乙肝治疗耐药基因突变的焦磷酸测序技术诊断

目的：建立焦磷酸测序技术检测拉米夫定和阿德福韦酯治疗乙肝所致乙肝病毒基因耐药突变的定量检测方法,为临床乙肝耐药诊断和治疗提供依据。方法：针对乙肝病毒DNA聚合酶基因序列上4个常见基因突变位点的6种突变形式,分别克隆构建野生型和突变型质粒作为标准品,应用生物信息学手段设计目标基因通用PCR引物和各突变点的焦磷酸测序引物,建立焦磷酸测序的突变检测方法。对接受拉米夫定、阿德福韦酯治疗的慢性乙型肝炎患者血清标本进行检测。结果：构建了乙肝病毒四种常见耐药性突变的标准株和变异株克隆,建立了分别或同时检测拉米夫定、阿德福韦酯耐药突变的焦磷酸测序方法,对68例临床耐药或疑似耐药的患者血清标本进行检测,双脱氧测序验证,检出拉米夫定耐药突变32例,阿德福韦酯耐药突变5例,其中焦磷酸测序检出20例为混合突变,而双脱氧测序显示为6例。结论：成功建立了焦磷酸测序定量检测拉米夫定、阿德福韦酯耐药基因突变的方法,构建了乙肝病毒耐药基因突变的标准质粒,为临床动态监测乙肝病毒变异病毒株、指导合理用药奠定了基础。     

A rapid method for determination of Proteus vulgaris with a piezoelectric quartz crystal sensor coated with a thin liquid film

A rapid method for microorganism detection using a piezoelectric quartz crystal sensor (PQC) coated with a thin liquid culture medium film was developed and applied to detect the cell number of Proteus vulgaris. This method employed the viscosity and density response of PQC and utilized the coagulation of gelatine medium solution in which the microorganisms had grown to determine the microorganism indirectly. Three time points (TT₁, DT, TT₂) were obtained from the coagulation curve and were found to be in good linear relationship with the logarithm of the initial number of P. vulgaris in the range 1·3 × 10²−1·3 × 10⁵ cells/ml. The detection was rapid and accurate because the coagulation of the thin liquid culture medium film was quick and the time points in the response curve were sharp and so were easy to determine accurately. The detection time was less than 4 h and only a micro sample was needed. A 5 h preincubation was needed before detection. Some experimental conditions are discussed in detail.     

The Mouse Spam1 maps to proximal Chromosome 6 and is a candidate for the sperm dysfunction in Rb(6.16)24Lub and Rb(6.15)lAld heterozygotes

We have determined the chromosomal localization of the murine gene encoding the 68-kDa sperm adhesion molecule 1, Spam1 or Ph-20. Using two independent approaches, fluorescence in situ hybridization (FISH) and interspecific backcross analysis, we show that Spam1 maps to proximal mouse Chromosome (Chr) 6. This map position is within the conserved linkage group corresponding to human Chr 7q, where the human homolog, SPAM 1, has been shown to map previously. Genetic mapping shows the gene to be very closely linked to Met, one of the most proximal loci on MMU 6. It thus places the gene near the centromere and the junction of the Rb(6.16)24Lub and Rb(6.15)1Ald translocations. The essential role of the Spam1 sperm antigen in mouse sperm-egg interactions and its gene location provide strong support for its candidacy as the gene involved in the dysfunction of mouse sperm bearing the Rb(6.16)24Lub or Rb(6.15)1Ald translocation. Received: 16 July 1996 / Accepted: 23 September 1996     

最大信息熵原理与群体遗传平衡

建立了用最大信息熵原理推导群体遗传平衡定律的统一数学模型,并给出了模型的统一解,此解正是Hardy-Weinberg定律所给出的平衡群体的基因型频率,说明当群体信息熵达到最大时,群体基因型频率不再变化,即达到“平衡”。这证明了最大熵分布就是Hardy-Weinberg平衡分布。Hardy-Weinberg平衡定律与最大信息熵原理的内在一致性说明,杂交和随机交配是一个不可逆过程,使群体基因型信息熵增大,无序性增,是选择和近亲交配使群体的信息熵降低,有序性增加,育种过程实际就是调节群体信息熵的过程。过程信息熵的含义是表示一个概率分布的不确定性,最大熵原理意味着在一定的约束条件,选择具有最大不确定性的分布,从而其分布是最为随机的。最大熵原理在信息,工程,天文,地理,图像处理,模式识别等自然科学和社会科学领域都有广泛的成功应用,本文从群体遗传学角度证明了这一原理具有普遍适用性。熵是描述系统状态的函数,而最大熵原理则表明了系统发展变化的趋势,系统的最终状态必然是熵增加至最大值的状态,对于任何系统都是如此。因此,群体遗传系统的平衡定律可以统一用最大熵原理进行判定和描述;任意群体的基因型信息熵在随机交配世代传递时有不断增加的趋势;在一定约束条件下基因型信息熵达到最大值时,就称之为达到遗传平衡。本文将信息论原理应用于群体遗传学研究,揭示了基因信息熵的生物学意义,并表明可以用信息学和控制论的原理和方法来研究群体遗传学问题。     

