焦磷酸测序测定SNP的常见问题与解决方法

目的:探讨焦磷酸测序技术对单核苷酸多态性分型因测序图谱中存在的一些典型问题而导致分型结果不准确的解决方法。方法:以VKORC1基因1639 GA位点、CYP2C19基因636 GA位点及UGT1A1基因TA重复序列(TA)6(TA)7的多态性检测为例,分别采用优化PCR条件、改变测序时dNTP的加入顺序以及设立外标校正的方法来解决上述问题,从而提高焦测序对SNP分型的准确性。结果:通过升高PCR退火温度,可以显著提高VKORC1基因的扩增特异性,降低了测序图谱中非特异性信号峰强度;通过优化测序时dNTP的加入顺序,CYP2C19基因636 GA位点的准确分型结果可通过观察测序图谱中相关信号峰的有无而简单获得,避免了比较信号峰的相对强度;通过比较待测样本与已知基因型的外标样本的测序图谱来确定待测样本的基因型,提高了对UGT1A1基因TA重复序列(TA)6(TA)7多态性的分型准确性。结论:本文针对焦测序在测定SNP时的常见问题所提出的相应解决方法不仅简单、经济有效,而且在临床应用方面具有可靠性。     

药剂处理对早稻田害虫天敌群落的影响

研究了三唑磷、杀虫双、阿维菌素和Bt+吡虫啉4种药剂处理对安徽江淮地区早稻田害虫 天敌群落的影响.结果表明,4种药剂处理对主要害虫的种群增长均有显著控制作用.三唑磷对群落多样性影响最大,其次是杀虫双和阿维菌素,其各处理区群落多样性平均值分别为1.545、1.562和1.691,均显著低于空白对照区（群落多样性平均值为1.897）;Bt+吡虫啉处理区群落多样性平均值为1.915,较空白对照区有所提高.药剂处理2周后,杀虫双处理区与阿维菌素处理区的群落组成最相似,三唑磷处理区与Bt+吡虫啉处理区最不相似.从群落稳定性和害虫可持续控制的角度看,4种药剂处理中以Bt+吡虫啉最优,而杀虫双和阿维菌素又稍优于三唑磷.     

利用蚕豆根尖微核技术监测韶关市区河段水质的研究

利用蚕豆根尖细胞微核技术监测韶关市区河段水质污染状况,测定6个断面水样的蚕豆根尖细胞微核千分率(MCN‰)及污染指数(PI),并进行F检验。结果表明,各断面水样均能引起微核率升高,孟洲坝、曲江桥、武江桥、高桥、长坝和十里亭断面的微核率分别为10.73‰、7.94‰、5.98‰、5.85‰、5.78‰、4.45‰,PI分别为3.04、2.25、1.69、1.66、1.64、1.26。按照污染指数划分标准,十里亭断面基本没有污染,武江桥、高桥和长坝断面均为轻度污染,孟洲坝和曲江桥断面属于中度污染。表明除十里亭断面外,其余各断面均有不同程度的污染。     

烟蚜及其捕食性天敌草间小黑蛛种群空间结构分析

采用地统计学原理和方法,拟合了不同时期烟蚜种群及其捕食性天敌草间小黑蛛种群的空间结构模型,分析了其空间关系．结果表明,不同时期烟蚜种群的空间结构模型均为球型,空间格局呈聚集型分布,空间相关距离在2．0252～4．1495m之间,异质系数为10281．36～300216．30,空间依赖程度为12176．81～303433．70;不同时期草间小黑蛛种群的空间结构模型也均为球型,空间格局呈聚集型分布,空间相关距离在3．7328～4．8983m之间,异质系数为1．4482～4．4134,空间依赖程度为1．6941～5．8167．该结果和方法可用于监测烟田目标害虫的时空格局动态．     

