利用SSR标记定位水稻糊化温度的QTLs

糊化温度（GT）是决定稻米蒸煮食用品质的一个重要指标。研究了以碱消值表示的糊化温度（ASV－GT）的遗传和QTL位点,选择在ASV－GT上具有显著差别的灿稻品种南特号和粳稻品种Balilla杂交,并以Balilla回交得到含有142株的回交群体,ASV－GT的测定表明,在分离群体中ASV－GT表现为双峰连续分布,说明在该群体中ASV－GT是由一主效基因控制的,并伴有微效基因的修饰,进一步用119个在双亲间具有多态性的微卫星（SSR）标记构建了全基因组的分子标记连锁图,采用区间作图法对控制碱消值的基因进行了定位分析,结果表明,位于第6染色体的qASV6-1为一主效基因,其贡献率高达87．6％,来自于亲本南特号中的等位基因可降低碱消值3．26;其余5个QTLs(qASV2,qASV3,qASV6-2,qASV9,qASV11)为微效基因,分别位于第2,3,6,9和11染色体上,双亲中都带有增效和减效等位基因。     

利用MapInfo制作、展示生物学图片

Map Info软件在计算机、测绘、地理信息和气象乃至军事领域应用较多 ,而在生物学界却绝少使用或被提及 ,至今只见到关于地域分布的生物种群方面的报道。最近我们尝试使用 Map Info来进行生物学作图及其他方面的展示 ,结果较好 ,本文介绍我们的工作以及进一步的设想 ,以期与同行探讨。1　 Map Info的主要特点Map Info,是 GIS(Geographic Information System,中文名应为“地理信息系统”)中影响力较大的一种 ,它是反映人们赖以生存的现实世界 (资源或环境 )的现势与变迁的各类空间数据及描述这些空间数据特征的属性 ,在计算机软件和硬件…     

拟南芥与叶际微生物组的互作遗传机制——基于网络作图理论

叶际微生物组对植物的生长发育至关重要,但植物与其定殖微生物组相互作用机制尚不明确。目前植物与微生物互作研究多集中于根际微生物组,对叶际微生物组的研究较少,且这些研究未能从微生物互作的角度探究植物与微生物的相互作用机理。基于网络作图理论,将拟南芥基因组SNP （Single Nucleotide Polymorphisms）分子标记数据与微生物组网络特征值相关联,挖掘影响叶际微生物组网络结构的枢纽基因,以探究拟南芥塑造叶际微生物组网络结构的遗传机制。通过对188株拟南芥及其叶际微生物组数据的分析,识别出四种关系下的中心节点微生物,筛选到622个显著SNP位点。进一步构建了贝叶斯遗传网络,获得26个枢纽基因,这些基因可能参与了植物抗病、激素分泌和生长发育相关的分子途径。本研究从全基因组角度探究植物调控自身微生物组的遗传机制,揭示植物与微生物组如何互作促进植物健康,将为精准分子育种提供理论基础和遗传资源,并为合成菌群用于创制新型菌剂提供数据支持,具有重要的科学意义和应用价值。     

基于三点测交的双标记 -QTL基因定位的相关方法

提出在测交群体中,对区间标记座位赋值后求其与待定位的数量性状表型值间的简单相关系数Ｒ,以此进行连锁测验,并且在一定条件下用Ｒ值求出该数量性状座位（ＱＴＬ）与各标记座位（ＭＬ）间的重组值。     

用花药培养创建小麦加倍单倍体作图群体

用花药培养创建加倍单倍体作图群体是构建数量性状基因作图群体的有效途径,但通过花药培养生产小麦加倍单倍体的成功率较低。该文考查了小麦幼穗发育时期、低温处理幼穗及高温处理接种花药对花粉愈伤诱导率的影响。采用春播小麦做为花药供体,推迟花药接种时间,避免试管苗在低温条件下越夏,有利于早移栽,培育冬前壮苗,同时加强试管苗移栽后的田间管理,保证安全越冬,有效地提高了花药培养生产加倍单倍体的成功率。通过花药培养创建了一个具有１９１个个体的小麦加倍单倍体作图群体,该群体将用于小麦有关抗旱性状及产量性状基因的遗传作图     

