EGFR配体生物学效应的多样性

表皮生长因子受体（epidermal growth factor receptor, EGFR）的配体作为一类重要的信号分子参与了细胞功能的调节,并且和机体发育、器官形成、组织修复与稳态维持,以及疾病的发生密切相关。虽然这些信号分子具有序列和结构上的相似性,但由于这些信号分子结构上的细微差异以及它们受体信号传导上的复杂性,造成了这些信号分子（配体）生物学效应的多样性。目前,从结构和机制上,对于单个信号分子的生物学效应已有较为深入的研究,但这些信号分子之间以及信号分子与受体之间的调控网络较为复杂,并且这种调控网络对信号的精细、有序和多样化转导至关重要。本文对EGFR配体的结构及配体生物学效应多样性的分子机制进行回顾,并对未来的研究方向提出展望。     

阿尔泰蝠蛾(鳞翅目:蝠蛾科)活蛹性别的无损鉴别方法

通过观察阿尔泰蝠蛾雌雄蛹的外部形态结构,并测量其体征和体重数据,寻找可用于鉴别蛹性别的无损方法;再借助于解剖等方法鉴别蛹的确切性别,检测鉴别方法的准确性。结果显示,雌雄蛹在体征和体重数据的分布范围上有重叠,不能籍此区分其雌雄性。然而,雄蛹腹面第8腹节和第9腹节间分节明显,第9腹节未向第8腹节纵伸,生殖孔位于第9腹节上,生殖孔两侧各有一球形突起,生殖孔前缘与肛门前缘间的距离短于肛门的长度;雌蛹不具备以上特征。基于这些特征开发的鉴别阿尔泰蝠蛾蛹雌雄的方法,鉴别活蛹的准确率均为100%(n=180)。该方法对活蛹无损伤、准确、可靠、简便易学。     

Digital image analysis of AgNORs in cervical smears of women with premalignant and malignant lesions of the uterine cervix

We performed a hospital-based, unmatched case-control study to investigate the association between progressive stages of cervical neoplasia and digital analysis of cell proliferation by silver stained nucleolus organizer region associated proteins (AgNORs). We measured cell proliferation levels in the cervical epithelial cells of 10 women with low grade squamous intraepithelial lesions (LG-SIL), eight with high grade squamous intraepithelial lesions (HG-SIL), 11 with cervical cancer (CC) and eight with no cervical lesions (controls) using the AgNORs technique. Cell proliferation was measured by digital image analysis (DIA). DIA revealed increased total areas of AgNORs in HG-SIL and CC compared to LG-SIL and control patients. AgNORs with a kidney or cluster shape exhibited greater areas than those with a spherical or long shape. We propose a cut-off of 118 pixels to differentiate benign (control and LG-SIL) from malignant (HG-SIL and CC) lesions. DIA of AgNORs is a simple and inexpensive method for studying proliferation. The increased total area of AgNORs in malignant lesions provides information regarding cell behavior and may be related to cervical carcinogenesis; however, further validation studies are required to establish its usefulness in cytological analysis.     

Integrating Horizontal Gene Transfer and Common Descent to Depict Evolution and Contrast It with “Common Design”1

ABSTRACT. Horizontal gene transfer (HGT) and common descent interact in space and time. Because events of HGT co‐occur with phylogenetic evolution, it is difficult to depict evolutionary patterns graphically. Tree‐like representations of life's diversification are useful, but they ignore the significance of HGT in evolutionary history, particularly of unicellular organisms, ancestors of multicellular life. Here we integrate the reticulated‐tree model, ring of life, symbiogenesis whole‐organism model, and eliminative pattern pluralism to represent evolution. Using Entamoeba histolytica alcohol dehydrogenase 2 (EhADH2), a bifunctional enzyme in the glycolytic pathway of amoeba, we illustrate how EhADH2 could be the product of both horizontally acquired features from ancestral prokaryotes (i.e. aldehyde dehydrogenase [ALDH] and alcohol dehydrogenase [ADH]), and subsequent functional integration of these enzymes into EhADH2, which is now inherited by amoeba via common descent. Natural selection has driven the evolution of EhADH2 active sites, which require specific amino acids (cysteine 252 in the ALDH domain; histidine 754 in the ADH domain), iron‐ and NAD⁺ as cofactors, and the substrates acetyl‐CoA for ALDH and acetaldehyde for ADH. Alternative views invoking “common design” (i.e. the non‐naturalistic emergence of major taxa independent from ancestry) to explain the interaction between horizontal and vertical evolution are unfounded.     

不同大豆连作年限对黑土细菌群落结构的影响

大豆连作导致作物产量下降、病原微生物富集和土壤退化等问题日趋严重。然而,目前关于大豆连作对土壤细菌群落结构组成及多样性分布的影响及发生机制尚不清楚。采用高通量测序技术,对大豆连作(不同年限)和大豆-玉米轮作下的黑土细菌16S rRNA基因进行测序分析。结果表明:轮作5年(CR5)和13年长期连作(CC13)处理显著增加了土壤pH、全氮(TN)、全磷(TP)和速效养分(AN、AP和AK)含量。与短期连作相比,CR5和CC13处理均提高了细菌群落的OTUs数量、PD值、Chao1指数和Shannon指数。聚类分析图谱结果显示细菌群落结构组成受到轮作和连作年限的双重影响,而土壤pH、TN、TP、AN、AP和AK是细菌群落结构发生变化的主要驱动因子(P0.05)。此外,VPA分析发现上述土壤因子中,土壤pH对细菌群落结构变化的贡献度最大。本研究证明大豆长期连作提高了土壤养分含量和细菌群落的丰富度和多样性指数,从分子生物学的角度证实大豆长期连作在一定程度上改善了土壤环境,为大豆连作障碍的研究提供了理论依据。     

