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用数值分类法解析肠杆菌的裂解色谱图 总被引:1,自引:1,他引:0
用TRS80型计算机,根据数值分类原理,对5属、10种、15株肠杆菌的58张裂解气相色谱图进行解析。结果表明:同一菌株连续多次(2—9次)分析所得裂解色谱图的符合系数为88—99%,根据符合系数可以区分不同菌株。例如,变形菌标准株和临床新分离株裂解色谱图的符合系数为.77—88%,说明在相同实验条件下用标准菌株作对照,有可能用此法对临床菌株进行鉴别。用符合系数对实验菌株的鉴别结果和传统分类法所得结果基本一致,但也有例外情况。例如,我们发现3株普通变形菌和2株奇异变形菌符合系数高达77—87%,表明二者在化学组分上极为相似,而这两种菌和摩氏、雷氏变形菌裂解色谱图的符合系数却均较低,这与Brennet根据[)NA杂交相关性的结果将变形菌重新分类的建议是一致的。 相似文献
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胡伟鹏刘备邹孝赵新民钱盛友 《激光生物学报》2018,(6):503-509
本文提出了一种基于功率谱信息熵和GK模糊聚类相结合的方法,应用于生物组织变性识别判定中。利用高强度聚焦超声辐照离体新鲜猪肉来改变其特性,并用热电偶测量声焦区温度,同时采集了不同温度时的超声回波信号。通过对采集的信号进行截取,研究了分段数对功率谱信息熵辨识性能的影响。研究发现当分段数为26至32时,功率谱信息熵的准确度、灵敏度和特异度均有较高的值。本研究计算了分段数为30时的功率谱信息熵,此时的变性组织对应的功率谱信息熵比未变性组织对应的功率谱信息熵平均高出约0. 094,大约为7. 99%。采用功率谱信息熵作为特征参数时,GK模糊聚类效果优于模糊C均值聚类;采用GK模糊聚类方式,功率谱信息熵比小波熵具有更高的辨识率。 相似文献
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排序轴分类法及其应用 总被引:14,自引:1,他引:13
排序轴分类法及其应用张金屯(山西大学生物系,太原030006)OrdinationAxesPartitioningandItsApplication. ¥ZhangJintun(DeportmentofBiology,ShanxiUniversi-t... 相似文献
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关于最大信息熵原理与群体遗传平衡一致性的探讨 总被引:16,自引:1,他引:15
汪小龙等建立了用最大信息熵原理推导一个基因座上群体遗传平衡的统一数学模型,并给出了模型的最大值解,此解正是Hardy-Weinberg平衡定律所给出的基因型频率。这说明当群体基因型信息熵最大时,群体基因型频率不再变化,达到平衡状态,从而证明了最大信息熵原理与Hardy-Weinberg平衡定律具有一致性,同时指出这一结论可以推广至有迁移、突变、选择、遗传漂变、近亲交配的群体以及多个基因座情形。概括地说就是:最大信息熵原理与群体遗传平衡具有一致性。但是,他们仅仅证明了最大信息熵原理与一个基因座上Hardy-Weinberg平衡定律具有一致性,本文在这个范围内将其推广至多个基因座,且每一个基因座均为复等位基因情形。至于最大信息熵原理是否与其它的群体遗传平衡具有一致性,他们的结论仅仅是猜想,并未严格推导。事实上,要想将这种一致性推广到迁移、突变、随机漂变和近亲交配等群体,则不见得正确。
相似文献
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辽中地区矿业城市土地利用变化 总被引:1,自引:0,他引:1