小麦品系19HRWSN-76的抗叶锈性研究

小麦叶锈病是影响小麦产量的最主要病害之一,CIMMYT品系19HRWSN-76高抗小麦叶锈病,以该品系与感病品系郑州5389杂交得到F2群体,利用叶锈菌生理小种FHJP对F2群体接菌鉴定,结果显示群体的抗感比例符合3∶1的理论比值,推测19HR WSN-76的抗叶锈性由一对显型基因控制,暂命名为Lr HR76。利用分子标记技术和分离群体分组分析法对F2群体进行分子标记检测,位于3DL的SSR标记barc71与该抗病基因连锁,遗传距离为3.0 c M。     

利用染色体片段置换系定位水稻落粒性主效QTL

水稻落粒性是与其生产密切相关的重要性状之一。以7个染色体片段置换系为材料, 采用重叠群代换作图法对控制落粒性的2个主效QTL进行定位。结果表明, 104个SSR标记在亲本间具有多态性, 多态率为68.0%; 4个置换系的落粒性与亲本日本晴的落粒性相似, 表现难落粒。3个置换系与亲本93-11的落粒性相似, 表现易落粒; 7个染色体片段置换系在第1和第6染色体上检出7个置换片段, 其长度分别为23.6、16.5、 6.6、 9.9、 10.4、 20.2和7.1 cM; qSH-1-1被定位在第1染色体RM472－RM1387之间, 遗传距离约为6.6 cM。qSH-6-1为新发现的落粒性主效QTL, 被定位在第6染色体RM6782－RM3430之间,遗传距离约为4.2 cM。利用染色体片段置换系能准确地定位水稻落粒性QTL, qSH-1-1与qSH-6-1的鉴定和初步定位为其进一步的精细定位、图位克隆及分子标记辅助选择奠定了基础。     

Cytological identification of an isotetrasomic in rice and its application to centromere mapping

The aneuploid with isochromosome or telochromosome is ideal material for exploring the position of centromere in lingkage map.For obtaining these aneuploids in rice,the primary trisomics from triplo-1 to triplo-12 and the aneuploids derived from a triploid of indica rice variety Zhongxiao 3037 were carefully investigated.From the offsprings of triplo-10,a primary trisomic of chromosome 10 of the variety,an isotetrasomic “triplo-10-1” was obtained.Cytological investigation revealed that a pair of extra isochromosomes of triplo-10-1 were come from the short arm of chromosome 10.In the offsprings of the isotetrasomic,a secondary trisomic “triplo-10-2”,in which the extra-chromosome was an isochromosome derived from the short arm of chromosome 10,was identified.With the isotetrasomic,secondary trisomic,primary trisomic and diploid of variety Zhongxiao 3037,different molecular markers were used for exploring the position of the centromere of chromosome 10.Based on the DNA dosage effect,it was verified that the molecular markers G1125,G333 and L169 were Located on the short arm,G1084 and other 16 available molecular markers were on the long arm of chromosome 10.So the centromere of chromosome 10 was located somewhere between G1125 and G1084 according to the RFLP linkage map given by Kurata et al[1].The distance from G1125 to G1084 was about 3.2cM.     

MAR文库及其在真核基因组作图上的应用研究

基质结合区(matrix association regions,MAR) 是真核生物基因组中特有的一种参与基因表达调控和染色体动力学的顺式作用元件,也是真核染色体上的一种固有且各不相同的分子标记.通过体外(in vitro)或体内(in vivo)结合法可以得到与核基质特异性结合的MAR分子而构建MAR文库.体外MAR作为一种结构性的边界元件可用于染色体物理图谱的构建;而体内MAR作为某一组织中与核基质特异性结合的功能元件,则可用于研究已知基因的表达调控和染色体组织以及对新基因的分析.     

遗传作图的第三代工具──DNA芯片(DNA chip)

遗传病相关基因的定位工作是目前世界各国医学遗传学研究的焦点。90年代以来,随着人类基因组计划的发展;各种方法被相继创立和应用到这一领域中。DNA芯片充分结合并灵活运用了大规模集成电路制造技术、计算机、半导体、激光共聚焦扫描、寡核苷酸DNA合成、荧光标记探针杂交及分子生物学的其它技术,在这一领域的研究中有着巨大的潜力。相信在不久的将来,这一技术必将在基因定位研究中得到广泛的应用。