挂榜山小鲵早期胚胎发育初步观察

2005年1～2月,在Nikon体视镜下对挂榜山小鲵的早期胚胎发育过程进行了观察,对不同发育时期进行了数码拍照。根据胚胎发育的外部形态及典型特征将挂榜山小鲵早期胚胎发育过程分为21个时期。在水温6．5～10℃的条件下,受精卵历时1134h孵化出膜,初孵幼鲵全长约16．50mm。     

牛磺酸及微量营养素对大鼠视网膜NOS表达及cGMP含量影响的研究

目的：探讨大鼠补充一定剂量牛磺酸及微量营养素后,能否通过影响视感受器或视中枢ＮＯ合成酶（ＮＯＳ）表达及第二信使（ｃＧＭＰ）合成,影响视觉信号传导。方法：Ｗｉｓｔａｒ大鼠随机分为三组,即对照组（正常饲料组）、实验１组（５倍需要量组）和实验２组（１０倍需要量组）,喂养３周后,每组动物再随机分为光照组和暗适应组（平均照度为３．０３ＬＸ）,以正常饲料喂养７２ｈ,大鼠活杀取样,以放射免疫方法分析ｃＧＭＰ含量     

绵羊羊膜上皮细胞治疗兔桡骨缺损模型的研究

为了确定绵羊羊膜上皮细胞在体内向骨组织的分化能力,实验在分离培养绵羊羊膜上皮细胞并对其进行干细胞特性的鉴定的基础上,制作新西兰大白兔桡骨13mm骨缺损模型,随机分组对其进行注射绵羊羊膜上皮细胞实验。高剂量组:移植细胞5×107个;低剂量组:移植细胞5×106个;对照组:生理盐水。细胞移植后2、4、8周拍摄X光片观察骨缺损部位的缺损修复情况;相应时段取骨缺损部位新生骨进行组织学观察:分析骨小梁生成数量和骨的改建时期。实验结果显示,高剂量实验组在移入细胞第8周,骨缺损完全修复,且同期高剂量组新骨生成的数量和质量明显高于低剂量组,低剂量组优于对照组。由此可见,绵羊羊膜上皮细胞不仅可以在不同种动物间进行移植,而且对骨缺损有良好的修复能力。     

我国典型湿热地区变质烟用香精中腐败微生物的多样性分析

【背景】烟用香精是卷烟生产中的重要辅料,有些香精,特别是剩余的加料香精在运输和储存等过程中可能污染微生物,引起腐败变质发生。【目的】分析变质烟用香精中腐败微生物的群落多样性,确定引起加料香精变质的主要腐败微生物。【方法】采用稀释平板法,对我国典型湿热地区云南、福建和广西三地变质加料香精样品中的污染细菌、霉菌或酵母进行分离,分析其16S rRNA、ITS或26S rRNA基因序列,并通过反证试验确定引起变质的主要腐败微生物。【结果】所考察3个典型湿热地区变质加料香精存在不同程度的细菌、霉菌或酵母污染,其中细菌污染最为普遍。分离的76株污染细菌分布在2门4纲5目10科15属,细菌的群落多样性比较丰富,其中雷尔氏菌属(Ralstonia)、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)、肠杆菌属(Enterobacter)及芽孢杆菌属(Bacillus)是优势菌群;9株霉菌分布在子囊菌门(Ascomycota)的3纲6属,每个属分离到1-2株霉菌;42株酵母分布在子囊菌门的6个属,其中毕赤酵母属(Pichia)、细枝钩酵母菌属(Wickerhamomyces)及酵母菌属(Saccharomyces)是优势菌群。云南和福建两地样品的细菌菌群组成明显多于广西,广西样品的霉菌菌群组成以及福建样品的酵母菌群组成均分别多于其余两地。反证试验结果显示,柠檬酸杆菌属、肠杆菌属、芽孢杆菌属、雷尔氏菌属和毕赤酵母属是引起烟用加料香精变质的主要腐败微生物。【结论】变质加料香精中污染微生物菌群组成及腐败微生物确定的研究将有助于我国湿热地区香精香料中污染微生物的控制和腐败变质的预防。     

一株嗜麦芽窄食单胞菌裂解性噬菌体的分离及生物学特性

【背景】嗜麦芽窄食单胞菌是一种广泛存在于医院和自然环境中的条件致病菌,其分离率与耐药率逐年增加。噬菌体是一类能特异性感染并杀灭细菌的病毒。【目的】分离一株新型嗜麦芽窄食单胞菌噬菌体,为临床嗜麦芽窄食单胞菌感染及防控提供补充手段。【方法】以临床分离的嗜麦芽窄食单胞菌为宿主菌,用点板法从医院污水中分离鉴定噬菌体;用双层平板法测定噬菌体效价及一步生长曲线等生物学特性;用透射电镜观察噬菌体形态;提取噬菌体基因组DNA进行全基因组测序,拼接噬菌体基因组并进行注释。【结果】分离到一株嗜麦芽窄食单胞菌裂解性噬菌体,命名为v B＿Sma S＿P11。该噬菌体感染宿主菌的潜伏期小于5 min,快速增殖60 min后达到平稳期,暴发量为100 PFU/cell。透射电镜观察该噬菌体为长尾噬菌体,具有典型的二十面体头和不可收缩的尾部。基因组测序结果表明,该噬菌体基因组全长44 600 bp,GC含量为63.7%,无抗生素耐受基因、毒力基因和t RNA,与NCBI数据库中所有已知嗜麦芽窄食单胞菌噬菌体相比同源性很低。基因组注释显示该噬菌体含有66个开放阅读框(open reading frame,ORF),其...