BDCGrid:基于Globus的生物信息高性能计算网格系统

随着分子生物信息数据量高速增长,生物信息学面临着大规模、高通量、密集型计算的巨大挑战。为有效利用计算机资源,缩短高通量生物信息计算程序执行时间,我们基于Globus Toolkit网格中间件,实现了一个支持高通量生物数据计算的网格系统(Biological Data Computing Grid,简称BDCGrid)。BDCGrid计算网格系统模型可以有效整合中小型生物信息学实验室计算机资源,大大缩短高通量生物信息计算程序执行时间,为相关研究人员利用现有计算机资源处理大规模、高通量生物信息计算任务提供一种新的途径。     

青海曲麻莱-治多地区巴颜喀拉山群(上三叠统)遗迹化石

首次对青海南部曲麻莱-治多地区巴颜喀拉山群上部(上三叠统)遗迹化石进行了系统采集,共采获遗迹化石33属54种。据遗迹化石的形态、习性、水深等环境成因特征,可划分为两类组合:一类以Cosmorhaphe,Helminthopsis,Helminthoida,Megagrapton,Paleodictyon等为主,产生于浊流事件前;另一类以Chondrites,Neo-nereites,Palaeophycus,Phycosiphon,Planolites,Zoophycos等为主,产生于浊流事件后,两者均为半深海-深海Nereites遗迹相的典型代表,反映晚三叠世研究区应为浊流沉积发育的复理石相沉积。     

瑞丽莫里热带雨林种子植物区系的初步研究

初步分析了鲜为人知的滇西南瑞丽莫里的热带雨林植物区系组成与地理成分。该植物区系中热带和主产热带的科占总科数的80%以上,热带分布属占总属数的84.1%;典型热带分布种占总种数的82.1%,该区系在科、属和种水平上均以热带成分占优势,明显属于热带性质的植物区系。在其热带分布属中,又以热带亚洲分布属最多,占总属数的26.5%;典型热带分布种中也以热带亚洲分布及其变型的种占绝对优势,占总种数的72.9%,反映了该植物区系具有热带亚洲植物区系的性质特点。在其热带亚洲成分中,又具体以南亚—大陆东南亚成分比例最高,反映了滇西南的热带雨林植物区系由于地域邻接关系,受印度(喜马拉雅)—缅甸植物区系的强烈影响。     

树叶凋落物在受酸性矿山废水污染溪流中的分解

为了解华南地区酸性矿山废水对溪流中树叶分解的影响,在广东省大宝山矿区附近的1条受酸性矿山废水污染（pH值为2．7—3．4且富含多种重金属元素）的3级溪流中,利用2种孔径（5ram的网袋和0．1ram的布袋）的分解网袋对2种树叶（人面子和蒲桃）进行了为期101d的树叶分解研究。结果表明,人面子树叶网袋和布袋中的树叶干重剩余率分别为39％和48％,而蒲桃树叶网袋和布袋中的干重剩余率仍保持较高的水平,分别为61％和70％。根据指数衰减模型计算出树叶分解的半衰期,人面子树叶在网袋和布袋中的分解半衰期分别为57d和69d,而蒲桃树叶则分别为14-4d和217d。蒲桃树叶的分解速率明显比人面子树叶慢。在网袋中定殖的底栖动物主要是集食者,其中优势类群为摇蚊幼虫,占底栖动物个体总数的99％。摇蚊种群在网袋中的数量波动对2种树叶分解速率的影响并不明显。结果表明,受酸性矿山废水的影响,底栖动物群落的多样性大为减少。同时由于各种金属氧化物在树叶表面的不断沉淀,使树叶处于缺氧状态,抑制了微生物的活动,导致树叶分解速率大为降低。     

玉米茎秆抗倒伏的力学机制研究

建立了玉米茎秆的力学模型,给出了玉米茎秆抗倒伏的各种性质参数的关系式,为玉米抗倒品种的选育提供了理论基础。     

悬铃木属植物果皮毛性状及其对小鼠肺部的致炎作用

观察了3种悬铃木聚合果的形态、坚果形态、聚合果上坚果数量、坚果上果皮毛数量、聚合果总果皮毛数量,比较了3种悬铃木聚合果的形态学差异,发现二球悬铃木的聚合果最大,聚合果上的坚果数量与坚果的果皮毛数量最多;采用石蜡切片染色观察和NaOH处理证明悬铃木果皮毛主要有果胶质、纤维素和木质素3种主要成分;通过用不同浓度粒级符合PM10大小的果皮毛对小白鼠进行支气管染毒试验,证明染毒后小鼠肺泡灌洗液中磷酸还原酶(ACP)含量升高,显示肺细胞受损;GSH-Px含量下降,显示小鼠肺部氧化和抗氧化系统失衡.试验结果证明,悬铃木果皮毛破碎后所形成的可吸入颗粒物PM10对小鼠的呼吸道具有致炎作用.     

栓皮栎体细胞胚胎发生的细胞组织学观察

以栓皮栎未成熟合子胚为外植体,在添加0.25mg/L 2,4-D和0.5mg/L 6-BA的MS培养基上6周可诱导产生2种类型的胚性愈伤组织,一种表面具光泽、白色;另一种表面光滑湿润具光泽,色泽淡黄或无色透明。组织切片表明,胚性愈伤组织的细胞体积小,细胞核大,细胞质浓,细胞排列紧密;非胚性愈伤组织细胞的体积大,细胞核小,细胞质稀薄。胚性细胞团培养在不含激素的培养基上可诱导产生体细胞胚。体细胞胚直接起源于胚性细胞团表皮或近表皮的单细胞,经历与合子胚相似的球形胚、心形胚、鱼雷胚和子叶胚发育阶段。所有发育时期的体细胞胚的胚轴、子叶均产生次生体胚,它们起源于细胞质较浓的表皮单细胞。     

一多重耐药单增李斯特菌株的生长特性及毒力分析

为了解单增李斯特菌株耐药后可能发生的生物学变化,以哈市生肉中分离到的1株对17种抗生素耐受的单增李斯特菌株L.M.B8为研究对象,对其生长及毒力特性进行研究。结果显示,L.M.B8的生长及毒力特性均与标准菌株有明显差异。在NaC l浓度为0.5%~5%、pH值为4.0~10.0及温度为20~45℃范围内,L.M.B8的生长速度均明显高于标准菌株。L.M.B8对高浓度盐的敏感性高于标准菌株,且对温度的适应能力强于标准菌株。从生长曲线看,L.M.B8的对数生长期与稳定期均较标准菌株提前2~3 h,且其稳定期较标准菌株明显缩短。L.M.B8小鼠腹腔注射半数致死量（LD50）较标准菌株明显降低。该研究为进一步探讨单增李斯特菌的耐药性与其他生物学特性的相关性奠定基础。     

哈密天山北路墓地出土颅骨的测量性状

本文是对出土于新疆哈密地区天山北路青铜时代墓地颅骨测量性状的研究。文中公布了24例天山北路墓地古代人群77项颅骨测量性状基本数据, 在此基础上, 对男、女两性的测量性状特点进行了统计分析, 并结合考古学文化研究和分子生物学研究的相关结论对实验结果进行了讨论和推论。主要研究结论如下: 一是该人群虽已经形成了具有自身特点的、共性的体质特征, 但人群内部也存在些许差异, 尤其是在男性个体数据之中。二是该人群是由分别具有东、西方体质特征的祖先人群混杂融合而成, 是处于当时大人种分布过渡地带的过渡人群。