染色质结构蛋白变异与人类疾病

层级复杂的三维染色质结构对于细胞命运决定和功能维持所需的多种DNA相关生物学过程的时空调控至关重要,如DNA复制、转录、重组和损伤修复等.三维染色质结构失调导致基因表达异常,被认为是肿瘤或神经发育障碍等多种疾病的主要诱因.本文重点阐述组蛋白及其变体、甲基CpG结合蛋白2在三维染色质高级结构及动态性调节中的作用,总结疾病相关突变对基因功能的影响,探讨肿瘤或神经发育障碍发生发展过程中染色质层面的病理学机制.     

人类活动和气候因子对中国外来入侵物种分布的影响

全球变化引起的生物入侵已经严重地威胁了生物多样性分布和生态系统功能与服务.生物入侵分布格局及其影响因素的深入研究有助于更好地预测和管理外来入侵物种,从而有效地保护生物多样性和生态系统功能与服务.然而,目前尚未有研究系统地讨论不同时期人类活动与自然因子对中国外来入侵植物、外来入侵昆虫和外来入侵微生物分布格局的影响.本研究基于最近出版的外来入侵生物相关资料,首先描述了3个外来入侵类群在我国的省级分布格局.然后利用单因素普通最小二乘法模型和空间自回归模型探讨了不同时期人类活动和自然因素对这些分布格局的影响.结果表明, 3个外来入侵类群丰富度在我国各省份的分布呈现相似的格局,即东南偏多,西北偏少;相较于入侵植物和入侵昆虫,入侵微生物在东北和华北的丰富度也较高. 2000年的国内生产总值是影响3个分类群丰富度最大的人类活动指标,且均呈显著正相关关系.在自然因子中,年均温和年降水对入侵植物丰富度和入侵昆虫丰富度解释率也较高,且呈显著正相关关系,但对入侵微生物丰富度影响不显著.值得一提的是,即使在控制自然因子的影响后, 2000年的国内生产总值依然是对3个分类群丰富度影响最大的因子.研究结果表明,尽...     

人类致病真菌的光谱学检测及鉴定

<正>目前人类致病真菌常规的临床检验方法是直接镜检和真菌分离培养鉴定。直接镜检一般不能确定菌种,培养鉴定费时、费力、阳性率低是其弊端。分子生物学技术受碍于过程繁复、缺乏统一的操作规范和判别标准等,尚未用于临床检验。免疫学的检验方法仅限用于少数致病真菌,且特异性抗体制备不易、昂贵。飞行时间质谱（MALDI-TOF）分析所需设备昂贵,还需分离获得菌株。故人们在不断寻求准确、快速、廉价、高通量、易于标准化的新技术和新方法。     

皖南休宁新元古界-下寒武统沉积岩的有机碳同位素记录

皖南休宁县蓝田地区震旦系皮园村组和下寒武统荷塘组主要由硅质岩和黑色页岩组成。皮园村组硅质岩的分析结果表明:δ13Corg分析值落在-36.39‰—-31.45‰范围之内,而且从该剖面的底部到顶部呈现出逐步下降的趋势,可能归之于大气和海洋中O2/CO2比值上升,生物氧化作用增强所致;有机碳(TOC)含量<1%,有机氮(TON)含量<1‰,两者均处于蓝田地区埃迪卡拉系—下寒武统地层的最低值,证明晚震旦世时期该地区海洋生物产量比前期(蓝田期)海洋产量显著下降,可能归之于海水加深,不利于海洋生物的繁殖。荷塘组黑色页岩的δ13Corg分析值落在-33‰—-31‰范围之内,TOC和TON含量与皮园村组比较有大幅度提高,尤其黑色页岩下段TOC含量达到13.85%,证明早寒武世海洋生物得到了大发展。由于新元古代冰期后海洋藻类的大量涌现和早寒武世海洋生物得到大发展,生物光合作用产生大量的O2,导致大气和海水中O2/CO2比值进一步升高,可能是引发“寒武纪生物大爆发”的重要因素。     

一类新型的抗病毒药物:病毒进入抑制剂

艾滋病是严重威胁人类健康的病毒性传染病.目前临床上抗人类免疫缺陷病毒(HIV)感染的药物主要是针对反转录酶和蛋白酶.反转录酶抑制剂和蛋白酶抑制剂的联合使用能显著降低HIV感染者的发病率和病死率,然而不良反应较大,价格昂贵,而且耐药的问题日益突出.近来一类新型抗HIV药物相继问世,其中T-20已经被美国食品药品管理局(FDA)批准正式在临床使用,此外几十种同类药物已经进入临床试验.     

