陆地棉产量性状QTLs的分子标记及定位

用我国的高产栽培品种泗棉3号和美国栽培品种TM-1为材料,构建F₂和F_2∶3作图群体,应用301对SSR引物和1040个RAPD引物,对产量性状QTLs进行了分子标记筛选,结果共筛选出了37对SSR多态性引物和10个RAPD多态性引物的49个位点,鉴定出了控制产量性状变异的主效QTLs。定位于第9染色体的连锁群,分别具有控制铃重、衣分和籽指的主效QTLs,铃重的2个QTLs分别解释F_2∶3群体表型变异的18.2%和21.0%;在F₂群体检测到的1个衣分QTL解释表型变异的25%,另一个衣分QTL在F₂群体和F_2∶3群体都检测到,解释F₂群体衣分的24.9%的表型变异,解释F_2∶3群体衣分的5.9%的表型变异;在F_2∶3群体铃重的一个QTL的同一位置同时检测到一个籽指QTL,它解释15.6%的表型变异,是一因多效或是紧密连锁的两个QTLs,有待进一步研究。本研究标记的产量性状主效QTLs可用于棉花产量性状的标记辅助选择。     

植物反转录转座子及其分子标记

反转录转座子(retrotransposon)是真核生物中一类可移动因子,可分为m反转录转座子和非LTR反转录转座子。反转录转座子以高拷贝在植物界广泛分布,可以通过纵向和横向分别在世代之间和不同种之间进行传递,同一家族的反转录转座子具有高度的异质性．在一些生物的和非生物的逆境条件下,反转录转座子的转录可以被激活。由于反转录转座子的特点,使其作为一种分子标记得以应用。SSAP、IRAP、REMAP和RBIP等分子标记相继发展起来,在基因作图、生物遗传多样性与系统进化、品种鉴定等方面具有广泛的应用前景。     

功能作图(functional mapping)分析大肠杆菌和金黄色葡萄球菌之间的竞争互作

【背景】功能作图(functionalmapping)模型是基于统计方法的分析生物体动态复杂性状发育的全基因组作图方法,旨在定位性状发育过程中的数量性状位点(quantitative trait loci, QTL),将功能作图应用于微生物研究有助于解析复杂的互作过程。【目的】利用功能作图定位两种微生物在动态生长发育过程中发挥显著作用的QTL,通过基因功能注释找到影响微生物表型生长的基因。【方法】将大肠杆菌和金黄色葡萄球菌各100个菌株单独培养和一一配对共同培养,将取得的各菌株生长丰度表型数据和单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)数据进行关联分析,找到同一物种在不同培养条件下对生长起作用的显著QTL。【结果】通过功能作图分析,在大肠杆菌中定位到217个QTL,金黄色葡萄球菌中定位到152个QTL;通过功能聚类和基因注释分析发现,QTL所在候选基因中金黄色葡萄球菌scdA、sdrC、sdrD、ftsA和大肠杆菌phr、nagC、eptA、ppsA、priA、flim基因对微生物的生长发挥了较大作用。【结论】本文借助功能作图定位了大肠杆菌和金黄...     

利用染色体单片段代换系定位水稻芽期耐冷QTL

水稻(Oryza sativa)芽期耐冷性是其生长发育过程中不可忽视的重要数量性状,易受遗传背景的干扰和环境因素的影响;利用单片段代换系(SSSL.s)能减少遗传背景的干扰。该研究以85个单片段代换系为材料,其受体亲本为广陆矮4号,供体亲本为日本晴。通过单因素方差分析和Dun netts多重比较,分析单片段代换系与受体亲本之间芽期耐冷性的差异,并对代换片段上的芽期耐冷QTL进行鉴定。以F≤0.001为闽值共检测到8个芽期耐冷QTL,分别分布在第1、6、8、9和10号染色体上,其中4个QTL通过代换作图被初步定位。这些QTL加性效应均表现为增效作用,在2个年度间其加性效应值的变化范围分别为14%-44%和10%-45%,加性效应百分率的变化范围分别为700%-2 200%和500%-2 250%,其中qCTPg-2在2个年度间的加性效应均最高,分别为44%和45%。研究结果对进一步发掘和利用新的水稻芽期耐冷QTL具有重要意义。     

在粗糙脉孢菌两个连锁基因作图教学中若干关键问题的解析

顺序四分子遗传分析是遗传学教学的重要内容,特别是其中的两个连锁基因作图既是教学的重点又是难点。如何更好的讲解这部分内容,是许多遗传学教师或相关教材编者探索的主要问题之一。文章基于多年的教学实践,总结了学生难以理解但又容易被教师或教材编者忽略的若干关键问题,对这些问题进行了深入的分析并提出了相关的意见和建议,以供遗传学教师和教材编者参考。     

