不同压力条件下油藏内源细菌群落激活过程中变性梯度凝胶电泳分析?

摘要：【目的】了解常压（1 MPa）和高压（10 MPa）条件下内源细菌激活中的细菌群落和结构的变化。【方法】利用胜利油田沾3×24井产出液水样,在常压和高压下进行富集培养后,定时取样,样品用变性梯度凝胶电泳（denature gradient gel electrophoresis,DGGE）技术分析。【结果】通过对内源微生物激活前后DGGE条带的数量和亮度变化分析表明,油藏环境中的细菌在种类和数量上并不丰富,激活剂的加入改变了菌群原有的贫营养环境,从而使一些因营养缺乏生长受抑制细菌得以大量繁殖,菌群结     

DGGE技术在动物胃肠道微生物研究中的应用

变性梯度凝胶电泳(DGGE)是通过聚丙烯酰胺凝胶中变性剂浓度梯度的不同,将序列不同的DNA分开。目前,该技术已广泛应用于瘤胃微生物、肠道微生物等多样性研究。综述了变性梯度凝胶电泳技术的基本原理、优缺点及其在动物营养中的应用。     

缺血后处理兔心肌蛋白质组学双向凝胶电泳分析的初步研究

目的:研究缺血后处理对缺血再灌注心肌保护的相关蛋白的变化。方法:将6只新西兰大白兔随机分为两组(每组3只):心肌缺血再灌注对照组(I/R组)和缺血后处理组(P组)。两组均接受左冠状动脉前降支阻断30min,开放再灌注180min。缺血后处理组,结扎LAD30min,然后灌注30s,阻断30s,重复4次,继而再灌注直至180min,分别取各组缺血区心肌进行二维凝胶电泳,利用ImageMaster2D软件分析实验结果。结果:P组和I/R组对比,有11个蛋白表达发生了显著变化,其中表达增强的有7个蛋白,表达降低的有4个蛋白。结论:这些差异表达的蛋白可能在缺血后处理对心肌缺血再灌注损伤的保护中发挥了作用。     

Hela细胞导入TRIM45基因后的比较蛋白质组学研究

为了确定TRIM45基因的功能和作用机理,将其转入Hela细胞,分析细胞内蛋白质表达水平的变化.研究采用双向凝胶电泳的方法分别对转入pCMV-Tag2B空载体和重组质粒pCMV-Tag2B-TRIM45的Hela细胞全蛋白进行分离,利用PDQUEST7.2软件分析,鉴定得到15个差异点,包括8个上调点和7个下调点.为进一步研究TRIM45基因的功能奠定了良好的基础.     

采用定量蛋白质组学技术筛选小鼠肝癌淋巴道转移相关蛋白

淋巴道转移是上皮来源恶性肿瘤转移的早期阶段,其发生机制不清,一直是肿瘤学研究面临的难题,为寻找淋巴道转移相关蛋白,以一对来源于同一亲本细胞,且淋巴道转移潜能显著不同的小鼠肝癌腹水型细胞株为研究对象,其中Hca-F为高淋巴道转移力细胞株,Hca-P为低淋巴道转移力细胞株,采用定量蛋白质组学技术——荧光差异双向凝胶电泳,建立了高低淋巴道转移力小鼠肝癌细胞荧光差异蛋白表达图谱,高通量筛选与肿瘤淋巴道转移相关的蛋白质.经DeCyde软件分析,共得到163个有统计学差异的蛋白质点,选择2倍以上的差异性蛋白质点23个,经质谱鉴定得到17个蛋白质,在Hca-F中高表达的蛋白质有7个:转羟乙醛酶、波形蛋白、肌酸激酶(脑)、膜联蛋白7、膜联蛋白5、烯酰辅酶A水合酶1(过氧化物酶体)、核内异质核糖核蛋白A2/B1异构体1.而在Hca-F中低表达的蛋白质有10个:真核翻译延长因子2、Ero1样蛋白、乙醛脱氢酶2(线粒体)、苹果酸盐脱氢酶2(NAD)、β-内酰胺酶2、谷胱甘肽S转移酶"1、泛素C末端水解酶同工酶L3、内质网蛋白29(前体)、溶血磷脂酶1、微管不稳定蛋白.这些差异性蛋白质的功能涉及到代谢、蛋白质分泌、蛋白质结合、核苷酸结合,钙离子结合、凋亡和调节生长等过程.对这些蛋白质功能的进一步验证,将有助于解析肿瘤淋巴道转移的分子机制.     

微波在蛋白质电泳染色和脱色中的应用

经过实验摸索和实践 ,我们发现一种利用微波处理在10ｍｉｎ内可使聚丙烯酰胺凝胶染色及脱色完成的方法 .ａ 将电泳后的凝胶 (厚度 0 75ｍｍ)取出 ,置于培养皿中用蒸馏水冲去残留缓冲液 .ｂ 加入染色液将凝胶完全浸泡其中 ,放入微波炉内高火档照射 2 0ｓ,停留 1ｍｉｎ ,再照射 10ｓ.ｃ 取出染色液 (回收还可再用 2次 ) ,用蒸馏水冲去凝胶上残留染色液 .ｄ 加入脱色液 ,高火档照射 2 0ｓ ,取出脱色液 ,然后加入新鲜脱色液再照射 2 0ｓ,重复5～ 6次 ,直至背景清晰透明 .实践中我们认为应注意以下几点 :ａ 盛试剂的培养皿上面应盖一稍大的培养…     

用脉冲电场凝胶电泳分析棉病囊霉及其突变体的染色体DNA

采用交变脉冲电场凝胶电泳和碱变性交变脉冲电场凝胶电泳方法,分析了棉病囊霉酵母菌及其2个不同的突变菌株的核型,得知此菌株含有5条染色体 DNA,而2株突变体的染色体 DNA 都没有大片段的缺失或双链断裂,但其稳定性不如野生型菌株的 DNA,而且存在单链断裂等碱不稳定性位点.     

胎肝β－族珠蛋白墓因中DNaseI超敏感点的定位及其结合蛋白的研究

本文以人３～４个月的胎儿组织为材料,测定了人胎肝中β－族珠蛋白基因上游－２５ｋｂ内的ＤＮａｓｅＩ超敏感点图谱。这些ＤＮａｓｅＩ超敏感点在胎肺、脑组织中不存在。通过凝胶电泳阻抑法实验,发现ＤＮａｓｅＩ超敏感点ＩＩ（ＨＳＩＩ）１．９ｋｂＤＮＡ片段有组织特异性和非组织特异性的结合蛋白。     

化学合成的人免疫干扰素基因在E.coli中表达

山人的免疫干扰素(hIFN—r)基因,启始和终止信号加上适当的限制酶位点组成的一个454bp的双链DNA片段被总地合成了。该合成包括用快速的固相法制备的62个寡脱氧核苷酸,以及用酶连接这些寡核苷酸。这个合成的基因在lacuv5启动子控制之下,在E.coli中表达。表达产物具有抗病毒活性,该活性系对酸不稳定并完全地被抗hIFN—r抗血清中和,但不能被抗hIFN—α或者hIFN—β抗血清中和。用凝胶过泸法和SDT—聚丙烯酰胺凝胶电泳分别地测出E.coli产生的hIFN—γ的分子量约为32,000和17,000。     

聚丙烯酰胺凝胶电泳技术

聚丙烯酰胺凝胶用于分析和制备长度小于1,000碱基对的DNA片段。 根据所研究的DNA片段的大小,可以选用从3.5％到20％的不同浓度的聚丙烯胺凝胶。