳞点而且被毛,可资区别。     

耳时蝉属四新种（同翅目：耳叶蝉科）

本文记述耳叶蝉科耳叶蝉属四新种：１．浅斑耳叶蝉Ｌｅｄｒａｐａｌｌｉｄｅｓｐ．ｎｏｖ,２．片脊耳叶蝉Ｌｅｄｒａｌａｍｅｌｌａｓｐ．ｎｏｖ,３．黑纹耳叶蝉Ｌｅｄｒａｎｉｇｒｏｌｉｎｅａｔａｓｐ．ｎｏｖ,４．明冠耳叶蝉Ｌｅｄｒａｈｙａｌｉｎａｓｐ．ｎｏｖ．．标本分别采自我国西藏、云南及安徽省．模式标本保存于安徽农学院．     

中国铁角蕨属(铁角蕨科)一新名称

提出新名称 Asplenium dulongjiangense Y.F.Deng以代替晚出同名 Asplenium qiujiangense Chingex S.H.Wu non Nakaike,1 986。     

基因转录表达数据的生物信息挖掘研究

基因表达是生物体中最重要和最基础的生物学过程和分子活动,生物体正是通过调控不同基因表达而实现生长发育和抵御刺激等生命活动.转录组测序是目前在生物医学研究中应用最为广泛的高通量检测基因表达的技术,也促进了大量针对转录组数据的生物信息挖掘方法和工具的发展.本文就基因表达中的转录组数据分析和挖掘方法进行了综述,从已有大规模转...     

糖生物学和糖组学

糖生物学和糖组学,虽然都是研究糖类在机体中的作用,但是,它们分别有不同的视角。糖生物学是沿袭了糖化学、糖生物化学发展而来,着重研究糖类和蛋白质的相互作用;而糖组学则源于基因组学,以基因编码糖基转移酶为起始,由这些酶得到糖组,进而开展糖组的研究。     

广西鹅耳枥属一新种

<正> 灌木,高2—3米;树皮灰褐色;小枝紫褐色,无毛,疏生小皮孔;托叶条形,纸质,长5—7毫米。叶卵状披针形,长2.5—4.2厘米,宽1—1.5厘米,先端渐尖或尾状渐尖,基部圆楔形,有时稍不对称,边缘有锯齿,有时为重锯齿,齿端有腺体,上面无毛,下面沿中、侧脉略被毛,中脉和侧脉在上面凹陷,在下面突起,侧脉每边13—18条,网脉细密,在上面明显突起,下面不明显,叶柄长3—5毫米,无毛或被微小柔毛。果序长2—4厘米,果序轴纤细,无毛;果稀少;果苞长1—1.3厘米,半卵形或半宽卵形或长圆形,先端钝尖,外侧边缘具不规则的锯齿,内侧边缘全缘,直或微弯;小坚果宽卵形,长2.5—3毫米,宽3.5毫米,先端被柔毛,其余无毛,有明显的肋7—9条。     

秦艽及其近缘种植物资源在我国的分布

秦艽是我国大宗中药材之一,在传统中医药理论中有重要的应用价值。近年来伴随秦艽药用价值研究的不断深入,其需求量不断增加,致使秦艽野生资源日趋减少。通过野外考察和资料查阅,系统阐述了秦艽组植物资源在我国的分布概况,并详细介绍了药典规定品种的具体分布,从而为合理利用和保护秦艽资源,开发新资源提供参考。     

利用分析Unigene在转录组中表达模式的方法拼接盐角草铵转运基因

RNA-seq技术能够全面快速地获得物种在某一状态下的转录本序列信息,但测序并组装后的大量Unigene往往不包含完整ORF(Open reading frame)。转录组库具有一定的冗余性,存在着属于同一个转录本的Unigene,这些Unigene因为无重叠区不能拼接而存在转录组库中。基于这种情况,为了拼接铵转运蛋白家族Unigene,首先挑选注释为AMT(Ammonium transporter)且ORF不完整的所有Unigene(5条),通过分析Unigene在4个转录组的表达模式,其中2条Unigene(Uni4和Uni5)具有相同的表达模式,推测可能来自同一转录本。然后通过NCBI blastx将这2条Unigene与参考物种的AMT蛋白质比对,确定其在转录本的位置及序列相互间没有交叠(如果两条编码序列相互交叠则不能组成同一个转录本)。结果发现Uni4和Uni5分别位于参考转录本5′端和3′端位置,因此假定它们属于同一个转录本,中间空缺约120 bp未知序列。通过试验验证,分别在Uni4和Uni5上设计单正向引物和单反向引物,PCR扩增得到约800 bp片段,将其测序并与两条Unigene比对,证实Uni4和Uni5属于同一转录本且获得了缺失的未知序列。最终拼接得到1 667 bp序列,包含1 482 bp完整ORF,编码494个氨基酸,通过系统进化分析将其归类为amt1亚家族,命名为Seamt1。生物信息学手段预测Se AMT1蛋白与已知的其他物种AMT性质相似。本研究采用转录组Unigene表达模式聚类的方法挖掘潜在的同一转录本Unigene,并且通过另外两组Unigene检验了该方法的可行性。这一便捷方法有助于转录组中Unigene的延伸和拼接,有助于完整ORF的获得及后期基因功能研究。     

塔里木北缘早侏罗世塔里奇克组植物化石

描述了新疆库车塔里奇克组的植物化石７属９种，根据植物化石及有关的动物化石，结合地层层序，指出塔里奇克组属早侏罗世早期。进一步阐明我国晚三叠世植物分区西端的界线不在天山而在昆仑山。