MicroRNA regulation constrains the organization of target genes on mammalian chromosomes

The regulation of microRNAs (miRNAs) is a complicated process requiring a large number of molecular events to be coordinated in both space and time. It is not known whether this complicated regulation process constrains the organization of target genes on mammalian chromosomes. We performed a genome-wide analysis to provide a better picture of chromosomal organization of miRNA target genes. Our results showed clustering of the target genes (TGs) of miRNAs on mammalian chromosomes, and further revealed that the particular gene organization is constrained by miRNA regulation. The clustering pattern of TGs provides an insight into the complexity of miRNA regulation.     

MK基因对小鼠子宫基质细胞蜕膜化进程的影响

为探索肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TNF related apoptosis inducing ligand,TRAIL)的死亡受体(mouse killer,MK)对小鼠子宫基质细胞蜕膜化进程的影响,构建MK基因过表达和siRNA干扰重组腺病毒.原代培养的小鼠子宫基质细胞感染MK过表达或者干扰重组腺病毒并诱导蜕膜化,72 h后用免疫细胞化学与流式细胞术分别检测蜕膜细胞的标志物催乳素(prolactin,PRL)与蜕膜细胞凋亡率的变化情况.妊娠d4小鼠子宫角注射MK重组腺病毒,观察胚胎植入点的数量变化.实验结果表明,与对照组相比,在诱导的蜕膜细胞中过表达MK使得催乳素的含量显著降低(P<0.05),同时,蜕膜细胞的凋亡率明显升高(P<0.05),而siRNA干扰之后催乳素的含量显著升高,凋亡率明显下降(P<0.05),但是,宫角注射MK基因过表达和siRNA干扰重组腺病毒之后,胚胎植入数量均显著减少(P<0.01).提示MK基因通过参与小鼠子宫内膜基质细胞的蜕膜化进程,调节蜕膜细胞增殖与凋亡之间的平衡从而影响胚胎的植入.     

利用改进的手工克隆技术生产转GFP基因猪克隆胚胎

通过体细胞核移植(Somatic cell nuclear transfer,SCNT)培育转基因动物新个体是当前被广泛使用的技术之一,但其生产成本高和转基因囊胚形成率低在很大程度上制约了该技术的应用。文章报告对该技术的一些改进以提高其成功率并降低成本。首先将增强型绿色荧光基因(EGFP)导入猪胎儿成纤维细胞中,通过荧光观察EGFP的表达来筛选适合做细胞核移植的体细胞。这样避免了外源EGFP基因虽已整合至猪基因组但不表达的情况,保证供体细胞100%是表达目标蛋白(绿色荧光蛋白)的细胞;然后利用新一代体细胞核移植技术——手工克隆技术(Handmade cloning,HMC)将供体细胞与卵母细胞融合生产胚胎。共收集了4个批次378个肉用家猪的卵母细胞,经体外培养成熟后手工去核得到266个去核卵母细胞,与EGFP细胞融合后获得127个重构胚胎,将重构胚胎体外培养到144 h,得到转基因囊胚65个,平均囊胚率为52.1±8.3%。与传统SCNT相比,HMC不仅操作简便,而且能大幅提高核移植细胞的囊胚率。更为重要的是,改进的手工克隆技术摆脱了昂贵的显微操作仪,为产业化生产转基因动物提供了新的实用基础。     

Two New Limonoids from the Fruits of Melia azedarach (Meliaceae)

Two new limonoids, trichilinin M ( 1 ) and ohchinin benzoate ( 2 ), along with two known limonoids, 12-hydroxyamoorastatone ( 3 ) and mesendanin H ( 4 ), were isolated from the fruits of Melia azedarach Linn. The structures of new limonoids were determined by analyses of HR-ESI-MS, 1D and 2D NMR (HSQC, HMBC and NOESY) data. All compounds were evaluated against human pancreatic cancer PANC1 cells and the results showed that compounds 3 – 4 exhibited substantial cytotoxic activity ( 3 : IC₅₀=4.55 μM; 4 : IC₅₀=7.54 μM), and compounds 1 – 2 exhibited moderate cytotoxicity ( 1 : IC₅₀=27.06 μM; 2 : IC₅₀=21.17 μM).     

