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两种PCR方法对木耳属菌株的遗传多样性评价 总被引:6,自引:0,他引:6
应用ERIC和RAPD两种PCR方法对木耳属3种29个菌株进行遗传鉴别,其中ERIC方法是首次运用于食用菌的研究领域。在相似系数75%的水平上,ERIC和RAPD分别将供试菌株分为9组和6组。由ERIC所得的聚类图可将黑木耳和毛木耳两个种区分开,而RAPD则不能完全区分两个种,但两种方法得到了一个相似的结果,即琥珀木耳与黑木耳的亲缘关系极其相近。Southern杂交实验进一步证明了ERIC所得到的29个菌株的同源性关系。分析表明,RAPD方法主要在种的水平上进行鉴别,而ERIC则可以在菌株水平上进行鉴别,结果与菌株栽培性状更为一致。研究结果表明ERIC-PCR是一种比RAPD更快捷可靠的分子标记方法,可以替代RAPD应用于木耳属的遗传多样性及遗传分类的研究。 相似文献
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牛源多杀性巴氏杆菌的分离与初步鉴定 总被引:2,自引:0,他引:2
【目的】本研究旨在对引起犊牛呼吸道综合征的多杀性巴氏杆菌进行分离鉴定,分析其亲缘关系和毒力基因的分布情况。【方法】收集2017年8月至2018年4月疑似患有犊牛呼吸道综合征的病牛鼻拭子进行细菌分离培养,对菌落形态和染色疑似巴氏杆菌的菌株进行16S rRNA测序和血清型鉴定,选择巴氏杆菌7类23种毒力基因,筛查临床分离株的毒力基因的分布。【结果】从8个省份的237份病料中分离出31株多杀性巴氏杆菌,分离率为13.1%。16S rRNA测序分析表明31株A型多杀性巴氏杆菌属于同一亚群,其序列同源性与中国分离株HB01以及国外分离株USDA-ARS-USMARC-60712、USDA-ARS-USMARC-60214、ATCC 43137以及36950亲缘关系较近。对分离出的31株A型多杀性巴氏杆菌的7类共23种毒力基因鉴定,结果显示31株多杀性巴氏杆菌所携带的毒力因子大多分布在17–19个,且集中度较高。【结论】A型多杀性巴氏杆菌为犊牛呼吸道综合症的主要流行血清型,通过对多杀性巴氏杆菌的临床分离株进化树和毒力基因分析,内蒙古、黑龙江、新疆、山西以及河北的7株分离株进化来源于同一分支,且均缺失毒力基因tadD和hgbA及携带毒力基因hsf-1,提示着其亲缘关系可能与其携带的特定毒力基因存在一定相关性。该研究为犊牛呼吸道综合征的病原学调查和多杀性巴氏杆菌流行病学调查提供了参考数据。 相似文献
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利用RAPD技术对香菇6个双单杂交菌株及其两个双核体基因组DNA进行了检测,结果显示:1~3号杂交菌株之间的相似系数为0.893~0.962,它们与其亲本S之间的相似系数为0.842~0.859;4~6号杂交菌株之间的相似系数0.857~0.925,与其亲本SSO1之间相似系数为0.708~0.902表明杂交菌株与其双核体亲本基因组具有较大差异,杂交菌株之间存在着不同程度差异,6个杂交菌株是真正的杂交后代,聚类分析树状图直观地表明了菌株间的遗传相关性,认为菌株间DNA的相似系数值可以作为杂交育种选择亲本的 相似文献
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堆肥中微生物总DNA的高效提取 总被引:6,自引:0,他引:6
采用化学裂解和酶解相结合的方法,选择加入PVPP的高盐缓冲液作为细胞裂解的反应体系,并以PEG-8000进行DNA沉淀,从高有机含量的堆肥样品中进行微生物总DNA的提取。结果表明,从4种性质不同的堆肥中均获得了高质量的微生物总DNA,所得的DNA分子片段在23kb左右;每克干重堆肥的总DNA提取量为63.54±12.08μg~106.50±28.36μg,A260/A280大于1.6,A260/A230大于1.8,不用经过纯化可以直接进行PCR扩增和限制性酶切;以该DNA为模板进行微生物区系的DGGE分析,显示了丰富的微生物多样性。该方法减少了通常环境样品DNA提取过程中的纯化步骤,减少了DNA的损失,为从事微生物分子生态学,尤其是那些针对高有机含量以及获取极为不易的环境样品的研究而言是十分有益的。 相似文献
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日本血吸虫蛋白酶体α2亚基基因的克隆、表达及功能分析 总被引:1,自引:0,他引:1
26S蛋白酶体是一种能够降解大多数内源性蛋白的多亚基复合物,它的蛋白降解作用能够影响细胞周期、转录控制和其他一些重要的细胞进程。本实验利用PCR技术从日本血吸虫18d童虫中首次扩增到蛋白酶体α2亚基基因(GenBank Accession No.AY813725),序列分析表明该基因的开放阅读框(ORF)含708bp,编码235个氨基酸,理论分子量25.84kDa。同源性分析结果显示,该基因为日本血吸虫蛋白酶体α2亚基,命名为SjPSMA2。实时定量PCR分析显示该基因在7d、13d、18d、23d、32d和42d虫体中都有表达,7d和23d虫体表达量低于其他几个时期。构建了该基因的原核表达质粒pET28a(+)-SjPSMA2,在大肠杆菌系统中成功获得了表达,重组蛋白以包涵体形式存在,Western blotting显示表达产物能被日本血吸虫成虫粗抗原免疫血清所识别,并且能检测到天然状态下该蛋白的存在。应用重组蛋白免疫BALB/c小鼠后,诱导产生了较高的特异性抗体水平及12.33%的减虫率和35.23%的肝脏减卵率。SjPSMA2基因及其表达产物的获得,为探索蛋白酶体在血吸虫生长发育中的作用提供了重要基础。 相似文献
