眼镜王蛇泛素融合蛋白基因和核糖体蛋白L30基因的克隆及分析

从广西产眼镜王蛇（Ophiophagus hannah）毒腺中抽提总RNA,经mRNA纯化后构建眼镜王蛇毒腺cDNA文库。从所构建的cDNA文库中,随机筛选200个克隆测序,得到两个在进化上高度保守的基因：泛素融合蛋白基因（GenBank登录号为AF297036）和核糖体蛋白L30基因（GenBank登录号是AF297033）。前者cDNA的开放阅读框为387bp,后者为348bp。前者编码128个氨基酸残基组成的泛素融合蛋白前体;后者编码115个氨基酸残基组成的核糖体蛋白L30前体。由cDNA序列推导出的氨基酸序列分析表明,泛素融合蛋白前体包括N-末端的泛素结构域（76个氨基酸残基）和C-末端的核糖体蛋白L40结构域（52个氨基酸残基）。该蛋白为一高碱性蛋白,C末端含有一个“锌指”模式结构。与16个物种比较的结果表明,眼镜王蛇与脊椎动物的泛素融合蛋白氨基酸序列相似度较高,具有高度的保守性。     

全球变化背景下生态学热点问题研究——第二届"国际青年生态学者论坛"

为促进中国青年生态学者与海外生态学者的交流与合作,第二届"国际青年生态学者论坛"于2011年8月1—4日在南京大学举行。来自海内外近400名学生和青年学者,围绕"全球变化背景下生态学热点问题"主题,分别从植物群落学、植物生理生态学、地下生态学、水生态系统、生物入侵、生物多样性、区域生态安全等7个方面进行了交流与讨论,本届论坛报告反映了在全球变化背景下,我国生态学在研究领域、内容、尺度、方法上的发展现状与进展。以会议收集的95篇摘要为基础,重点综述了27场青年学者论坛报告内容,并对会议的进一步完善提出了几点建议。     

黄土塬区不同土地利用方式土壤水分消耗与补给变化特征

对黄土塬区不同土地利用方式下2012年3—10月7龄果园(挂果初期)、17龄果园(盛果期)、小麦地、玉米地土壤水文状况进行分析,结果显示,0—600 cm试验土层7龄果园土壤贮水量最高,其次为玉米地、小麦地,17龄果园最低,且不同土地利用方式下贮水量随着降水量的变化而上下波动,但其变化滞后于降水。不同土地利用方式均表现为随土壤深度增加土壤含水量变异程度减弱的特征,且其土壤剖面的水分含量变化存在季节变异。农田和7龄果园中不存在土壤干燥化现象,而17龄果园土壤剖面存在较厚的干燥化土层,其分布深度为320—600 cm。不同的土地利用方式的土壤水分的消耗和补充深度有较大差异,17龄果园消耗深度为500 cm,补充深度为200 cm;7龄果园、玉米地和小麦地消耗深度分别为200、300 cm和300 cm,且补充深度均超过了测定的土壤深度,大于600 cm。     

脂蛋白(a)的赖氨酸结合异质性对人动脉SMC增殖的影响

为探讨脂蛋白 ( a) [Lp( a) ]的赖氨酸结合功能在致动脉粥样硬化中的作用 ,利用短时超速离心结合凝胶层析分离纯化 Lp( a) ,以 Lysine- Sepharose4B亲和层析分离出能与柱结合的 Lp( a)Lys+ 和不能与柱结合的 Lp( a) Lys-.采用 MTT比色法、流式细胞仪分析细胞增殖状况 ,同时以ELISA法检测细胞培养液中转化生长因子β( TGF-β)的活化水平 ,观察了两种 Lp( a)对培养的人动脉平滑肌细胞 ( SMC)增殖的影响 .结果表明 :Lp( a)、Lp( a) Lys+ 较 Lp( a) Lys-能有效地促进SMC增殖 ,刺激细胞从 G0 /G1期进入 S和 G2 /M期 ,并显著降低培养液中 TGF- β活化量 .提示 :Lp( a) Lys+ 可能是 Lp( a)促人 SMC增殖的主要组分 ,其机制可能与干扰纤溶酶原活化 ,从而抑制TGF-β活化有关 .     