洪湖鱼类多样性研究

根据１９９２～１９９３年洪湖鱼类资源调查，结合１９５９年和１９８２年的历史资料，分析了洪湖鱼类物种多样性和群落结构多样性的变化．结果表明，洪湖鱼类从江湖阻隔初期的湖泊定居性鱼类为主、江湖洄游性鱼类和少数河海洄游性鱼类亦有一定的产量、大型和中型鱼类占较大比例，逐渐演变成以鲫占绝大多数的“众小”局面；鱼类群落的营养结构从草食性种类的比例高达２３％～３５％、肉食性种类比例波动于１０％～２０％之间，逐渐演变成以鲫为主的杂食性鱼类占绝大多数，草食性种类基本上从湖内消失；种类组成从阻隔前的推测应不下１００种演变成５０余种，且实际能在洪湖生息的只有３０余种；多样性指数、均匀度指数均有不同程度的降低．     

黄顶菊凋落物分解对节肢动物群落结构的影响

选择黄顶菊(Flaveria bidentis)入侵的林地、农田、荒地、沟渠等4种生境作为调查样地, 比较黄顶菊与本地植物凋落物的分解速率及凋落物分解对节肢动物群落结构的影响。于2014年10月凋落物高峰期在各样地内分别搜集黄顶菊与本地植物的凋落物, 每种凋落物称取20 g装入尼龙网分解袋中, 放入各生境。2015年的每个月将不同生境不同处理凋落袋各取回10袋, 用Tullgren法分离节肢动物。 4种生境共捕获17,466头, 隶属8纲18目, 4种生境的优势类群皆为蜱螨目和啮目。其中, 林地、农田、荒地、沟渠4种生境处理组中节肢动物数量分别为1,698头, 1,838头, 2,631头, 3,413头, 分别比对照组高18%, 53%, 22%, 11%。多数月份黄顶菊凋落物中的节肢动物丰富度及多样性指数高于同生境对照组, 并且在黄顶菊生长盛期差异显著; 黄顶菊凋落物的分解速率高于对照植物分解速率, 且各月份凋落物分解速率动态与节肢动物数量变化动态呈显著相关。黄顶菊凋落物对节肢动物的影响与人为干扰程度有关, 这种影响在人为干扰较小的荒地与沟渠生境中更为明显。综上所述, 黄顶菊凋落物的分解改变了节肢动物群落结构, 并引起节肢动物多样性的升高。     

慢性缺氧对大鼠左右心室功能、心肌肌原纤维Ca~（2＋），Mg~（2＋）－ATP

模拟５０００ｍ中度缺氧时,大鼠右室功能显著加强,而左室功能加强不显著;左右心室肌原纤维Ｃａ２＋,Ｍｇ２＋－ＡＴＰ酶活性下降,肌球蛋白同功酶Ｖ２和Ｖ３百分含量增加,Ｖ１百分含量减少。８０００ｍ重度缺氧时,右室功能减弱,但无统计学意义,左室功能减弱有显著性;ＡＴＰ酶活性和同功酶的变化超过５０００ｍ组。此外,右室ＡＴＰ酶活性与ＰＡＰ呈反比且有显著性,左室ＡＴＰ酶活性与ＣＡＳＰ虽也呈反比但无显著性;右室同功酶Ｖ３百分含量与ＰＡＰ呈正比,左室同功酶Ｖ３百分含量与ＣＡＳＰ不呈比例。上述结果表明,因短期突发严重缺氧引起的心肌供氧不足对左心室心肌的直接损伤作用大于右心室心肌。     

缺氧心肌收缩蛋白Ca~（2＋），Mg~（2＋）－ATP酶活性研究

将大鼠置于模拟海拔８ｋｍ高度的低压舱内缺氧１周及缺氧后空气中常氧恢复１周和２周,观察了左右心室功能、心肌肥厚、心肌收缩蛋白含量及其Ｃａ￣（２＋）,Ｍｇ￣（２＋）－ＡＴＰ酶活性的动态变化。结果表明,８ｋｍ缺氧１周后肺动脉压及右心室收缩压明显升高,左右心室±ｄｐ／ｄｔｍａｘ及收缩指数明显降低。左右心室肌明显肥厚,心肌收缩蛋白Ｃａ￣（２＋）,Ｍｇ￣（２＋）－ＡＴＰ酶活性明显减低。缺氧后常氧恢复１和２周后,左右心室功能逐渐恢复达到或接近正常水平,心肌肥厚逐渐减轻或恢复正常,心肌收缩蛋白Ｃａ￣（２＋）,Ｍｇ￣（２＋）－ＡＴＰ酶活性也逐渐升高。因此说明：心肌收缩蛋白Ｃａ￣（２＋）,Ｍｇ￣（２＋）－ＡＴＰ酶活性的改变是心功能变化的重要生化基础之一,它的减低是缺氧心肌对环境的代偿适应。     

慢性缺氧大鼠心肌肌浆网功能及其钙泵基因表达的动态变化

将实验大鼠放置模拟５０００ｍ海拔高度低压舱内１、２和４周。结果表明：与对照组比较,１,２和４周组动物的心肌重量分别增加１５％,１８％和５７％;心肌ＳＲＣａ２＋摄取分别降低３３％,３８％和５３％;心肌ＳＲＣａ２＋ＡＴＰａｓｅ活性分别降低５４％,６０％和７４％;钙泵ｍＲＮＡ含量（基因表达分别降低１４％,４６％和６８％。这些结果提示,缺氧导致的ＳＲ钙泵功能降低可能是心肌功能受损的重要生化基础之一,而钙泵数目减少可能是钙泵功能降低的分子生物学机制。