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利用HPLC指纹图谱技术研究从同一灵芝子实体不同部位组织分离获得的菌株三萜化合物的差异。用常规组织分离方法获得不同菌株,在A、B、C、D四种培养基上进行出菇试验,运用HPLC指纹图谱技术获得各子实体三萜提取物HPLC指纹图谱,计算图谱间的相似度,分析三萜指纹的差异。结果表明,从子实体不同部位分离获得的四个菌株在同一培养基相同条件下培养获得的灵芝子实体的三萜指纹图谱相似度均大于0.99;同一部位分离获得的菌株在不同培养基相同培养条件下获得的子实体,其粗三萜HPLC图谱相似度均大于0.96;不同的组织分离部位和不同的培养基对灵芝菌株三萜指纹图谱的影响均不显著。18号菌株在C培养基上培养获得的子实体三萜含量最高,上层菌肉为最优组织分离部位,C培养基为最优培养基。灵芝的三萜组成不受生长环境的影响,而生长环境会对其三萜化合物含量产生一定的影响。本文首次应用HPLC指纹图谱方法对灵芝组织分离获得的菌株的差异性进行了研究。 相似文献
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目的本实验以大型实验动物屏障设施为研究对象,分析屏障设施的环境微生物及尘埃粒子的动态变化规律及其相关影响因素。方法测定屏障设施各功能区域不同时间及不同工作状态下空气落下菌和直径≥0.3μm尘埃粒子的数量变化。结果屏障系统落下菌与尘埃粒子变化规律如下:屏障系统内空气落下菌与尘埃粒子在饲养工作后显著升高,喷雾消毒后明显降低;大、小鼠饲育室空气落下菌与尘埃数在凌晨时明显升高,而兔饲育室在凌晨时间段则较低;清洁走廊和污染走廊在工作状态时细菌含量明显上升,非工作状态时细菌含量一直处于较低的水平。结论实验动物屏障系统的环境微生物与尘埃粒子的动态数量变化与动物品种、空气消毒、人员进出及动物室内的饲养操作等有关。 相似文献
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感染性猪圆环病毒2型基因组DNA的分子克隆 总被引:2,自引:0,他引:2
本研究通过PCR扩增出猪圆环病毒2型(PCV-2)的全基因组(1 768bp),克隆入pcDNA3载体的EcoRI酶切应点,获得含有PCV-2全基因组的重组质粒,命名为pcDNApcv2.将重组质粒大量扩增后,用EcoRI切出1 768bp的PCV-2全基因组,在体外用T4 DNA连接酶使其连接环化.用脂质体法将体外连接产物转染无PCV污染的PK-15细胞,经4次连续传代,用间接免疫荧光实验(IFA)及电镜观察证实已获得复制能力的PCV-2病毒.由此可见,本试验构建的环化的PCV-2全基因组DNA具有感染性. 相似文献
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甜樱桃胚胎离体培养 总被引:4,自引:0,他引:4
甜樱桃(Cerasusavium)果实采收后贮藏在40℃下30~40d。除去果肉,将内果皮撬开后,取出胚放在无菌水中浸泡30min,70%乙醇中30s,再用0.2%HgCl2或2%~4%NaOCI表面灭菌20min,最后用无菌水冲洗4次。将胚切成两部分,一部分带有胚珠(大小为整个胚的2/3),另一部分为子叶。将带有胚珠的外植体接种在诱导培养基(MS+0.5ms·*-‘6-BA+2%蔗糖十0.8%琼脂)上,20d后观察统计胚胎发育类型。然后,将外植体发育成的植株切除或保留主根转入增殖培养基(MS+0.5mg·L-‘6-BA+2%蔗糖十0.8%琼脂)。切除主根的试管苗培… 相似文献
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几种瓜类作物对根际高温胁迫的生理响应 总被引:1,自引:0,他引:1
以黑籽南瓜、‘春秋王2号’黄瓜、‘傲美’苦瓜、‘兴蔬’丝瓜、‘五叶香’丝瓜为试材,采用营养液栽培法,研究了这几种瓜类作物在根际35℃高温处理下的生长量、光合参数及地上部、地下部的渗透胁迫物质的变化。结果显示:处tE5d后,两种丝瓜幼苗的株高、茎粗、叶面积、根长、地上干重及地下干重,叶片相对叶绿素含量、净光合速率(Pn),气孔导度(Gs)、胞间CO2浓度(Gi)、蒸腾速率(Tr)与对照相比变化均不大,而另外三种瓜类的以上指标均受到明显的抑制;高温使得黑籽南瓜及黄瓜叶片和根系中都积累了大量的膜脂过氧化产物丙二醛(MDA),渗透调节物质脯氨酸和可溶性蛋白含量在叶片中增大,但在根系中却减小,而处理下‘五叶香’丝瓜的MDA含量与对照差异不显著,且两种渗透调节物质表现为叶片中减小根系中增大;处理下‘兴蔬’丝瓜根系中MDA的减少量及可溶性蛋白的增加量都大于‘傲美’苦瓜。结果表明,根际高温下两个丝瓜品种,特别是‘五叶香’丝瓜有较高的耐受力,通过提高根系中的渗透调节物质含量来降低根际高温对植株整体造成的伤害。 相似文献