基于质谱技术筛选差异表达蛋白的统计学策略研究进展

随着质谱技术的快速发展,蛋白质组学已成为继基因组学、转录组学之后的又一研究热点,寻找可靠的差异表达蛋白对于生物标记物的发现至关重要.因此,如何准确、灵敏地筛选出差异蛋白已成为基于质谱的定量蛋白质组学的主要研究内容之一.目前,针对该问题的研究方法众多,但这些方法策略的适用范围不尽相同.总体来说,基于质谱技术筛选差异蛋白的统计学策略可以分为3类:基于经典统计学派的策略、基于贝叶斯学派的统计检验策略和其他策略,这3类方法有各自的应用范围、特点及不足.此外,筛选过程还将产生部分假阳性结果,可以采用其他方法对差异表达蛋白的质量进行控制,以提高统计检验结果的可靠性.     

Protein kinase C delta null mice exhibit structural alterations in articular surface,intra-articular and subchondral compartments

IntroductionStructural alterations in intra-articular and subchondral compartments are hallmarks of osteoarthritis, a degenerative disease that causes pain and disability in the aging population. Protein kinase C delta (PKC-δ) plays versatile functions in cell growth and differentiation, but its role in the articular cartilage and subchondral bone is not known.MethodsHistological analysis including alcian blue, safranin O staining and fluorochrome labeling were used to reveal structural alterations at the articular cartilage surface and bone–cartilage interface in PKC-δ knockout (KO) mice. The morphology and organization of chondrocytes were studied using confocal microscopy. Glycosaminoglycan content was studied by micromass culture of chondrocytes of PKC-δ KO mice.ResultsWe uncovered atypical structural demarcation between articular cartilage and subchondral bone of PKC-δ KO mice. Histology analyses revealed a thickening of the articular cartilage and calcified bone–cartilage interface, and decreased safranin O staining accompanied by an increase in the number of hypertrophic chondrocytes in the articular cartilage of PKC-δ KO mice. Interestingly, loss of demarcation between articular cartilage and bone was concomitant with irregular chondrocyte morphology and arrangement. Consistently, in vivo calcein labeling assay showed an increased intensity of calcein labeling in the interface of the growth plate and metaphysis in PKC-δ KO mice. Furthermore, in vitro culture of chondrocyte micromass showed a decreased alcian blue staining of chondrocyte micromass in the PKC-δ KO mice, indicative of a reduced level of glycosaminoglycan production.ConclusionsOur data imply a role for PKC-δ in the osteochondral plasticity of the interface between articular cartilage and the osteochondral junction.

Electronic supplementary material

The online version of this article (doi:10.1186/s13075-015-0720-4) contains supplementary material, which is available to authorized users.     

影响正常口腔念珠菌检出率的方法学研究

目的:研究不同检测方法对正常口腔念珠菌检出率的影响,寻找一种比较简便可靠的检测方法.方法:以健康的平均年龄7.4岁的儿童为检测人群,比较不同的取样部位,取样方法,检测方法,被检人群口腔中白色念珠菌以及其他念珠菌的检出率.结果:取样和检测方法对检出率有不同程度的影响,PCR检测方法的检出率显著高于培养法.结论:黏膜拭子加离心,和CHROMagar CandidaTM鉴定培养基相结合的方法是一种简便理想的分离培养方法,PCR方法则敏感度更高.     

Intein-mediated rapid purification of recombinant human pituitary adenylate cyclase activating polypeptide

In order to obtain the recombinant human PACAP efficiently by intein-mediated single column purification, a gene encoding human PACAP was synthesized and cloned into Escherichia coli expression vector pKYB. The recombinant vector pKY-PAC was transferred into E. coli ER2566 cells and the target protein was over-expressed as     

人工抚育措施对油松林生长及结构特征的影响

研究了人工抚育年后油松林的生长状况、群落组织和结构.结果表明,不同人工抚育措施的油松林平均胸径、树高、冠幅均有极显著差异(P＜0.01),采取抚育措施的两个样地间的油松胸径和冠幅差异均达到显著水平,其中既打枝又间伐的油松林的胸径(7.8±0.29cm)、树高(5.5±0.09m)和平均冠幅(249±7.24cm)最大,未打枝和间伐的油松林最大;随着人工抚育措施加强,单株油松的平均新叶、老叶和枝的生物量逐渐增加,达到极显著水平(P＜0.01);在不同抚育措施下,既打枝又间伐的油松林地上生物量最大(44.0t·hm^-2)、未打枝和间伐油松林地上生物量最大(14.9t·hm^-2);油松新叶和老叶长度的差异性显著;油松的比叶面积在生长初期(5月和月)和末期(9月)差异性显著;人工抚育措施增加了林下植被的种类数量和盖度.