土壤中棉花黄萎病菌SYBR Green Ⅰ荧光RT-PCR定量检测技术研究

为实现田间土壤棉花黄萎病菌的早期检测,建立了土壤中棉花黄萎病菌的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR检测方法.以含342bp PCR扩增产物的阳性质粒为参考,构建了标准曲线,并对该曲线的特异性、敏感性、可重复性进行了评价.结果表明,该方法具有快速、特异性强、敏感度高等特点.检测范围在3.8×103-3.8×108cop...     

Chromosomal variation and evolution in Lycoris (Amaryllidaceae) I. Intraspecific variation in the karyotype of Lycoris chinensis Traub

In 188 bulbs from five populations of Lycoris chinensis from Anhui province, China, several chromosomal variations have been discovered. Although their frequencies are low, some rearranged chromosomes which are aberrant have been found. The aberrants are: (1) small metacentrics (m′); (2) submetacentrics (sm); (3) subtelocentrics (st); (4) acrocentrics (t); and (5) satellite chromosomes (SAT). All can be easily suspected as being derived from telocentric chromosomes (T type chromosomes). Some individuals having one or more B chromosomes have been found, and intrapopulational variation of B chromosomes in number has also been observed. Because of having B chromosome, L. chinensis has some different chromosome complement numbers: 2n?=?16, 2n?=?16?+?1B, 2n?=?16?+?2B, 2n?=?16?+?3B, and 2n?=?16?+?5B. In addition, a new triploid karyotype composed of 3n?=?24?=?9m?+?11t(2SAT)?+?4T chromosomes has been found. Vegetative propagation is an efficient means of perpetuating the aberrant chromosomes and the triploids.     

中华通草蛉自然越冬成虫在两种光周期下滞育解除过程中的生理生化变化

摘要: 光周期在昆虫滞育中起重要作用, 而昆虫光敏感性差异导致了光在昆虫滞育解除过程中作用机制的多样性。为明确光周期在中华通草蛉Chrysoperla sinica (Tjeder)滞育解除过程中的调控机制, 本研究测定了长光周期（15L∶9D）和短光周期（9L∶15D）条件下, 中华通草蛉自然越冬种群成虫在滞育解除过程中的干重、 含水量、 过冷却点（supercooling point, SCP）、 结冰点（freezing point, FP）及蛋白质和糖原含量变化。结果表明： 雌成虫干重在长光照下处理30 d低于短光照下, 其他处理时间的干重均高于短光照下, 但处理间差异不显著（P>0.05）; 雄成虫在长光照下处理5 d的干重高于短光照下, 其余处理时间的干重均低于短光照下, 其中处理30 d 时差异显著（P<0.05）。雌、 雄成虫含水量总体呈上升趋势, 长光照下上升显著（P<0.05）, 短光照下上升不显著（P>0.05）。雌、 雄成虫的SCP、 FP在短光照下处理不同时间均无显著性差异（P>0.05）, 而长光照下表现出先降后升的趋势且处理间差异显著（P<0.05）。成虫蛋白含量在短光照条件下雄虫处理10 d以及雌虫处理15 d均显著低于长光照（P<0.05）, 其他处理之间没有显著性差异。短光照处理成虫体内糖原含量均高于长光照, 且有显著性差异（P<0.05）。多因素方差分析表明, 不同光周期对中华通草蛉成虫滞育解除过程中的SCP、 FP、 糖原变化均有显著性影响（P<0.05）, 而对干重、 含水量及蛋白质含量影响不显著;性别只对成虫FP与糖原有显著影响（P<0.05）; 处理时间对干重、 含水量、 SCP、 FP、 蛋白及糖原含量均有显著影响（P<0.01）。3种因素的交互作用对SCP、 FP、 蛋白及糖原含量均有显著影响, 对干重及含水量影响不显著。初产卵成虫体内物质含量变化测定发现, 长光照（处理10 d）下雌、 雄成虫体内蛋白和糖原含量极显著低于短光照（处理25 d）下（P<0.01）, 雄成虫体内含水量显著高于短光照下（P<0.05）。结果说明, 中华通草蛉自然越冬成虫在长、 短两种光周期下均逐渐解除滞育, 但在滞育解除过程中呈现出不同的生理生化变化。     

