一种新的EST聚类方法

该研究发展了一种EST（expressed sequence tag）聚类方法（ESTClustering）,用于分析大规模EST测序中所产生的大量数据,以获得高质量,非重复表达序列,该方法在聚类过程中采用MEGABLAST工具对一致序列进行序列同源比较,并用phrap程序对每一EST簇进行拼接检验。这一聚类策略能降低测序错误带来的影响,有效识别基因家族成员,并避免选择性剪接的干扰,与NCB（National Center for Biotechnology Information）的UniGene clustering）方法相比,ESTClustering的聚类结果可以更好地反映表达序列的多样性,用ESTClustering对112256条拟南芥EST聚类测试,产生23581个EST簇,其中13597个EST簇有对应拟南芥基因组编码序列,与该基因组中有EST作为依据的预测基因数目接近。应用该方法对收集的147191条水稻EST序列进行聚类,形成33896个EST簇。     

药用野生稻GBSS基因的系统发育及组织特异性表达

淀粉作为主要的碳水化合物在储藏能量方面发挥至关重要的作用。颗粒结合型淀粉合酶(GBSS)与直链淀粉的合成息息相关。尽管该酶的编码基因已在许多栽培植物中被分离和确定, 但有关它们在作物野生近缘种中的序列分歧和表达的研究却相对较少。该研究以药用野生稻(Oryza officinalis)为研究对象, 定性和定量地分析了GBSS编码基因的序列特点、与其它植物同源基因的进化关系以及在叶和种子中的表达情况。系统发育分析表明, 该酶在禾本科植物中分别由GBSSI和GBSSII基因编码。在药用野生稻中, 这2种基因所编码蛋白的氨基酸序列一致性为62%, 并且它们在不同器官内呈现时空分化表达, 其中GBSSI在种子中超强表达, GBSSII则主要在叶片表达。     

带扩散的Barbour血吸虫病模型的定性分析(英文)

这篇文章主要考虑由常微分方程组和偏微分方程组构成的Barbour血吸虫病模型.偏微分系统是反映空间和时间分布的反应扩散系统.对模型的定性性质进行了分析.利用比较原理得出解的一致有上界性.同时利用能量方法证明出椭圆系统在扩散系数的一定范围内没有非常数的正稳态解.     

转基因植物外源基因的整合分析

外源基因表达的不稳定性和多样性是制约转基因作物育种研发进度的关键因素,外源基因的整合情况与外源基因的表达直接相关,充分了解外源基因的整合情况可为构建高效表达载体、获得外源基因稳定一致表达转基因材料提供参考,同时为转基因作物的安全利用提供保障.就外源基因整合情况的分析方法、不同转化方法外源基因的整合特点及利用定点整合技术提高外源基因表达稳定一致性的研究进展作一概述.     

前颞叶在知觉组织中的作用：脑损伤病人的神经心理学研究

相邻性组织和相似性组织是两种极为重要的“知觉组织(perceptual organization)”．我们对前颞叶切除的患者CXY进行了相邻性组织与相似性组织的研究．利用由小图形组成的大图形来研究在相邻性组织与相似性组织中整体与局部之间的相互影响．研究中发现：在相邻性组织中,正常被试所体现的整体对局部的影响显著大于局部对整体的影响这一现象在CXY身上消失了,即CXY相邻性组织的自动加工出现了障碍;在相似性组织中,患者CXY的实验结果与正常被试没有任何差异．另外,在一致连通性(uniform connectedness, UC) 与相邻性组织及相似性组织之间的关系实验中,也发现CXY相邻性组织的自动加工出现了障碍．这些结果说明左前颞叶在相邻性组织、整体知觉以及对连通性的知觉中起到重要的作用．     

具有时滞和反馈控制的非自治Schoner模型的持续生存与全局渐近稳定性

讨论了具有时滞和反馈控制的非自治Schoner模型,得到了系统一致持续生存和全局渐近稳定的充分条件．     

稳定有界的Logistic方程的最优捕获策略

考虑单种群非自治的Logistic方程的开采问题．在R^ 中都存在均值的意义下,作为周期和概周期函数的推广,首先给出稳定有界函数的概念．然后定义一个新的最终最优收获策略用于处理我们的问题．选择单位时间的最大持久收益的极限均值作为管理目标。同时得到了最佳的种群水平．作为应用,我们以概周期系数的Logistic方程为例,表明我们的结果不仅推广了经典的Clark关于自治的Logistic方程的收获问题,而且推广了范猛和王克的关于周期的Logistic方程的收获问题的结果．     

立体视觉中的牵挂现象及其神经机制

目的:探讨立体视觉中单眼线索和双眼线索之间的牵挂机制.方法:选择该校视力或矫正视力正常的硕士研究生10名作为受试者,刺激呈现在校准过的SD2320W三维液晶显示器上.①一对具有清晰边沿的立方体,以及一对移除连接Y节点三条线后余下的立方体轮廓和Y节点所组成的图形,考察两组图形融合后,Y节点的深度情况;②三对连接Y的点的三条线是不连续的立方体,呈现一种逐渐变短的趋势,分别观察各组图形融合后,Y节点的深度变化.结果:①在实验1中,被试知觉到上面立方体的Y节点是突出来的,保证了一个完好的立方体结构,而下面立方体轮廓中的Y节点是凹进去的,离被试最远.②在实验2中,被试知觉到随着连接Y节点的三条线逐渐变短,Y节点的深度逐渐增加,以至最后完全陷了进去.结论:体视刺激的某些信息,当在单眼线索和双眼线索上发生了双重定义,且描述的深度信息不一致,便会产生视觉上的牵挂现象.