辽中地区矿业城市是我国重要的能源生产和重工业基地,研究其土地利用变化有利于改善环境质量,提高土地利用效率。分析了1985—2000年鞍山、抚顺、本溪土地利用变化指数、土地利用变化程度综合指数、土地利用结构信息熵、土地利用景观指数及其驱动力。结果表明:辽中地区矿业城市土地利用变化整体上呈现耕地、建设用地增加,林地、草地减少的趋势;不同矿业城市变化率最大的土地类型均不相同,鞍山为建设用地,增加5.45%;抚顺为水域,增加3.19%;本溪为草地,减少7.29%。土地利用程度变化综合指数均为正值,且鞍山>本溪>抚顺;土地利用结构信息熵均呈增长趋势,2000年鞍山为0.603,抚顺为0.406,本溪为0.407;景观破碎化程度加大,破碎度为鞍山>本溪>抚顺,景观多样性指数较高,景观结构复杂,景观多样性和均匀性均为鞍山>抚顺>本溪;自然条件的差异是土地利用变化差异的基础,人类社会经济活动和政策法规是土地利用变化的主要驱动力。 相似文献
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基于边界特征的黄河三角洲景观变化及空间异质性 总被引:1,自引:0,他引:1
在遥感解译和景观类型制图的基础上,运用滑箱扫描的方法,基于组分边界特征计算景观整体结构指数,同时综合考虑景观要素的空间分布,采用信息熵法和孔隙度指数法对黄河三角洲农田和柽柳-芦苇2种景观组分进行异质性特征分析.结果表明:黄河三角洲景观组分之间的边界趋于复杂化,城镇扩展、石油开采及黄河断流等使耕地大量退化为柽柳-芦苇,潮滩植被侵满滩涂;与基于面积的景观指数相比,基于边界特征的景观指数更能反映景观结构的细节变化;农田和柽柳-芦苇均表现为宏观异质性特征,部分样线中小尺度上表现为微观异质性特征,但柽柳-芦苇的异质性表现尺度较农田小50个像元左右,且这种差异随时间有加大的趋势;2种异质性分析方法从不同的侧面揭示了组分类型的异质性特征,形成有益的补充. 相似文献
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大肠杆菌、酵母和果蝇基因保守位点的信息熵分析 总被引:1,自引:0,他引:1
对大量的大肠杆菌(Escherichia coli)、酵母(Yeast)和果蝇(Drosophila melanogaster)已知基因起始密码子和终止密码子上、下游各30个碱基序列,用重新定义单碱基信息冗余(记为D1(ι),ι是位点)和紧邻碱基的信息冗余(记为D2(ι),统计计算每个位点的D1(ι)和D2(ι)值。从结果看,双碱基比单碱基携带更多的信息;酵母和果蝇基因起始密码子上游-3位点D1(-3)和D2(-3)有一明显峰值;大肠杆菌基因起始密码子上游SD区域D1(ι)和D2(ι)有明显峰值,与他人结论相同。发现酵母基因起始密码子下游的+4位点与+5位点的紧邻碱基的D2(ι)有一峰值,其关联模式为TC(联合概率为0.211)。这说明用重新定义的信息冗余去确认DNA序列中存在的保守位点是完全可行的。 相似文献
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真核生物DNA非编码区的组分分析 总被引:4,自引:0,他引:4
在全基因组水平上,用直方图、混沌表示灰度图、距离差异度和信息熵差异度四种方法,研究了拟南芥、线虫、果蝇的DNA内含子、基因间隔区DNA、外显子三种区域的核苷酸短序列组分及组分复杂度.结果表明:a.不同基因组之间,不管基因数目多少,用4种方法得到的外显子部分其组分复杂度都比较接近,而非编码区部分的组分复杂度却很大.这一点定量地说明了物种之间的复杂程度,主要不体现在编码区部分,而体现在非编码区部分.b.同一基因组中,内含子的核苷酸短序列组分复杂度都是相似的,外显子和intergenic DNA部分的组分复杂度也是相似的.c.内含子和intergenic DNA在转录、剪切、二级结构等方面有很大的不同,但它们在核苷酸短序列组分上的差异却很小,说明内含子和intergenic DNA在转录、剪切、二级结构上的不同并不通过核苷酸短序列组分来进行限制. 相似文献
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