Additional Notes on the Begonia Sect. Petermannia (Begoniaceae) from China

Begonia pellionioides YM. Shui & WH. Chen, a new species of the genus Begonia L. (sect. Petermannia (Klotzsch) A. DC., Begoniaceae), is described and illustrated. The new species is endemic to limestone areas in Southeastern Yunnan Province, China, and is most similar to Begonia hainanensis Chun & F. Chun but distinguished by its more elongated leaves with cuneate base and acuminate to caudate apex, tepals adaxially with spiny hairs and sharply triangular capsule wings with truncate superior margin. Besides, the unknown flower morphology of previously published Begonia sublongipes YM. Shui in Begonia sect. Petermannia is described.     

尖毛虫属Actin Ⅰ、α-TBP和DNA pol α乱序基因的模式研究

研究旨在对尖毛虫属内现有物种的3种乱序小核基因结构进行比较,探讨其乱序模式。于湛江湖光红树林水域中采集到一个尖毛虫属物种Oxytricha sp.（ZJ）,成功扩增了其肌动蛋白Ⅰ（ActinⅠ）、端粒结合蛋白（α-TBP）、DNA聚合酶α（DNA pol α）3个乱序基因的完整大核基因序列和完整/部分小核基因序列,并结合已有资料对比研究了尖毛虫属这3个乱序基因的进化。结果表明:（1）Oxytricha sp.（ZJ）与O.nova的小核Actin Ⅰ基因具有相同的乱序模式,区别于其余的尖毛虫属物种;在增加尖毛虫属物种的基础上,对前人推测提出了质疑,我们认为MDS-IES接合处移动现象在乱序MDSs之间并非比非乱序MDSs之间更保守。（2）Oxytricha sp.（ZJ）与O.nova的小核α-TBP基因具有相同乱序模式和相似长度的IESs。（3）Oxytricha sp.（ZJ）的小核DNA pol α基因乱序模式,区别于任一已报道物种,与属内O. trifallax最为相近。基于序列分析,在DNA pol α基因中发现了一例IES转换为MDS的痕迹,以及由此导致原先MDS的丢失。研究发现在编码区内IES向MDS的转变,使得本应删除的序列成为基因组永久保留的一部分。     

一种新型的双功能体内突变检测系统的建立

将含有两个LacI靶基因的穿梭质粒pMCLacI/neo整合入小鼠的基因组中 ,建立一种能同时分析体内表达基因和沉默基因的双功能的新型体内突变检测系统 ,使在体内比较分析不同组织、器官中表达基因和沉默基因的突变谱和突变率成为可能。486个经显微注射过 pMCLacI/neo质粒的C5 7BL/ 6小鼠的受精卵 ,分别移植入 18只假孕母鼠的输卵管中 ,产下 32只存活小鼠 ,进一步检测证实 :(1)有 5只小鼠在基因组中整合有 pMCLacI/neo基因 ;(2 )该质粒中的两个LacI靶基因 ,只有一个表达 ;(3)能有效地从小鼠基因组中回收 pMCLacI/neo基因。因此 ,成功建立了pMCLacI/neo的转基因小鼠品系 ;可以将该小鼠用于整体动物水平研究表达基因和沉默基因突变机制的模型 ;该模型为一种具有双功能的新型体内突变检测系统