支持向量机在PPⅡ二级结构预测中的应用

PPⅡ二级结构是一种稀有的蛋白质结构类型。目前使用机器学习方法预测此二级结构的工作还比较少见。引入一种新的方法———支持向量机 (SVM)来预测PPII二级结构 ,并与神经网络方法进行了比较 ,结果表明 ,SVM方法在预测PPII结构上表现良好 ,预测精度达到 76 .5 2 %。     

珙桐树上“鸽花飞”

甘肃白水江保护区因有大熊猫、金丝猴、羚牛等国家一级重点保护动物而驰名中外。我作为一名保护区的普通职工,对保护区初期没有国家一级重点保护植物而感到困惑,难道“鱼和熊掌真的不能兼得吗?”带着困惑和试一试的想法,找来孩子的《植物学》教科书,耐心地看了几遍,还做了一个简易的标本夹,每次进林巡山都带上它,遇到不认识的植物便采上两份压在夹子里,下山后总要问问当地老乡,     

用离散量的方法识别蛋白质的超二级结构

用离散量的方法,对2208个分辨率在2.5I以上的高精度的蛋白质结构中四类超二级结构进行了识别。从蛋白质一级序列出发,以氨基酸(20种氨基酸加一个空位)和其紧邻关联共同为参数,当序列模式固定长取8个氨基酸残基时,对“822”序列模式3交叉检验的平均预测精度达到78.1%,jack-knife检验的平均预测精度达到76.7%;当序列模式固定长取10个氨基酸残基时,对“1041”序列模式3交叉检验的平均预测精度达到83.1%,jack-knife检验的平均预测精度达到79.8%。     

我国珍稀濒危植物保护红线的划定

本文依据《国家生态保护红线——生态功能基线划定技术指南(试行)》原则和植物保护的具体情况, 探讨了我国珍稀濒危植物保护红线划定的原则与方法。研究选取《国家重点保护野生植物名录》中收录的所有物种作为研究对象。将其定义为红线保护植物, 其中的I级保护植物定义为红线关键植物, 并基于文献资料及标本记录等数据建立了我国植物的属性数据库和地理分布数据库。在GIS支持下, 以建立的数据库为基础研究了我国红线保护植物的地理分布特征; 基于保护生物学理论, 结合我国自然保护区的就地保护现状进行了分析和评价; 以热点地区和GAP分析为理论基础, 在其分布地中识别具有代表性的热点区域以及不同属性植物分布的重点区域, 进而结合土地利用和人类干扰因素, 划定我国珍稀濒危植物生境整体保护的红线。通过在全国尺度上的分析, 得出我国珍稀濒危植物的整体保护红线面积为71.63万km², 占陆域国土面积的7.45%。植物生境保护红线划定的原则、方法和划定方案的研究对于更准确地划定生态安全预警红线具有重要意义, 同时可以为我国国土生态安全格局的构建提供依据。     

金钱松

金钱松[Pseudolarix amabilis（J．Nelson）Rehder]国家二级重点保护植物,又名金松,松科落叶高大乔木。树干通直,树冠圆锥形。树皮深灰色或灰褐色,鳞状片。枝条不规则轮生而平展,小枝有长短之分。叶片条形,扁平柔软,在长枝上成螺旋状散生,在短枝上15-30枚簇生,向四周辐射平展,秋后变金黄色,圆如铜钱,因此而得名。     

16S rRNA二级结构可变区图形分析在放线菌分类中的应用

采用16S rRNA可变区二级结构图形分析,比较了姜氏菌属及几个相关属种可变区二级结构的变化。结果表明,在9个可变区二级结构中茎的长度、环的数目和类型、茎的碱基对、以及环内部碱基均有不同。尤其在V5和V6两个区,这种差别尤为明显。这为姜氏菌属的建立提供了又一个证据,并认为16S rRNA可变区二级结构分析,可以应用于属以上原核生物的分类。     