感病与抗病圭亚那柱花草遗传多样性的AFLP分析

圭亚那柱花草(Stylosanthes guianensts Swartz)原产中南美洲及非洲,是一种重要的热带豆科牧草,已在我国华南热带、南亚热带地区种植并利用.由胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides(Penz.)Sacc.)引起的炭疽病是柱花草的主要病害.采用扩增片段长度多态性(AFLP)技术分析了42个圭亚那柱花草品系的遗传多样性,同时对其抗病性进行了接种鉴定.从96个选择性引物对中筛选出较好的4个,分别对42个圭亚耶柱花草品系进行扩增,共获得出225条带,其中多态性带215条,平均多态性水平为95.5%,表现出高度的多态性.采用NTSYS-pc软件计算了品系间的遗传相似系数,其变化范围为0.31～0.95.根据非加权成对平均数法(uPGMA)进行聚类分析,建立了42个品系的聚类树系图,以所有品系的平均遗传相似系数0.48为阈值,共分为5类.主成分分析表明:第一主成分和第二主成分对全部品系间遗传变异的贡献率分别为56.04%和6.40%,并建立了品系间相互关系的二维图,各品系在二维图中的分布与UPGMA分类相吻合.抗病性鉴定结果表明:各品系对两种典型的病原菌的抗性有差异,其中抗病品系对两种病原菌的抗病相关系数达到0.904,表明抗病品系对两种病原菌有共同抗性.此外,抗病品系在UPGMA聚类中呈随机分布.这些结果表明,AFLP技术是分析圭亚那柱花草遗传多样性的有效方法.     

柑桔始叶螨与柑桔全爪螨染色体制备方法与核型探讨

采用一种新的染色体制备方法,成功地制备和观察了柑桔始叶螨和柑桔全爪螨的中期染色体。柑桔始叶螨的核型n=4、2n=8,柑桔全爪螨的核型n=3、2n=6或n=4、2n=8。C显带与扫描电镜结果显示,柑桔始叶螨与柑桔全爪螨为全着丝粒染色体,并存在混倍性现象。     

土壤水分胁迫与遮荫对生姜生长特性的影响

水分胁迫使生姜叶片叶绿素含量降低,叶片气孔密度及气孔面积减小,根系活力下降。根系伤流量减少,在相同土壤水分条件下,遮光使叶片叶绿素含量增加。气孔密度减小,叶片上表皮气孔变大,而下表皮气孔变小。根系活力增强,水分胁迫显著影响生姜的生长与产量,但不同水分条件下,光强对生姜生长与产量的影响不同,正常供水条件下,生姜在自然光照条件下生长较好,产量较高;水分胁迫条件下,生姜在遮荫条件下生长较好,产量较高。     

黄山松的分类学研究

通过形态解剖学到分子生物学的对比实验。研究结果表明黄山松(Pinus hwangshanensis Hsia)和台湾松(Pinus taiwanensis Hay ate)两者在形态上虽然有相似之处;但染色体特征不同,随机扩增DNA多态性分析(RAPD分析)显示两者的遗传距离很远,甚至大于黄山松和马尾松之间的遗传距离。结论是台湾松和黄山松决非同一种系,应恢复黄山松(Pinus hwangshanensis Hsia)的合法性。     

不同二氧化碳浓度条件下红松和长白赤松幼苗根际土壤微生物数量研究

以连续5年不同CO₂浓度(开顶箱700μmol·mol^-1、500μmol·mol^-1、对照箱和裸地)处理的长白赤松和红松幼苗为研究对象,在2003年7～9月分别对幼苗根际土壤细菌、真菌、放线菌数量进行比较研究.结果表明,高浓度CO₂处理对长白赤松幼苗根际土壤细菌数量起显著的(P≤0.001)促进作用,对根际真菌和放线菌数量的促进作用却不明显;对红松来说,除8月份700μmol·mol^-1CO₂处理和7月份500μmol·mol^-1CO₂处理之外,在各月份中受高浓度CO₂处理的根际土壤细菌数量均较对照箱和裸地显著增多(P≤0.001),而根际土壤真菌数量变化除9月份(P≤0.001)外均不明显,放线菌数量受高浓度CO₂的影响亦不明显.