HIV感染者接种新型冠状病毒疫苗的必要性及免疫效果研究进展

目前,接种新型冠状病毒疫苗(简称新冠疫苗)是预防严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)感染及降低新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019, COVID-19)重症率、死亡率的重要措施之一。人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染者(HIV infector)是COVID-19的高风险人群,多国疾病预防控制机构和相关学术团体均建议优先为HIV感染者接种新冠疫苗,且已有研究显示HIV感染者接种新冠疫苗后的益处远大于风险。现通过梳理和总结近两年的相关研究,就HIV感染者接种新冠疫苗的必要性、接种效果、影响HIV感染者接种新冠疫苗效果的因素及接种新冠疫苗对HIV感染者的影响等作一概述,以期为HIV感染者新冠疫苗预防接种提供参考。     

胭脂鱼——5000万年前游来的美丽"姑娘"

胭脂鱼有一个美丽的名字,如诗如画中引人浮想联翩,让人不禁想到莲步轻移的古代女子,想到童话故事中的人鱼姑娘,正如旧时女子腮间唇畔的一抹余香,娇羞中自有一番魅惑.这是它名字的魅力,也是胭脂鱼本身的魅力所在.这个千万年前游来的鱼儿有着怎样的故事怎样的神秘,我们还是一起探询一二吧.     

HIV阳性患者肠道菌群特征对联合抗反转录病毒治疗效果的预测

目的 观察人类免疫缺陷病毒(HIV)阳性患者肠道菌群特征对联合抗反转录病毒治疗(cART)效果的预测作用,以期为HIV阳性患者的抗病毒治疗获益评估提供辅助手段。方法 前瞻性选取我院2017年1月至2020年1月收治95例HIV阳性患者为研究对象,均于治疗前收集患者资料,分析患者肠道菌群特征,实施cART治疗,治疗6个月后评估疗效,将患者划分为有效组和无效组,采用回归分析检验HIV阳性患者肠道菌群特征与cART疗效的关系,并分析肠道菌群特征对cART疗效的预测效能。结果 95例HIV阳性患者中共有69例cART治疗有效,26例治疗无效。回归分析结果显示,HIV RNA载量、免疫球蛋白(Ig)A、IgG水平及肠道屎肠球菌、粪肠球菌、大肠埃希菌、乳杆菌、双歧杆菌数量均与HIV阳性患者治疗效果有关(OR=18.964、42 376.484、4.183、8.585、14.358、15.134、9.297、10.223,均P<0.001)。受试者工作曲线(ROC)显示,HIV阳性患者肠道屎肠球菌、粪肠球菌、大肠埃希菌、乳杆菌、双歧杆菌数量用于预测cART治疗无效风险的曲线下面积(AUC)均&...     

Predicting the subcellular localization of human proteins using machine learning and exploratory data analysis

Identifying the subcellular localization of proteins is particularly helpful in the functional annotation of gene products. In this study, we use Machine Learning and Exploratory Data Analysis （EDA） techniques to examine and characterize amino acid sequences of human proteins localized in nine cellular compartments. A dataset of 3,749 protein sequences representing human proteins was extracted from the SWISS-PROT database. Feature vectors were created to capture specific amino acid sequence characteristics. Relative to a Support Vector Machine, a Multi-layer Perceptron, and a Naive Bayes classifier, the C4.5 Decision Tree algorithm was the most consistent performer across all nine compartments in reliably predicting the subcellular localization of proteins based on their amino acid sequences （average Precision=0.88; average Sensitivity=0.86）. Furthermore, EDA graphics characterized essential features of proteins in each compartment. As examples, proteins localized to the plasma membrane had higher proportions of hydrophobic amino acids; cytoplasmic proteins had higher proportions of neutral amino acids; and mitochondrial proteins had higher proportions of neutral amino acids and lower proportions of polar amino acids. These data showed that the C4.5 classifier and EDA tools can be effective for characterizing and predicting the subcellular localization of human proteins based on their amino acid sequences.     

邓州八里岗仰韶时期居民的体质变迁

河南邓州八里岗遗址出土的仰韶早期与中晚期人骨体质状况的对比分析表明,八里岗仰韶文化在其延续千年的时间内,居民体质状况从早期到中晚期出现一系列变化。具体表现为女性身高的减少、男女性下肢功能活跃度的降低以及四肢长骨纤细化的倾向。古病理指征则展现出龋病发生的显著增加、头骨钝伤的减少以及女性胫骨骨膜反应增多等表现。这些体质状况的变迁,与八里岗仰韶文化发展过程中日趋定居的生活方式、农业经济渐趋成熟以及食物加工技术的进步有关。与此同时,女性的社会地位开始呈现下降的趋势。八里岗仰韶居民的体质特征改变与这一阶段仰韶社会的发展状况及古代人类的行为模式存在密切联系。