未折叠蛋白质的普遍初始热力学亚稳态

探索和理解蛋白质折叠问题一直是分子生物学、结构生物学和生物物理学的终极挑战.未折叠的蛋白质应该存在一种普遍初始热力学亚稳态,否则无法解释蛋白质是如何在剧烈的热振动干扰下完成快速精确折叠的.本文通过分析水溶液环境和蛋白质折叠的相关性,揭示了一种由水分子屏蔽效应引起的未折叠蛋白质的普遍初始热力学亚稳态,该亚稳态的存在是水溶液环境中水分子的物理性质决定,并赋予未折叠蛋白质抵抗热扰动和避免错误折叠的能力.我们通过研究已发表的实验数据和建立分子模型,找到了该初始热力学亚稳态存在的相关证据,并推测了该亚稳态导致蛋白质精确折叠的相关物理学机制.     

安徽农业大学

园艺学园艺学学科为我校传统优势学科,具有一级学科博士点和3个二级学科博士学位授权点(茶学、蔬菜学、果树学),1个园艺学博士后科硏流动站。茶学为国家重点学科(培育)、安徽省首批特聘教授设岗学科,省部共建茶树生物学与资源利用国     

A study on the niches of the state’s key protected plants in Bawangling,Hainan Island

Aims An understanding on the living communities of the state’s key protected wild plants and the ability in utilizing resources and occupying ecological spaces by different populations is essential to the protection and propagation of rare and endangered plant species. We use our findings to highlight the knowledge gaps in the conservation strategies for the endangered species.
Methods Field investigations were conducted during 2009-2011. Based on the survey data on 70 forest plots in the Bawangling protected area, the niche breadths and overlaps of 12 species listed as the state’s key protected plants were calculated and analyzed.
Important findings The 12 species, by their niche breadth values in descending order, include Aquilaria sinensis, Nephelium topengii, Camellia sinensis var. assamica, Alseodaphne hainanensis, Keteleeria hainanensis, Podocarpus imbricatus, Firmiana hainanensis, Parakmeria lotungensis, Cephalotaxus mannii, Michelia hedyosperma, Ixonanthes reticulata, Dacrydium pierrei. The niche breadth value of a species is closely related to its range of geographical distribution; both Dacrydium pierrei and Parakmeria lotungensis had a narrow niche breadth corresponding to their narrow ranges of altitudinal distribution. In general, the niche overlap value is higher between species with greater niche breadth; the highest niche overlap value of 0.872 was found between Camellia sinensis var. assamica and Keteleeria hainanensis. However, the niche overlap value between species with smaller niche breadth could also be high; e.g. the niche overlap value was relatively high (0.693) between two species with smaller niche breadth, Michelia hedyosperma and Firmiana hainanensis, indicating that niche overlap value is dependent upon the biological characteristics and requirements for environmental resources of the species of comparison. Some species with low niche breadth values (e.g. Michelia hedyosperma and Ixonanthes reticulata) were found to have smaller populations. Due to lack of suitable community and habitats, these plant species are in dire need of more attention and prioritization for conservation. In conclusion, for the better protection and propagation of these endangered plants in the future, we should combine knowledge of their biological characteristics with that of their living communities such as the montane rainforests, etc.     

山西省重点保护野生植物资源及区系特征研究

以《国家重点保护野生植物名录(第一批)》和《山西省重点保护野生植物名录(第一批)》为依据,建立山西省重点保护野生植物名录。共记录57种保护植物,隶属于38科45属（其中国家Ⅰ级保护2种,国家Ⅱ级保护6种,省级保护49种）。分析结果得出,山西省重点保护野生植物在全省的分布不集中,零散分布于全省61个县区境内,且绝大多数物种的分布范围很狭窄。山西省重点保护野生植物区系具有复杂多样、起源古老、孑遗植物和单种属多等特点,科、属植物区系成分以温带分布型占优势,同时也有较明显的热带性质,过渡性特征比较明显,有其独特的地理优势和保护价值。本研究旨在对山西省重点保护野生植物资源现状及区系特征进行初步研究,从而为野生植物资源的保护和合理有效地利用提供科学的理论依据与参考。