Construction of Oryza sativa genome contigs by fingerprint strategy

We described the construction of BAC contigs of the genome of a indica variety of Oryza sativa.Guang Lu Ai 4. An entire representative(Sixfold coverage of rice chromosomes)and genetically stable BAC library of rice genome constructed in this lab has been systematically analysed by restriction enzyme fragmentation and polyacrylamide gel electrophoresis.And all the images thus obtained were subject to image-processing,which consisted of preliminary location of bands,cooperative tracking of lanes by correlation of adjacent bads.a precise densitometric pass,alignment at the marker bands with the standard,optional interactive editing,and normalization of the accepted bands.The contigs were generated based on the Computer Software specially designed for genome mapping.The number of contigs with 600 kb in length on average was 464.of contigs with 1000kb in length on average was 107; of contigs with 1500 kb in length on average was Construction of Oryza Sativa genome contigs.23.Therefor,all the contigs we have obtained ampunted up to 420 megabases in length.Considering the size of rice genome(430 megabased),the contigs generated in this lab have covered nearly 98% of the rice genome.We are now in the process of mapping the contigs to chromosomes.     

辐照大麦M~1花粉母细胞染色体畸变及其与M~2 性状变异的关系

大麦种子经5种不同剂量γ射线辐照后, M1植株的花粉母细胞出现多种染色体畸变类型,例如后Ⅰ、后Ⅱ中出现桥、落后,后Ⅰ中出现不对称分裂,后Ⅱ中出现不同步分裂,中期Ⅰ出现环状四价体,末期Ⅰ中有三极分裂和微核,四分体中出现微核且有的微核独立于四分体,从而形成多分体。花粉母细胞的染色体畸变率随剂量的增高而升高,二者呈极显著直线相关关系。 M1花粉母细胞的染色体畸变率与M2的叶绿素突变率及农艺性状变异率呈显著或极显著指数函数关系。 M2花粉母细胞的染色体畸变率低于M1。 Abstract:Barley seeds were irradiated with five different doses of 60 Co-γ ray.There were many kinds of chromosome aberration in pollen mother cells,such as bridge,laggards in anaphase I and anaphase II,asymmetrical division in anaphase I and asynchronous division in anaphase II,ring quadrivalent in metaphase I,three pole division and micro-nuclei in telophase I,micro-nuclei in tetrad and some micro-nucleus separates from the tetrad to form polyad.The frequency of chromosome aberration in pollen mother cells of M1 increased with the increase of dose.There was a significant linear relationship between them.The frequencies of agronomic character mutation and chlorophyll mutation in M2 significantly correlated with the frequencies of chromosome aberration in pollen mother cells of M1 and showed an exponential function.The chromosome aberration frequency in pollen mother cells of M2 was lower than that of M1.     

利用分子标记和水稻籼粳交双单倍体群体进行遗传作图研究

利用“圭 630”(籼稻 ,Oryza sativa subsp.indica) /“0 2 4 2 8”(粳型广亲和品种 ,O.sativa subsp.japonica)的 F1代花药培养双单倍体植株 ( DH)群体和 RFLP标记构建了一张水稻分子连锁图谱。图上有 2 33个标记 ,覆盖基因组约 2 0 70 c M( centimorgan) ,定位了 2 5个 RFLP新标记、2个染色体端粒和水稻落粒性基因 sh- 2。亲本间的 RFLP主要来源于碱基取代 ,少数来源于 DNA结构的变化。RFLP标记在图谱上的排序与其它图谱基本相同 ,但标记在染色体间和染色体内分配不均 ,这可能与染色体间的遗传稳定性和染色体内的区段变异性 ,以及各区段交换重组活性不同有关。     

二氢叶酸还原酶天然状态可能存在两种构象

鸡肝二氢叶酸还原酶（ＤＨＦＲ）平衡态的去折叠曲线符合二态模型,但在４．０ｍｏｌ／Ｌ脲中的去折叠动力学为两相。该酶的ＡｒｒｅｈｉｕｓＰｌｏｔ有一个拐点,但在低浓度变性剂存在下,拐点消失。用二氢叶酸还原酶的天然状态存在两种构象可以很好地解释上述现象。二氢叶酸还原酶去折叠过程中没有稳定存在的中间体,动力学过程中的两相可能是两种天然构象态的去折叠速度常数不同造成的。ＡｒｒｅｈｉｕｓＰｌｏｔ的拐点是由于在不同的温度条件下,两种天然构象的含量不同造成的,低浓度变性剂对两种构象的影响不同,使拐点消失。ＫＣｌ可以改变两种构象的平衡     

用紫外交联法测定C3P4蛋白的亚基组成及分子量

本文报道了紫外交联法来测定一种受雄激素调控的未知的ＤＮＡ结合蛋白Ｃ３Ｐ４的亚基组成及分子量。紫外交联分析结果表明Ｃ３Ｐ４可能具有分子量约为１１０ｋＤ和２７ｋＤ的两种亚基。在Ｃ３Ｐ４进行Ｆｅｒｇｕｓｏｎ作图分析,揭示了Ｃ３Ｐ４天然分子量约为１２７ｋＤ。这表明Ｃ３Ｐ４很可能由分子量约为１１０ｋＤ和２７ｋＤ的两个亚基组成的异二聚体,其中１００ｋＤ在结合ＤＮＡ时起主要作用。